Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011 Herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for- use) de los datos de biodiversidad Manuel Vargas Del Valle Coordinador de la Unidad de Desarrollos Informáticos Instituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio) Buenos Aires (Argentina) 30 septiembre 2011

Resumen Esta presentación es una recopilación de herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for-use) de los datos sobre biodiversidad. Esta charla es una traducción de la elaborada en inglés por Nicolas Noé y Meherzad Romer, y traducida también al francés por ellos mismos.

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Herramientas Metadatos

IPT (y Dwc-A)

Geographic coverage metadata in IPT IPT (y Dwc-A)

Darwin Core Archive Validator

Herramientas Datos espaciales

GeoLocate Carga de datos individual o en lote Visor con varias capas Pueden hacerse correcciones moviendo la localidad o dibujando un polígono Se pueden añadir comentarios, ignorar registros y corregir registros similares Versiones para Internet, escritorio y trabajo colaborativo

InfoXY Recibe coordenadas en lat/long Puede realizar procesamiento s en lote Salida: html o MS Excel

spOutlier

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Calculadora de georreferenciación Entrada: Coordenadas, desplazamientos y distancias, fuentes de incertidumbre Devuelve: Coordinates Estimados de error

Diva-GIS Software SIG básico Gratuito Orientado a biología Vectorial/Ra ster Compatible con muchos formatos

Quantum GIS Software SIG de propósito general Libre Acepta capas geográficas de Bds y servicios web Mac/Linux/Window s Vectorial/Raster Extendible con Python Systema de agregados Comunidad de desarrolladores

R Lenguaje y ambiente de desarrollo para estadística. Análisis y graficación. Extendible e integrable con muchas otras aplicaciones libres: SIG, otros lenguajes, ecología, etc.

Herramientas Datos tabulares

Separador (parser) de nombres Atomiza nombres científicos

“Separador de nombres”

Buscador de nombres Encuentra nombres científicos Entradas: Archivo URL Texto libre

Buscador de nombres

Marcador de taxones Entradas: Url PDF

Marcador de taxones

Checklist Bank Output: Higher taxonomy Input: Scientific Names

Darwin Test

Mapas fáciles de hacer Mantiene datos en línea Tables de Fusión de Google

“Scripting”/lenguajes dinámicos...y el viejo SQL

Fuentes de datos

OpenStreetMap "Wikipedia de mapas"

Thesauri “Checklists”: o Peces : Fishbase o Animales: Index to Organism Name (ION) o Mamíferos: Mammal Species of the World (MSW) o Bacterias: List of Bacteria with Standing in Nomenclature (LBSN)...

Documents

Informe de situación de GBIF Planes y recomendaciones para mejorar la aptitud de uso de los datos en la red de GBIF 77

Inventario BDQ de GBIF de España

Centro de recursos en Internet de GBIF

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