CARBOXIPEPTIDASA P.M.; 34,300; 1 Zn++. Esta enzima está localizada en el páncreas de los mamíferos, cataliza la hidrólisis del péptido unido al final carboxílico de la cadena peptídica.
La enzima tiene una preferencia particular por aquellos sustratos en los que la cadena lateral R es aromática, es decir ‑CH2 (C6 H5) , o bien, ‑CH2 (C6 H4) OH.
Su estructura y mecanismo de acción se han dilucidado parcialmente Su estructura y mecanismo de acción se han dilucidado parcialmente. El ion zinc está enlazado, en un entorno tetraédrico distorsionado, con dos átomos de nitrógeno‑histidina, un átomo de oxígeno carboxílico glutamato y una molécula de agua como ligandos.
Por mecanismo de sitio activo Las Carboxipeptidasas generalmente se clasifican en una de varias familias en función de su mecanismo de centro activo. Las enzimas que utilizan un metal en el sitio activo se llaman "metalo-carboxipeptidasas".
Otros carboxipeptidasas que usan sitio activo serina se llaman "serina carboxipeptidasas". Los que utilizan una cisteína del sitio activo son llamados "carboxipeptidasa cisteína".
Otro sistema de clasificación para las carboxipeptidasas se refiere a su preferencia de sustrato. Las carboxipeptidasas que tienen una mayor preferencia por los aminoácidos que contienen cadenas de hidrocarburos aromáticos o ramificada que se llaman carboxipeptidasa A. Las carboxipeptidasas que escinden aminoácidos cargados positivamente se llaman carboxipeptidasa B.
Un metalo-carboxipeptidasa que escinde un glutamato C-terminal del péptido se llama "glutamato carboxipeptidasa". Una serina carboxipeptidasa que escinde el residuo C-terminal de péptidos que contienen la secuencia-Pro-Xaa se llama "carboxipeptidasa prolil".
Enzima proteolítico que contiene Zn++ La hidrólisis se produce más rápidamente con la aparición de cadena lateral aromática o voluminosa del lado carboxilo terminal 1 sola cadena de 307 aa Forma compacta 50x42x38 A° Regiones de hélice α (38%) Regiones de hoja plegada β (17%) Existe un ión Zn++ perfectamente unido, esencial para la actividad enzimática
El átomo de Zn++ ubicado en un surco máximo en la sup de la molécula, coordinado con 3 aa y 1H2O Un gran bolsillo lateral ADAPTACIÓN INDUCIDA (el S desplaza al agua) TENSIÓN ELECTRÓNICA
una mutación de la Tyr248 no inactiva pero aumenta el KM La unión del S induce grandes cambios en el centro activo de la E.
Tyr 248 interacciona con el carboxilato terminal (pte H) Arg 145 interacciona electrostáticamente con el carboxilato La cadena lateral de tirosina del sustrato se une al bolsillo apolar del enzima. Interacción hidrofóbica.
La CARBOXIPEPTIDASA B Contiene en este bolsillo un residuo de aspartato, y es específico para residuos de lisina y arginina. El O2 carbonílico del enlace que será roto se coordina con el Zn++
La unión del S provoca grandes cambios, cierra la cavidad y desplaza el agua. El entorno apolar del Zn++ aumenta su carga efectiva. La carboxipeptidasa A induce tensión electrónica Es una E flexible tiene mayor repertorio de conformaciones catalíticamente activas.
FIN