En filosofía, la ontología(del griego οντος, genitivo del participio del verbo ε ἰ μί, ser, estar; y λóγος, ciencia, estudio, teoría) es una parte de la metafísica que estudia lo que hay, es decir cuáles entidades existen y cuáles no. Además, la ontología estudia la manera en que se relacionan las entidades que existen. La ontología estudia los seres en la medida en que participan del ser, igual que la biología estudia los seres vivos pero en la medida en que tienen vida. Es la disciplina filosófica más importante. Las dos cuestionesfundamentalesdela ontología son en qué consiste el ser y cuáles son los seres o géneros de seres más importantes.

Ontologías de un dominio, en las que se representa el conocimiento especializado pertinente de un dominio o subdominio, como la medicina, las aplicaciones militares, la cardiología o, en nuestro caso particular, la oncología. Ontologías genéricas, en las que se representan conceptos generales y fundacionales del conocimiento como las estructuras parte/todo, la cuantificación, los procesos o los tipos de objetos. Ontologías representacionales, en las que se especifican las conceptualizaciones que subyacen a los formalismos de representación del conocimiento, por lo que también se denominan meta-ontologías (meta-level o top-level ontologies).

ARISTÓTELES Para el pensador de la antigüedad griega, Aristóteles, quien habló de una "prote filosofía", e incluyó en ella tanto el estudio del ente en cuanto ente, como el estudio de un ente principal al cual se subordinan los demás entes; por ello fue posible diferenciar entre "ontología" y "metafísica". La palabra "ontología", empezó a usarse recién a partir de comienzos del siglo XVII: designaba el estudio de todas las cuestiones relacionadas con el conocimiento de los géneros supremos de los entes. Se le identificó con la "metafísica general". Esta ontología se ocuparía solamente de formalidades.

JOHANN CLAUBERG En 1,647, Johann Clauberg publicó "Elementa philosophiae sive ontosophia"; en esta obra definía a la ontología como "la ciencia y filosofía primera que estudia el ente en cuanto ente, y más adelante declara que esta ciencia "primera, suprema, transnatural, filosófica, divina, universal", etc., es la que ha sido llamada "Ontosofía" por Lobkowitz y "Ontología" por Calovius. CRISTIAN WOLFF En tiempos de Cristian Wolff, la ontología fue considerada una parte de la metafísica, y llamada "metafísica general". Wolff, en su obra "Philosophia prima sive ontología" (1,730), establece definitivamente el nombre de "ontología" en el mundo académico europeo. EDMUND HUSSERL Según Edmund Husserl, la ontología es una ciencia de esencias, y se clasifica en formal y material. La primera, estudia las esencias formales, esto es, aquellas que convienen a todas las demás esencias. La ontología material, estudia las esencias materiales, y está constituida por las ontologías regionales. La ontología formal, implica las formas de todas las ontologías posibles, y en ella está fundada la ontología material.