TALLER 3 GUIA DIDÁCTICA Bioinformática Estructural TALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES 2012.

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1 TALLER 3 GUIA DIDÁCTICA Bioinformática Estructural TALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES 2012

2 MODELADO DE NUEVAS ESTRUCTURAS y/o estudio gráfico de estructuras problemas 1 - Tomen como secuencia o estructura problema: Sebastian: la secuencia problema que traes de tu proyecto (enviármela por email) Sebastian: la secuencia problema que traes de tu proyecto (enviármela por email) Astrid: tu tarea se va a centrar en ADN pero puedes diseñar una parte para modelar proteínas (enviarme la secuencia por email) Astrid: tu tarea se va a centrar en ADN pero puedes diseñar una parte para modelar proteínas (enviarme la secuencia por email) Vania: deberemos armar la secuencia de 18 aminoácidos que trajiste como problema Vania: deberemos armar la secuencia de 18 aminoácidos que trajiste como problema Gustavo: secuencia de lipasa seleccionada (enviarmela por email) Gustavo: secuencia de lipasa seleccionada (enviarmela por email) Yamandú: secuencia o PDB de receptores nicotínicos de acetil colina humanos Yamandú: secuencia o PDB de receptores nicotínicos de acetil colina humanos Adrian y Alvaro: cualquiera de los PDBs de cristales de RBP estudiados Adrian y Alvaro: cualquiera de los PDBs de cristales de RBP estudiados Marcela y Diego: Va secuencia por email de (transportadores de ácidos grasos). Marcela y Diego: Va secuencia por email de (transportadores de ácidos grasos). Bioinformática Estructural2

3 2 - Con sus secuencia problema realizaremos el ejercicio de superposición (SAS), selecciòn de proteína template, modelado y observaciòn de template y modelos con los tutoriales del Taller 1 y 2 SAS), 3 – Aquellos que trabajen sobre PDBs (y no tengan que modelar) investigarán la informaciòn (respondiendo a la pregunta,p or ejemplo: cuales proteinas son similares a la problema?), analizando la estructura de proteínas alineadas Otros tutoriales a ser usados como referencia: Otros tutoriales a ser usados como referencia: TALLER.3.protein_course_2006.ppt TALLER.3.protein_course_2006.ppt Bioinformática Estructural3

4 Suerte, paciencia y mucha perserverancia! Espero preguntas, planteos etc, por esta vía durante los Talleres Los espero hoy en el CEBIOINFO! Bioinformática Estructural4

5 Buena semana! Bioinformática Estructural5