Gate y la experiencia Cubana www.eu-eela.org E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre.

Presentación del tema: "Gate y la experiencia Cubana www.eu-eela.org E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre."— Transcripción de la presentación:

1 Gate y la experiencia Cubana www.eu-eela.org E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre Tecnologías GRID aplicadas al Clima y a la Biomedicina Octubre 2007 La aplicación GATE y la experiencia Cubana

2 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 2 GATE GATE Es la aplicación para la tomografía por emisión basada en GEANT4 La idea surge en el año 2001 durante un Workshop en Paris al cual asisten numerosos grupos interesados en la utilización del método de Monte Carlo para la simulación en el campo de la medicina nuclear.

3 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 3 GATE Se llegó al consenso de crear una herramienta con las bondades de los programas dedicados y los de propósito general. Punto de partida: GEANT4 una aplicación para el análisis del paso de las partículas a través de la materia Lausanne PET instrumentation group Geant4 Low Energy Electromagnetic Physics working group, Clermont-Ferrand corpuscular physics for life science group, Ghent medical image and signal processing group. 4 Grupos de trabajo

4 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 4 GATE Año 2002 Primera demostración en vivo de la aplicación Se funda la OpenGate Collaboration con el fin de mejorar, documentar, probar la aplicación con vistas a una distribución pública Año 2004 Primera distribución pública

5 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 5 PROPOSITOS Diseño de nuevos dispositivos de imágenes Implementación de nuevos algoritmos de reconstrucción de imágenes Optimización de protocolos de escaneo Planificación de tratamientos de radioterapia

6 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 6 CARACTERISTICAS DEL CODIGO Utilización del método de Monte Carlo Basado en las bibliotecas del GEANT4 (toolkit desarrollado para la simulación en el área de las interacciones de las partículas con la sustancia) Uso de scripts (Macro lenguaje) para la descripción de la simulación Instalación en los nodos de trabajo de un cluster

7 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 7 Necesidad en CUBA Calculation of deposit dose on the tumor (~1mn): A treatment plan is developed using the images Varios hospitales con servicios de medicina nuclear Adquisición de nuevos equipamientos Inversiones en este campo

8 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 8 ASIMILACION - INSTALACION VALENCIA - Filosofía General del software - Instalación y configuración CUBAENERGIA -Instalación en los nodos de trabajo -Corrida de casos de prueba

9 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 9 Detector : Sistema Phoswitch Phantom : Cilindro de agua Fuente : Oxígeno 15 Adquisición Dinámica: 18 frames of 1 second Sistema CylindricalPET para imagenes de animales pequeños

10 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 10 SPECT BENCHMARK Camara : 4 cabezas a 90° Phantom : Cilindro agua Fuente : Tc-99m (energía: 140 keV) Actividad: 30 kBq Adquisición Dinámica: Mobil source

11 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 11 Fichero ROOT de salida

12 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 12 ETAPA ACTUAL Preparación de los casos reales para realizar las pruebas en el sitio GRID local Scanner slices DICOM format Planificación del tratamiento utilizando el GATE

13 Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America 13 Preguntas