TALLER 2 GUIA DIDÁCTICA Bioinformática Estructural TALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES 2012.

Presentación del tema: "TALLER 2 GUIA DIDÁCTICA Bioinformática Estructural TALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES 2012."— Transcripción de la presentación:

1 TALLER 2 GUIA DIDÁCTICA Bioinformática Estructural TALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES 2012

2 Hablemos un poco sobre similitud, identidad, homología y alineamientos A los estudiantes que atentamente siguieron la clase y tomaron apuntes…. Los podemos transcribir? A los estudiantes que atentamente siguieron la clase y tomaron apuntes…. Los podemos transcribir? La dinàmica del Taller 2 fue: La dinàmica del Taller 2 fue: Entrar a www.rcsb.org Entrar a www.rcsb.org Entrar a www.rcsb.org Entrar a www.rcsb.org Tomar como palabras claves Tomar como palabras claves Retinol Binding Protein Retinol Binding Protein Fatty Acid Binding Protein Fatty Acid Binding Protein Seleccionar archivos de cristales interesantes, registrar el código PDB y bajar la estructura Seleccionar archivos de cristales interesantes, registrar el código PDB y bajar la estructura Abrir MOE, hacer OPEN del archivo bajado y observar, el gráfico y la secuencia Abrir MOE, hacer OPEN del archivo bajado y observar, el gráfico y la secuencia Bioinformática Estructural2

3 Archivos recuperados: Astrid: 2WQ9 RBP4 - OLEIC Astrid: 2WQ9 RBP4 - OLEIC Vania: 1RBP RBP - RETINOL Vania: 1RBP RBP - RETINOL Diego y Gustavo: 1GRB RBP- N-ETHYL RETINAMIDE Diego y Gustavo: 1GRB RBP- N-ETHYL RETINAMIDE Sebastián: 1JYD SERUM RBP Sebastián: 1JYD SERUM RBP Marcela, Alvaro, Yamandú y Adrián, podrían ustedes cumplir con esta tarea? Marcela, Alvaro, Yamandú y Adrián, podrían ustedes cumplir con esta tarea? Ahora, usando elcomo archivo de trabajo el del código PDB seleccionado y material que encuentren en: Ahora, usando elcomo archivo de trabajo el del código PDB seleccionado y material que encuentren en: Taller.1_intro_more.pptx Taller.1_intro_more.pptx TALLER.1.2.5.MOEIntro_2006.pptx TALLER.1.2.5.MOEIntro_2006.pptx TALLER.3.protein_course_2006.ppt TALLER.3.protein_course_2006.ppt Realicen los ejercicio ahí indicados Bioinformática Estructural3

4 Suerte, paciencia y mucha perserverancia! Espero preguntas, planteos etc, por esta vía o el lunes durante la clase de Taller 3 (de nuevo en el CEBIOINFO) Bioinformática Estructural4

5 Buen finde! Bioinformática Estructural5