PÉPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO Los péptidos se forman por la unión de los aminoácidos mediante enlaces covalentes de tipo amida llamados enlaces peptídicos Enlace peptídico OLIGOPÉPTIDOS (<20 aa) POLIPÉPTIDOS (20-50 aa) PROTEÍNAS (>50 aa)

BLOQUEO DE GRUPOS AMINO Y CARBOXILO TERMINALES N-TERMINALES C-TERMINALES aa-NH-C=O H aa-C=O NH2 N-formil amida aa-NH-C=O CH3 N-acetil

FORMACIÓN DEL DIPÉPTIDO GLICILALANINA Glicina Alanina N-terminal C-terminal Enlace peptídico Plano del grupo amino Agua Glicilalanina “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

ESTRUCTURA DEL ENLACE PEPTÍDICO El enlace peptídico tiene algunas propiedades muy importantes para la estructura de las proteínas Más rígido y corto que un enlace C-N simple Los átomos que participan (O, C, N, H) son coplanares El grupo de átomos alrededor del enlace peptídico puede darse en dos configuraciones posibles: trans y cis Caracter parcial de doble enlace: Se le puede considerar un híbrido de resonancia No se permite giro alrededor del enlace -C-N-

Carácter parcial de doble enlace Átomos coplanares Carácter parcial de doble enlace “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

CONFORMACIONES POSIBLES

TETRAPÉPTIDO

ESTABILIDAD Y FORMACIÓN DEL ENLACE PEPTÍDICO G=10 KJ/mol Enlace peptídico La reacción sin catalizar es muy lenta EN LA CÉLULA: la formación del enlace peptídico está acoplado a la hidrólisis de ATP Aa + tRNA Aminoacil-tRNA ATP AMP + PPi 2 Pi

HIDRÓLISIS DE LOS ENLACES PEPTÍDICOS Calentando a ebullición (110ºC) en medio ácido (HCl 6M) o base fuerte Hidrólisis específica Química: BrC=N (-Met-CO-) Enzimática (Proteasas): Tripsina (-Arg -CO-, -Lys-CO-) Quimotripsina (-aa hidrófobos-CO-) Carboxipeptidasa A (libera el aa C-terminal) Todas estas enzimas son muy útiles en investigación bioquímica para la fragmentación controlada de polipéptidos

POLIPÉPTIDOS COMO POLIANFÓLITOS EQUILIBRIOS DE IONIZACIÓN PUNTO ISOELÉCTRICO

PÉPTIDOS CON ACTIVIDAD BIOLÓGICA HORMONAS: Insulina y glucagón (metab. de la glucosa) ANTIBIÓTICOS: Gramicidina S VENENOS: a-amanitina NEUROPÉPTIDOS: Encefalinas ANTIOXIDANTE: Glutation (g-glutamil-cisteinil-glicina) Conjugación con xenobióticos Paso de aa a través de la membrana plasmática

L-Leu D-Phe L-Orn L-Pro L-Pro L-Val D-Phe L-Orn L-Leu Gramicidina S INSULINA Tyr-Gly-Gly-Phe-Met Met-encefalina Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu Leu-encefalina GLUTATION