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Química Medicinal Introducción Ph.D. Randolph Alonso.

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1 Química Medicinal Introducción Ph.D. Randolph Alonso

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18 Empleo de herramientas computacionales Desarrollo de novedosos fármacos.

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41 Empleo de herramientas de síntesis orgánica Desarrollo de novedosos fármacos. Debemos recordar

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43 Desarrollo de estrategias para la síntesis de novedosos fármacos

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81 Farmacóforo Elemento estructural de un fármaco, llámese grupo o grupos funcionales, que le permite a la molécula ejercer la actividad biológica deseada sobre un receptor específico, la remoción de este elemento conduce a la perdida de la actividad biológica.

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97 Hyperchem. Página principal de Hypercube, Inc. desde donde se puede bajar una versión de evaluación de 30 días de Hyperchem Hyperchem. MDL® ISIS/Draw 2.5. Página principal de la compañía MDL. Desde la sección Download No-Fee Software se pueden bajar gratuitamente varios programas interesantes. Necesita registrarse on-line. MDL® ISIS/Draw 2.5. ChemSketch 5.0. Programa de dibujo y visualización de structuras moleculares, presenta una importante función que nombra según la IUPAC a los compuestos dibujados. Necesita registrase on-line ChemSketch 5.0. Mecánica Molecular (MM) y Campos de Fuerza (FF). Características de distintos campos de fuerza: CHAMOT LABS, Inc. Campo de fuerzas MM2 (Sobre el que se basa MM+). Allinger, N.L. MM2. A Hydrocarbon Force Field Utilizing V1 and V2 Torsional Terms. J. Amer. Chem. Soc. 1977, 99: Campo de fuerzas AMBER. (Parámetros de1998 implementados en Hyperchem). Weiner, S.J.; Kollman P.A.; Case, D.A.; Singh, U.C.; Ghio, C.; Alagona, G.; Profeta, Jr. S. and Weiner, P. A New Force Field for Molecular Mechanical Simulation of Nucleic Acids and Proteins. J. Amer. Chem. Soc. 1984, 106: Campo de fuerzas CHARMM. (Sobre el que se basa BIO+). Brooks, B.R.; Bruccoleri, R.E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; and Karplus,M. CHARMM: A Program for Macromolecular Energy, Minimization, and Dynamics Calculations. J. Comp. Chem. 1983, 4: Campo de fuerzas OPLS. (Parámetros implementados en Hyperchem). Jorgensen, W. L. and Tirado-Rives, J. The OPLS Potential Functions for Proteins. Energy Minimization for Crystals of Cyclic Peptides and Crambin. J. Am. Chem. Soc. 1988,110: Mecánica Cuántica (QM). Características de métodos semiempíricos: CHAMOT LABS, Inc Bases de datos Chemfinder.cambridgesoft Protein Data Bank (PDB)CHAMOT LABS, Inc. Campo de fuerzas MM2 Campo de fuerzas AMBER. Campo de fuerzas CHARMM. Campo de fuerzas OPLS.CHAMOT LABS, IncChemfinder.cambridgesoft Protein Data Bank (PDB)

98 Evolución de los Métodos de búsqueda y descubrimiento de nuevos fármacos Ph.D. Randolph Alonso

99 Descubrimiento tradicional de un nuevo prototipo o cabeza de serie Metabolitos secundarios de plantas

100 Descubrimiento tradicional de un nuevo prototipo o cabeza de serie Metabolitos secundarios de Mamíferos Vitaminas Antibióticos

101 Descubrimiento accidental Síntesis Fármacos Conocidos (muy importante)

102 Descubrimiento de cabeza de serie en la actualidad. Síntesis de benzodiazepinas en fase sólida Etapas del desarrollo de un fármaco Investigación básica prototipo-mecanismo de acción Desarrollo preclínico perfil Farma-Toxi-ADME Desarrollo clínico fase I, II, III post- comercialización IV

103 Dianas Biológicas receptores Curvas dosis repuesta

104 Agonista, antagonista y agonista- competitivo

105 Tipos de receptores Localización de las dianas y acontecimientos

106 Canales iónicos

107 Receptores con actividad tirosina cinasa

108 Proteina G

109 Aspectos físico- Químicos relacionados con las interacciones Fármaco receptor Electrostáticas Ion-Ion Ion dipolo Dipolo-dipolo Polarización Transferencia de carga

110 Aspectos físico- Químicos relacionados con las interacciones Fármaco receptor Fuerzas no polares Van der Waals Fuerzas basada en la entropía

111 Estereoquímica D-R

112 EQ-AB Farmacóforo

113 Simplificación de un prototipo Asociación de moléculas Replicación moduladora Criterios clásicos Homologa y ramificación de cadenas Introducción de grupos aromáticos como antagonistas Apertura o cierre de anillos Vinilogia Bioisosterismo

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138 Blancos Terapéuticos

139 Resistencia puede ser Revertida Como es el caso de la CQ, que con un antihistamínico antagonista de H1, ejemplo: Clorfeniramina, Prometazina, esta droga se administra como antihemético, para prevenir o aliviar el prurito, efecto secundario de la CQ.

140 Resistencia puede ser Revertida También se utiliza combinaciones de dos drogas (Fansidar ), que es un antifolato, como un revertidor de resistencia de la CQ.

141 Resistencia puede ser Revertida Otro ejemplo de revertidores de resistencia es de un antihipertensivo (Verapamil®)

142 Muchas gracias


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