Pedro González Villanueva Gen2music Bio-Informática Pedro González Villanueva

Lo que vamos a ver Introducción Descripción del proyecto Ejemplos Bibliografía

INTRODUCCIÓN Gene2music es un proyecto que trata sobre cómo representar las secuencias de aminoácidos en partituras musicales que sean además agradables.

Quedémonos con la idea… INTRODUCCIÓN Quedémonos con la idea… Melodía Aminoácido

INTRODUCCIÓN Aminoácidos Los aminoácidos son las unidades elementales “ladrillos” constitutivas de las moléculas denominadas Proteínas Podemos encontrar 20 aminoácidos diferentes en las proteínas.

INTRODUCCIÓN Aminoácidos Alanina: Interviene en el metabolismo de la glucosa. Glutamina: Nutriente cerebral. Taurina: implicada en la regulación de la presión sanguínea, fortalece el músculo cardiaco y vigoriza el sistema nervioso. Tirosina: Es un neurotransmisor directo y puede ser muy eficaz en el tratamiento de la depresión.

INTRODUCCIÓN Aminoácidos Arginina Asparagina Acido aspártico Citrulina Cistina Cisteina Acido glutaminico Glicina Histidina Serina Ornitina Prolina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Fenilalanina Triptófano Treonina Valina

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Participantes… Graduada en la universidad de California Licenciada en Microbiología, Inmunología y Genética molecular. Toca el piano. Rie Takahashi

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Participantes… Profesor de Microbiología, Inmunología y Genética molecular. Centrado en mecanismos de reparación y muta génesis del ADN. Investiga en la comprensión del cáncer. Jeffrey H. Miller

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Participantes… Estudio biología molecular Investiga en la estructura funcional y relaciones entre las proteínas. Participa en el diseño racional de drogas. Frank Pettit

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Objetivos… Esta idea surge con el objetivo de que estudiantes del campo de la biología del ADN puedan comprender en una fase temprana la estructura de las proteínas. Por otro lado permitir que personas con problemas visuales sean capaces de “ver” las secuencias por otros medios. Hacer más atractiva la biología para los jóvenes…

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Antecedentes… Primera aproximación…

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Antecedentes… Segunda aproximación…

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Antecedentes… Tercera aproximación… Un acorde es un grupo vertical (en notación musical, unido por un solo basto o plica) de tres o más notas de diferente altura, tocadas simultáneamente o en arpegio. En determinados contextos, un acorde también puede ser percibido como tal aunque no suenen todas sus notas.

DESCRIPCIÓN DEL PROYECTO Funcionamiento… Cuarta aproximación…

EJEMPLOS Proteína ThyA… Con la segunda aproximación…

EJEMPLOS Proteína ThyA… Con la tercera aproximación…

EJEMPLOS Proteína ThyA… Con la cuarta aproximación…

EJEMPLOS Otras proteínas… Huntingtin Hemoglobina

EJEMPLOS Translación online… En internet tenemos una aplicación en la que podemos hacer cualquier translación desde una proteína a su correspondiente melodía. Podemos verla en el siguiente enlace: Online Offline Ejemplos para utilizar: Ejemplos

EJEMPLOS Translación online… Diacylglycerol Kinase del homo sapiens: TCTATTGGCGTGGATGCCTCTATTGCTCATCGATTCCACATCATGCGAGAGAAATATCCGGAGAAG TTCAACAGCAGAATGAAGAACAAGCTATGGTACTTCGAATTTGCCACATCTGAATCCATCTTCTCA ACATGCAAAAAGCTGGAGGAGTCTTTGACAGTGGAGATCTGTGGGAAACCGCTGGATCTGAGCAAC CTGTCCCTAGAAGGCATCGCAGTGCTAAACATCCCTAGCATGCATGGTGGCTCCAACCTCTGGGGT GATACCAGGAGACCCCATGGGGATATCTATGGGATCAACCAGGCCTTAGGTGCTACAGCTAAAGTC ATCACCGACCCTGATATCCTGAAAACCTGTGTACCAGACCTAAGTGACAAGAGACTGGAAGTGGTT GGGCTGGAGGGTGCAATTGAGATGGGCCAAATCTATACCAAGCTCAAGAATGCTGGACGTCGGCTG GCCAAGTGCTCTGGGATCACCTTCCACACCACAAAAACCCTTCCCATGCAAATTGACGGAGAACCC TGGATGCAGACGCCCTGTACAATCAAGATCACCCACAAGAAGCAGATGCCCATGCTCATGGGCCCA CCCCCCCGCTCCACCAATTTCTTTGGCTTCTTGAGCTAGGGGGGACACCCTTGGCCTCCAAGCCAG CCTTGAACCCACCTCCCTGTCCCTGGACTCTACTCCCGAGGCTCTGTAACATTGTGCCGCATACTC CTGCCAGCTTGGGGGAGTGTTCCTTCACCCTCGCAGTATTTATTATCCTGCACCACCTCACTGTTC CCCATGCGCACACACGTACACACACCCCAAAACACATACATTGAAAGTGCCTCATCTGAATAAAAT GACTTGTGTTTCCCCTTTGGGATCTGCTGAAAAAAA

Bibliografía Referencias al proyecto Gen2music: http://www.mimg.ucla.edu/faculty/miller_jh/gene2music/home.html  Referencias a aminoácidos: http://www.alimentacion-sana.com.ar/informaciones/novedades/aminoacidos.htm Ejemplos de secuencias genéticas: http://www.doe-mbi.ucla.edu/~pettit/gene2music/g2m_examplegenes.htm Artículos referentes al proyecto: http://genomebiology.com/2007/8/5/405

Pedro González Villanueva Q&A Pedro González Villanueva