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Reacciun 2 y la USB Universidad Simón Bolívar Abril 2005.

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Presentación del tema: "Reacciun 2 y la USB Universidad Simón Bolívar Abril 2005."— Transcripción de la presentación:

1 Reacciun 2 y la USB Universidad Simón Bolívar Abril 2005

2 Universidad Simón Bolívar Aplicaciones de la USB para Internet 2 Apoyo a la Investigación SINAI Química Computacional Estudio de un Modelo para la Oxidación Catalítica de CO Física Computacional Procesamiento de Imagenes Médicas en Grid Mimetic Finite Difference Methods to solve partial differencial equations Modelos No Lineales en Econofísica AMANDA y IceCube

3 Universidad Simón Bolívar Aplicaciones de la USB para Internet 2 BioInformática CARIACO (Carbon Retention in a Colored Ocean): Dinámica de los sistemas de surgencia costera del Caribe Sur Computacion y Sistemas Técnicas de Optimización en Fuentes de Datos Biomoleculares Certificación de la calidad sistémica en el proceso de desarrollo de los sistemas de información SUMA (Scientific Ubiquitous Metacomputing Arch itecture ) Grid Computacional. Video Conferencias

4 Universidad Simón Bolívar SINAI Funciona actualmente como una Base de Datos institucional de la USB de Actividades de Investigación. Permite insertar, modificar, eliminar, validar y compartir 16 tipos de actividades diferentes, además de soportar 5 tipos de usuarios con distintos privilegios. También ofrece 2 tipos de consultas sobre los datos almacenados que abarcan un histórico de actividades desde el año 1997 hasta el 2004. Sinai también facilita la generación del Informe Anual de Investigación de la USB, informe que sirve de indicador para dicha universidad. La información almacenada en Sinai es netamente referencial aunque a corto plazo se piensa en la posibilidad de incluir todos los resúmenes y los textos completos de los artículos y publicaciones en formato pdf. Al observar el éxito de este sistema en el campus de la USB, la primera versión de SINAI ha sido implantanda en varias universidades nacionales con la idea de poder conformar una Base de Datos Nacional de Investigación.

5 Universidad Simón Bolívar SINAI Recientemente se está desarrollando la posibilidad de guardar los resultados de las búsquedas en formato XML con el fin de ir abriendo el camino para la creación de Web Services, donde otros sistemas Web puedan comunicarse con SINAI sin intervención humana para recoger información de nuestras Bases de Datos Prof. Leonid Tineo Coordinador de Información e Integración del Decanato de Investigación y Desarrollo leonid@usb.ve Se esta colaborando con: Universidad Nacional Experimental del Táchira – UNET Universidad del Sur del Lago Universidad Metropolitana – UNIMET Universidad Francisco de Miranda Universidad de Carabobo - UC

6 Universidad Simón Bolívar CARIACO Dinámica de los sistemas de surgencia costera del Caribe Sur) (Carbon Retention in a Colored Ocean) se desarrolla en la Fosa de Cariaco en el Oriente de Venezuela, y busca explicar la compleja relación de intercambio de carbono (CO2) entre la atmósfera, el océano y los sedimentos del fondo. Esta relación es estudiada en cuanto a diferentes factores como el fitoplancton y productividad primaria, surgencias y flujo de nutrientes, entre otros. Dado que una gran cantidad de información es extraída del ambiente único de la Fosa, es posible el desarrollo de otros estudios, generando una variedad de productos que complementan el objetivo principal del proyecto, como calibraciones satelitales, estudios de paleoclima, metabolismo microbiano y óptica. El Proyecto Caraico es un proyecto modular. El módulo bajo la responsabildad de la Universidad Simón Bolívar se basa en el diseño, implementación y mantenimiento de una plataforma informática para el manejo de imágenes de satélite (mapa de temperatura superficial de mar, clorofila y vientos) que son utilizadas para analizar la dinámica de los sistemas de surgencia de la costa Venezolana. Estas imágenes y productos derivados son de acceso público y estan siendo distribuidas a los participantes del proyecto, estudiantes e investigadores interesados además de público en general.

