Quiz 1. Nombre al menos uno de los aspectos que se subestima al escoger mal el modelo evolutivo 2. ¿Qué hace la corrección AICc? Bono: ¿Cuál es el segundo nombre de Andrew Crawford?
Introducción a JModelTest Sistemática Filogenética Laboratorio Luisa A. Castellanos Francisco Gamarra
Modelos Evolutivos Independencia de mutación -> Sustitución al azar Sesgos en el tipo de mutación Modelos evolutivos
Modelos Jukes Cantor
Modelos Kimura de dos parametros α = Transición β = Transversión
Modelos Hay Muchos
Tasas de heterogeneidad : Distribución gamma Corrige diferencias en las tasas de sustitucion de nucleotidos
Tasas de heterogeneidad : Distribución gamma La mayoría de posiciones evolucionan lentamente
Tomado de Andrew J. Crawford
JModel Test Corre sobre Java Hierarchical y Dynamical likelihood ratio tests (hLRT and dLRT) Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC) Decision theory method (DT).
Corta los nombres Poco tiempo computancional ◦ Se cierra JModel Test
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