Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena LABORATORIO DE REFERENCIA EN ANDALUCÍA PARA TIPADO MOLECULAR DE PATOGENOS NOSOCOMIALES Y DETECCIÓN GENOTÍPICA DE MECANISMOS DE RESISTENCIA A ANTIMICROBIANOS DE INTERÉS SANITARIO Dr. Alvaro Pascual Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena Unidad Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología Clínica y Medicina Preventiva Sevilla Integrado en el programa PIRASOA

Objetivos Servir de apoyo al SVEA en la detección, investigación y control de alertas por bacterias multirresistentes. Determinar la relación clonal de los aislamientos de patógenos nosocomiales multirresistentes mediante la combinación de pruebas fenotípicas y genotípicas en tiempo suficiente para poder tomar medidas de control adecuadas. Estudio fenotípico y genotípico de los mecanismos de resistencia de patógenos nosocomiales de interés y que puedan favorecer el desarrollo de medidas terapéuticas y/o preventivas. Identificación y seguimiento de clones de microorganismos multirresistentes que circulen en centros hospitalarios de la Comunidad. Creación de una base de datos con los genotipos de interés. Servir de centro centinela para la detección de nuevos mecanismos de resistencia en patógenos nosocomiales o de la comunidad.

Cartera de servicios Resistencia a antimicrobianos Detección de resistencia a oxacilina (SARM) en Staphylococcus aureus. Detección de resistencia a vancomicina en Enterococcus spp Detección e identificación de genes de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) tipo TEM, SHV y CTX-M, más frecuentes en nuestro entorno, en enterobacterias. Detección e identificación de genes de AmpC plasmídicas y cromosómicas. Detección e identificación de genes de beta-lactamasas que hidrolizan carbapenems (carbapenemasas). Tipado molecular o Genotipado Enterobacterias productoras de BLEE o carbapanemasas Otras enterobacterias multirresistentes Acinetobacter baumannii Pseudomonas aeruginosa S. aureus resistente a meticilina. Enterococcus resistente a vancomicina

Metodología Detección de mecanismos de resistencia: Marcadores fenotípicos Marcadores genotípicos: PCR +/- secuenciación Identificación molecular: REP-PCR, PFGE, MLST, Secuenciación Base de datos históricas

Solicitud de servicios Contacto previo telefónico o por correo electrónico: Autorización del envío de aislados Numero y tipo de aislados a enviar Normas de envío en condiciones de bioseguridad. Información de brotes y aislados necesaria para el estudio.

Emisión de informes La emisión de los informes dependerá de las características de cada brote o endemia. Como norma se emitirán 2 informes uno preliminar y otro definitivo. Los tiempos medios de emisión serán: Informe preliminar: a los 10 días de la recepción de la muestra. Informe definitivo: a los 21 días de la recepción de la muestra. Estos tiempos se verán sujetos a modificaciones en función de la complejidad del brote y el número de aislados a estudiar.

Ejemplos: búsqueda de reservorios Caso Muestra A A. traqueal B A. traqueal Trabajador F. nasal S. aureus Dice (Opt:1.00%) (Tol 1.0%-1.0%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%] PFGE2 100 98 96 714 715 MR-151 22/06/11 15/06/11 03/06/11 183-3 184-08 FIBROBRONCOSCOPIO A TRAQUEAL BAL 73016 69980 N º Aislado Fec ha Cama Tipo de muestra NHC ha Cama Tipo de muestra A. baumannii Trabajado relacionado (Tenover), porque tiene 6 bandas de diferencia pero no está realmente relacionado.

Wave 1. On march 2009 2 MDRKO from two patients in adjacents boxes (7,8). Task force was formed. Measures: active screening of admitted patients, contact precautions, standard cross transmission control measures, periodic education and specific protocol of cleaning and disinfection. Wave 2: late august 2009 the last affected patient was again readmitted. MBLKO was isolated from another patient. Additional measures: nures/patient and auxiliary/patient ratio of 1:2 and 1:2,5. review of clean/dirty circuit and discouraging use of carbapenems. Wave 3. In the third environmental study the bacteria was isolated from an stethoscope and a urinary catheter of a patient. In the 4th environmental study, the bacteria was isolated from pipe, drain grill (rejilla de drenaje) and traps of sink 6 but not from overflow grille (rejilla de desbordamiento) and faucet (tap). S. Vergara et al. CMI 2013.

SARM. H.U. Virgen Macarena. Árbol filogenético histórico PFGE

El microbiólogo en los equipos de IRAS y PROA   Responsable Director del programa Director Médico Equipo de IRAS Coordinador Miembros fijos Miembros opcionales Preventivista Microbiólogo, intensivista, enfermeras e internista experto en enfermedades infecciosas. Intensivistas, pediatras… Equipo de PROA Clínico experto en antibióticos. Farmacéutico, microbiólogo, preventivista e internista experto en enfermedades infecciosas. Intensivista, pediatras…

* al menos en situaciones de brotes LAR (HGP = hospitales generales pequeños, HGG = hospitales generales grandes, GHR = grandes hospitales de referencia, LAR= laboratorio autonómico de referencia, CRNH = centros de referencia no hospitalarios) * al menos en situaciones de brotes