7 Universidad Simón Bolívar CARIACO Dinámica de los sistemas de surgencia costera del Caribe Sur) Actualmente, el sistema Web Cariaco es el único sistema de distribución de imágenes de satélite que existe en el país y de concretarse la instación de antenas receptoras en el territorio venezolano (IGVSB, en proyecto, ICLAM en proyecto) el equipo de Cariaco podría ofrecer los servicios de análisis primario y secundario de las imágenens recibidas y establecer un centro de distribución de datos, similar al existente, pero ampliado a los nuevos productos satelitales. Eduardo Klein Profesor. Dpto. Estudios Ambientales eklein@usb.ve University of South Florida, Institute of Marine Remote Sensing, Department of Marine Science Centro de Procesamiento Digital de Imágenes de la Fundación Instituto de Ingeniería, CPDI-FII. Caracas, Venezuela. State University of New York, Marine Sciences Research Center, Stony Brook, NY University of South Carolina, Department of Geological Sciences, Columbia, SC Fundacion La Salle de Ciencias Naturales, Estacion de Investigaciones Marinas de Margarita

8 Universidad Simón Bolívar Procesamiento de Imágenes Médicas en Grid La investigación relacionada con imágenes médicas, por ejemplo, de herramientas de ayuda al diagnóstico por imágenes como mamografías, tomografías, etc., requiere de un gran repositorio de imágenes, con el cual puedan probarse los algoritmos que se propongan. El proyecto consiste en crear un servicio de almacenamiento y acceso a través de tecnologías Grid de imágenes médicas. Los servicios pueden definirse en un rango que va desde un servicio de tipo FTP (usando la herramienta GridFTP) a servicios del tipo Web Service (instalando el tollkit de Globus 3) e incluso es factible la implementación de servicios de uso extendido en el mundo de las imágenes radiológicas, basados en el estándar denominado DICOM, que define la estructura de los archivos de imágenes y los protocolos de acceso a repositorios de dichas imágenes. Emilio Hernández Prof. Computación emilio@usb.ve Universidad de Los Andes Universidad Central de Venezuela Universidad Autónoma de Barcelona, España

9 Universidad Simón Bolívar Extendiendo colaboración en ambientes de realidad virtual Estrategias de conexión, algoritmos y estructuras de datos de escenas para la colaboración remota entre varios operarios dentro de un ambiente inmersivo 3D, por medio de dispositivos de retroalimentación de fuerza, usados en la interacción y manipulación de objetos en la escena Los ambientes inmersivos y colaborativos cada vez son mas complejos y realistas, requiriendo la transmisión de enormes cantidades de datos a través de la red. El asunto se complica cuando hay múltiples clientes que están compartiendo la escena, ya que no solo hay que transmitir y compartir ésta, sino además todos los eventos de interacción de usuarios. El uso de dispositivos hapticos de fuerza para transmitir eventos y la manipulación de objetos añade aún más gigabytes al tráfico, ya que cada dispositivo transmite datos a una frecuencia de 1000hz por segundo, lo que fácilmente puede inundar una red de 10 o 100 Mhz. Se desarrollan algoritmos y esquemas P2P de transmisión de escenas, pero igual exige el envío masivo de una enorme cantidad de datos como geometría, texturas y animación, al igual que estructuras de control para mantener sincronía entre varios agentes colaborativos.

10 Universidad Simón Bolívar Extendiendo colaboración en ambientes de realidad virtual Víctor Theoktisto Prof. Computación vtheok@usb.ve Universidad Politécnica de Cataluña, Barcelona, España Universidad de Girona, Girona, España

11 Universidad Simón Bolívar Mimetic Finite Difference Methods to solve partial differencial equations Existe un creciente interés en el uso de modelos matemáticos y computacionales para ayudar a resolver problemas científicos, industriales y sociales. El establecimiento de algoritmos fuertes y robustos para hallar soluciones numéricas a esta clase de problemas que pueden ser modelados mediante ecuaciones diferenciales es un componente clave a considerar. Nuestro esfuerzo se centra en el avance de nuevos esquemas numéricos para resolver este tipo de ecuaciones y que preservan propiedades importantes del continuum, como las leyes de conservación. El establecimiento de algoritmos numéricos que presenvan propiedades claves del continuum es un área de investigación muy activa actualmente. Puede ser usada para encontrar soluciones numéricas que actualmente toman mucho tiempo en calcularse usando las técnicas convencionales, aún más importante es que estas soluciones pueden ser calculadas con la presición adecuada en un tiempo razonable. Sergio Rojas Prof. Dpto Física srojas@usb.ve San Diego State University Universidad Central de Venezuela Universidad de Carabobo

