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Publicada porJorge Godoy Suárez Modificado hace 8 años
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Diseño de Fármacos Virtual Screening Escuela de Química
Depto. de Fisicoquímica Unidad de Química Computacional Letona R, Velázquez O.
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¿Cómo creen que se desarrollan nuevos fármacos?
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Productos Naturales con Bioactividad
Se sabía que una planta curaba Se buscaba extraer extractos Se probaba in vitro, in vivo Se elucidaba la estructura Se sintetizaba
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Screening (Tamizaje) HTS (Highg Throughput Screening) uHTS (ultra HTS)
VS (Virtual Screening)
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¿Y eso cómo funciona? ¿Cómo?
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Obtención de Datos NMR Difracción de rayos X ab initio Doblamiento
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Representación 2D 3D Coordenadas Secuencia protéica
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Cálculos / Evaluación Posing Scoring Ranking
9
Colocación (Posing) Algoritmo Genético (o Evolutivo)
Algoritmo Aleatorio Método MonteCarlo
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Evaluación (Scoring) Campos de Fuerza Semiempíricos Mecánica Cuántica
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Clasificación (Ranking)
Resultados de Energía Método Metrópolis Criterios Alternativos
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Dinámica Molecular Proceso lento Utiliza ecuaciones de Newton
Cálculo fino
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Docking Proceso rápido Utiliza alguno de los algoritmos anteriores
Cálculo moderado
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QSAR Quantitative Structure Activity Relationship
Proceso más rápido Utiliza topología y redes Predice actividad específica
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Propiedades Fisicoquímicas
La mayoría se obtienen en el momento Se utilizan diferentes principios y algoritmos Se piensa en síntesis y en propiedades ADME/T (Lipinski)
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Diseño de novo Proceso más lento de todos
Utiliza una combinación de los métodos y algoritmos anteriores Diseña nuevas moléculas de la nada o derivatizando una ya existente
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¿Con qué lo hago? ¿Cómo lo uso?
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Bibliotecas De proteínas De fármacos De moléculas en general
Libres/Comerciales
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Software Representación Mecánica Molecular Mecánica Cuántica
Dinámica Molecular Docking QSAR Automatización de procesos (pipelining) Libre/Comercial
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Literatura Artículos científicos
Revistas científicas dedicadas (solo a eso) Libros
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Hardware Cluster Grid GPU Su compu :o)
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¿Qué se puede hacer con ello?
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Bioquímica Antirretrovirales (Tipranavir)
Inhibidor de la producción de ácido (Esomeprazol) Anti-Alzheimer (derivados de ampakinas) Solo es de investigar qué proteína activa/inhibe
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Antecedentes Antirretrovirales Anti-Alzheimer Nano-encapsulamiento
Unidad de Química Computacional
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Esperamos sean parte del futuro …
Muchas gracias
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