Aminoácidos Aminoácidos Estructura y Propiedades Enlace Peptídico UNIVERSIDAD PERUANA CAYETANO HEREDIA Departamento de Bioquímica, Biología Molecular & Farmacología Curso Bioquímica 2008 Aminoácidos Aminoácidos Estructura y Propiedades Enlace Peptídico Péptidos
ESTRUCTURA QUIMICA Grupo Carboxilo Carbono Quiral Residuo Grupo Amino
ESTRUCTURA QUIMICA Carbono Quiral
CHO COO- HO C H H3N+ C H CH2OH R COO- H3N+ C H CH3 L-Amino ácido L-Gliceraldehído COO- H3N+ C H CH3 L-Alanina (Gly, G)
Estereoisomerismo en aminoácidos
Estereoisomerismo en aminoácidos
Estereoisomerismo en aminoácidos
FORMACION DE PUENTES DISULFURO
Aminoacidos: Absorcion de luz Espectrofotometro Ley de Lambert y Beer Log = ecl Io I c = concentración l = longitud e = coeficiente de extinción molar Absorbancia
ESPECTRO DE ABSORCION EN EL RANGO UV
Aminoacidos no comunes Miosina Elastina Colageno Protrombina
L-selenocisteina No se incorpora por una modificacion post-traduccion tRNA codificado por UGA. Glutation Peroxidasa, tetraiodotironina 5´ deiiodinasa, tioredoxin reductasas
Ciclo de la urea Sintesis de Arginina
Propiedades Acido-Base
Propiedades Acido-Base Aminoácidos son Acidos Polipróticos Débiles H2A+ + H2O HA0 + H+ COOH-CH-R-NH3++ H2O -COO-CH-R-NH3+ + H+ COOH-CH-R-NH3+ = H2A+ Ka1 = [ HA0 ] [ H+ ] [-COO-CH-R-NH3+ ] [ H+ ] __________ = ____________________ [H2A+ ] [COOH-CH-R-NH3+ ]
Propiedades Acido-Base La segunda disociación ( grupo amino): HA0 + H2O A¯ + H+ COO--CH-R-NH3+ + H2OCOO--CH-R-NH2 + H+ Ka2 = [ A¯ ] [ H+ ] __________ [ HA0 ] Ka2 = [ COO¯ ] [ H+ ] ________________ [ COO-CH-R-NH3+ ]
El oxígeno carbonílico (C=O) tiene una carga parcial negativa El nitrógeno amídico (NH) tiene una carga parcial positiva → se establece pequeño dipolo eléctrico Enlace peptídico tiene naturaleza parcial de enlace doble, → es menos flexible que un covalente simple convencional Todos los enlaces peptídicos en proteínas ocurren en trans
Ψ: Cα C gtupo carboxilo Φ : Cα y grupo amino
C-term N-term