12 Universidad Simón Bolívar Modelos No Lineales en Econofísica Aplicaciones de resultados de la teoría del caos y sistemas complejos en el análisis y caracterización de datos financieros, con particular interés en su asociación al comportamiento de sistemas físicos. La caracterización de sistemas dinámicos de naturaleza diferente mediante técnicas de análisis desarrolladas para sistemas físicos, permitiría establecer la universalidad de tales técnicas que luego podrían aplicarse en forma sistemática al análisis de sistemas más complicados como es el caso de la evolución y organización de sociedades y el análisis del código genético. Luis Emilio Guerrero lguerre@usb.ve MIT (en conversaciones)

13 Universidad Simón Bolívar AMANDA y IceCube AMANDA y IceCube son telescopios de Neutrinos de altas energías. AMANDA opera en el Polo Sur desde 1994. IceCube inicia construccion en Enero del 2005 y termina construcción en el 2009. Los neutrinos son los únicos mensajeros astronómicos entre 10 13 y 10 19 eV. Fotones en este rango de energía interactuan con materia interestelar y con campos de fotones IR. Rayos cósmicos de estas energías son desviados por campos magnéticos galácticos e inter- galácticos. Sólo los neutrinos viajan libremente desde las fuentes hasta la Tierra. Varios de los fenómenos más violentos del Universos, como Nucleos de Galaxias Activas (AGN por sus siglas en inglés) y Explosiones de Rayos Gamma (GRB) son fuentes posibles de neutrinos de altas energías. Encontrar las fuentes de rayos cósmicos de más altas energías. Estudios astronómicos en el rango 10 13 – 10 19 eV. AMANDA produce aproximadamente 2 TBytes al año. IceCube producirá 100 TByte al año. Filtros de selección son aplicados en las instituciones mencionadas abajo. El resultado de estos filtros para AMANDA es del orden de 10-100 GByte Ignacio Taboada Prof. Dpto Física itaboada@usb.ve University of Wisconsin at Madison, EEUU Pennsylvania State University, EEUU DESY-Berlin, Alemania

14 Universidad Simón Bolívar Técnicas de Optimización en Fuentes de Datos Biomoleculares Las fuentes de datos biomoleculares, como las que se encuentran en el dominio de NCBI del National Institute of Health (NIH), mantienen millones de instancias relacionadas al genoma humano, proteinas, nucleotidos, enfermedades, etc, y las mismas crecen constantemente. Para resolver un requerimiento típico de información, los científicos deben acceder a varias fuentes de datos las cuales ofrecen usualmente diferentes interfaces, capacidades de procesamiento y navegabilidad. Por otra parte, una vez que se determinan las fuentes de datos a usar para evaluar un requerimiento o consulta dada, se debe identificar el orden en la cual las mismas deben ser vistadas, ya que el tiempo de respuesta y los objetos recuperados, puede variar considerablemente dependiendo del cual orden es ejecutado. Cabe destacar que el número de órdenes posibles, puede ser exponencial en función del número de las fuentes de datos y conexiones existan entre ellas, siendo muy importante la definición de algoritmos que permitan identificar buenos planes de ejecución en un tiempo razonable. Por otro lado, dado el tamano de estas fuentes de datos, se requiere de la definición de nuevos operadores físicos de evaluación que permitan ejecutar una consulta y seguir los enlaces que existen entre las fuentes de datos seleccionados de una manera eficiente. También, se requiere de la identificación de modelos de costos que permitan predecir el costo en tiempo de evaluar un plan determinado así como la completitud o calidad de la respuesta.

