Proteínas Estructura y función Estructura tridimencional Comportamiento en solución

Distribución de la regiones hidrofílicas en una proteína globular No-polares Polares

Dominios

Estructura cuaternaria Asociación de dos o más cadena polipeptídicas para formar una unidad completa. Estructura cuaternaria de la hemoglobina

F1-F0-ATPasa Dominio versus subunidad

Proteínas fibrosas vs globulares Globulares Fibrosas 1. Estructura compacta Estructura extendida 2. Solubles en agua o lípidos Insoluble en agua o lípidos 3. Estructura secundaria compleja Estructura secundaria simple mezcla de a-hélice, b-plegadas un sólo tipo 4. Estructura cuaternaria estabilizada Estructura cuaternaria estabilizada por interacciones no covalentes enlaces covalentes

Proteínas fibrosas a-Keratina permanentes Ejemplo de estructura cuaternaria left-handed supertwisted coiled coil permanentes Disulfide (-S-S-) bonds stabilize the quarternary structure

Colágeno Alto contenido en gly y aminoácidos modificados (Gly-X-Y) - hidroxiprolina - hidroxilisina

¿Qué importancia tiene la conformación de una proteína? Las diez enzimas de la glicólisis

Enfermedades producidas por mal plegamiento

Priones Comparison of the three-dimensional structures of the normal prion protein (A) with a model of the pathological form (B).

¿Se puede predicir la estructura de una proteína? If the sequence holds the secrets of folding, can we figure it out? Modelo predictivo de Chou-Fasman: a cada aminoácido se le asigna la tendencia a formar estructura secundaria

Mecanismo de plegamiento de las proteínas ¿Qué conformación tendría esta proteína? Ejemplo: si tiene 100 aminoácidos con dos orientaciones espaciales, la proteína podría adoptar 1030 conformaciones posibles.

¿Se puede predicir la estructura de una proteína? KQFTKCELSQNLYDIDGYGRIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENDESTEYGLFQISNALWCKSSQSPQSRNICDITCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWIAHKALCTEKLEQWLCEKE KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL Similaridad de secuencias Homología 8lyz 1alc Uso como modelo

Protein DataBank (PDB) Repository of models of tertiary structure Some single folds NMR: 7,400 X-ray: 58,000

Resumen La función de una proteína está dada por su estructura Diferente secuencia  diferente estructura La predicción de la estructura secundaria es dífícil, la predicción de la estructura terciaria es imposible

Solubilidad de las proteínas pH Constante dieléctrica del solvente Fuerza iónica Temperatura

Efecto del pH en la solubilidad de las proteínas

Constantes dieléctricas y momento dipolar de algunos solventes comunes

Solubilidad de la carboxi-Hb a diferentes fuerza iónicas Efecto de la fuerza iónica en la solubilidad de las proteínas Salting in Salting out Solubilidad de la carboxi-Hb a diferentes fuerza iónicas

Desnaturación de proteínas Urea