Clasificación de aa
Metilaciones: se producen sobre el N de las cadenas laterales: histidina y lisina. Estos aminoácidos metilados son frecuentes en las proteínas musculares. Acetilación: también se produce en el grupo amino, y es frecuente en el caso de la lisina. Es importante la acetil-lisina en el caso de las histonas Hidroxilación: esta modificación es más frecuente en la prolina, en las posiciones 3 y 4. Fosforilación: Aquí se une un grupo fosfato mediante enlace éster a un grupo OH de la cadena lateral de aminoácidos. serina, teronina y tirosina. Ciclación: la más común es la que se produce entre el grupo amino y el COOH de la cadena lateral del ácido glutámico. El resultante es el ácido piroglutámico, presente en el inicio de proteínas protectoras
Péptidos y proteínas Los péptidos son cadenas de aminoácidos. OLIGOPÉPTIDOS (<20 aa) POLIPÉPTIDOS (20-50 aa) PROTEÍNAS (>50 aa)
Más rígido y corto que un enlace C-N simple Los átomos que participan (O, C, N, H) son coplanares trans y cis El grupo de átomos alrededor del enlace peptídico puede darse en dos configuraciones posibles: trans y cis Caracter parcial de doble enlace: Se le puede considerar un híbrido de resonancia No se permite giro alrededor del enlace -C-N-
SIMPLES O CONJUGADAS. LAS PROTEINAS SE CLASIFICAN COMO SIMPLES O CONJUGADAS. LAS PROTEINAS CONJUGADAS TIENEN UNA PORCION NO- PROTEICA LLAMADA GRUPO PROSTETICO. LIPIDOS AZUCARES METALES DERIVADOS DE VITAMINAS
Estudio de proteínas. La purificación de proteínas es un primer paso esencial en el conocimiento de su función. Las secuencias de aminoácidos se pueden determinar por degradación de Edman automatizada. Los péptidos se pueden sintetizar por métodos automatizados en fase sólida. La inmunología proporciona técnicas importantes para la investigación sobre las proteínas. La estructura tridimensional de las proteínas se puede determinar por espectroscopía de NMR y cristalografía de rayos X.
Purificación de proteínas Solubilidad: - Muchas proteínas son menos solubles a concentraciones elevadas de sal (sulfato amónico 0.8 M). - La precipitación se usa para concentrar proteínas. - La sal se elimina por diálisis.
CROMATOGRAFIA DE COLUMNA 1.INTERCAMBIO DE IONES. 2.EXCLUSIÓN MOLECULAR. 3.AFINIDAD. 4.HPLC.
Electroforesis en gel