15 Universidad Simón Bolívar Técnicas de Optimización en Fuentes de Datos Biomoleculares Para poder ofrecer una interfaz para acceder estas fuentes de datos, se propone el presente proyecto. Entre los objetivos a lograr son: a) estudiar técnicas de optimización que permitan identificar los mejores órdenes para evaluar una consulta; b) modelos de costos y funciones de beneficio; c) técnicas de evaluación de las consultas e integración de datos. Mediante este proyecto se podrán desarrollar técnicas de optimización y evaluación de consultas contra fuentes de datos Web que publican grandes volúmenes de datos, como son las fuentes de datos biomoleculares. La arquitectura que se pretende conseguir como resultado, podrá resolver consultas contra dichas fuentes de datos, que pueden contribuir al estudio del genoma humano, enfermedades o medicina particular, entre otras. Maria Esther Vidal Prof. Computación mvidal@ldc.usb.ve University of Maryland National Institute of Health Arizona State University Humbolt Univeristy

16 Universidad Simón Bolívar Certificación de la calidad sistémica en el proceso de desarrollo de los sistemas de Información Su objetivo general es desarrollar las bases para certificar la calidad de los Sistemas de Software bajo un enfoque sistémico. Es decir desde la perspectiva producto y la perspectiva proceso. Venezuela es un país potencial para desarrollar la industria del software, sin embargo no se cuenta con mecanismos para orientar a las organizaciones en como desarrollar sistemas de software de calidad. Por otra parte, cuando el producto esta desarrollado, para el momento de su mercadeo tampoco se cuenta con una bases para certificar su calidad. Este proyecto esta fuertemente orientado hacia el sector productivo de las empresas desarrolladoras de software y su competencia global. De mejorarse la banda ancha se podría ampliar el alcance del proyecto para que las organizaciones venezolanas puedan evaluar sus sistemas on-line, llevando la aplicación MOSCA a un ambiente colaborativo. Lográndose además que el sistema les arroje estadísticas sobre su evaluación con respecto a otras, sobretodo en la dimensión Procesos. Maria A. Perez de Ovalles Prof. Dpto Procesos movalles@usb.ve UNELLEZ

17 Universidad Simón Bolívar Estudio de un Modelo para la Oxidación Catalítica de CO Se desea estudiar un modelo para la Oxidación Catalítica de monóxido de carbono, específicamente el modelo de Ziff, Gulari y Barshad con desorción de CO (ZGB-k). Particularmente, el estudio de la respuesta del sistema a variaciones periódicas de la presión de los reactantes y/o de la temperatura, alrededor de la transición entre el régimen reactivo (con alta producción de CO2) y el inactivo (con baja producción de CO2). Erik Machado Prof. Dpto Física emachado@usb.ve

18 Universidad Simón Bolívar SUMA (Grid Computacional) Un grid es una agrupación de equipos, que pueden estar fisicamente distribuidos e incluso pertenercer a diferentes organizaciones, que son administrados como si fuera un solo gran sistema que brinda sus capacidades y servicios a diferentes usuarios. Para agregar más poder de cómputo al sistema se puede: Unir las computadoras de estos centros (redes locales de alta velocidad) Unir estos centros con redes de alta velocidad Unir a todo el que quiera/pueda aportar recursos compartido a sistemas de Computación de alto rendimiento Compartir el acceso a bases de datos y sistemas de archivos. Compartir Acceso a software y otros equipos científicos (telescopios, microscopios, etc).

19 Universidad Simón Bolívar SUMA http:// SUMA http:// suma.ldc.usb.ve Suma es un prototipo de plataforma grid que permite ofertar servicios de ejecución remota de procesos secuaciales y paralelos escritos en Java. Estos procesos pueden ser ejecutados en la plataforma Suma tanto en sistemas en línea como batch. El proyecto ha permitido un estudio detallado de las políticas y mecanismos que deben implementar los metasistemas para permitir la ejecución de programas de alto desempeño en plataformas del tipo Grid. El proyecto también ha permitido la creación de plataformas para la ejecución de programas paralelos sobre agrupaciones de equipos del tipo PC de relativamente bajo costo. Emilio Hernández Carlos Figueira Yudith Cardinale Mariela Curiel Prof. Computación Prof. Computación Prof. Computación Prof.Computación emilio@usb.ve figueria@usb.ve yudith@usb.ve mcuriel@usb.ve Universidad de Los Andes Universidad Central de Venezuela Universidad Autónoma de Barcelona, España

20 Universidad Simón Bolívar GRACIAS POR SU ATENCIÓN! leonid@usb.ve rgonzalez@usb.ve


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