TALLER 3 GUIA DIDÁCTICA Bioinformática Estructural TALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES 2012
MODELADO DE NUEVAS ESTRUCTURAS y/o estudio gráfico de estructuras problemas 1 - Tomen como secuencia o estructura problema: Sebastian: la secuencia problema que traes de tu proyecto (enviármela por ) Sebastian: la secuencia problema que traes de tu proyecto (enviármela por ) Astrid: tu tarea se va a centrar en ADN pero puedes diseñar una parte para modelar proteínas (enviarme la secuencia por ) Astrid: tu tarea se va a centrar en ADN pero puedes diseñar una parte para modelar proteínas (enviarme la secuencia por ) Vania: deberemos armar la secuencia de 18 aminoácidos que trajiste como problema Vania: deberemos armar la secuencia de 18 aminoácidos que trajiste como problema Gustavo: secuencia de lipasa seleccionada (enviarmela por ) Gustavo: secuencia de lipasa seleccionada (enviarmela por ) Yamandú: secuencia o PDB de receptores nicotínicos de acetil colina humanos Yamandú: secuencia o PDB de receptores nicotínicos de acetil colina humanos Adrian y Alvaro: cualquiera de los PDBs de cristales de RBP estudiados Adrian y Alvaro: cualquiera de los PDBs de cristales de RBP estudiados Marcela y Diego: Va secuencia por de (transportadores de ácidos grasos). Marcela y Diego: Va secuencia por de (transportadores de ácidos grasos). Bioinformática Estructural2
2 - Con sus secuencia problema realizaremos el ejercicio de superposición (SAS), selecciòn de proteína template, modelado y observaciòn de template y modelos con los tutoriales del Taller 1 y 2 SAS), 3 – Aquellos que trabajen sobre PDBs (y no tengan que modelar) investigarán la informaciòn (respondiendo a la pregunta,p or ejemplo: cuales proteinas son similares a la problema?), analizando la estructura de proteínas alineadas Otros tutoriales a ser usados como referencia: Otros tutoriales a ser usados como referencia: TALLER.3.protein_course_2006.ppt TALLER.3.protein_course_2006.ppt Bioinformática Estructural3
Suerte, paciencia y mucha perserverancia! Espero preguntas, planteos etc, por esta vía durante los Talleres Los espero hoy en el CEBIOINFO! Bioinformática Estructural4
Buena semana! Bioinformática Estructural5