Grupo de Microbiología Instituto Nacional de Salud Bogotá, Colombia Fortalecimiento y avances de la vigilancia molecular de Salmonella spp. Colombia, 2006 – Julio 2007 Grupo de Microbiología Instituto Nacional de Salud Bogotá, Colombia PulseNet América Latina 5ta reunión anual CDC-INEI-ANLIS-OPS/OMS Buenos Aires, Argentina Octubre 23-25 de 2007

Línea de investigación institucional Vigilancia por el laboratorio: molecular y fenotípica de Salmonella spp., uno de los principales agentes implicados en la enfermedad diarreica aguda. Objetivo Fortalecer el sistema de vigilancia epidemiológica de la salmonelosis en Colombia través de la subtipificación molecular - PFGE de los serotipos de Salmonella Typhimurium y Typhi y de todos los serotipos epidemiológicamente relacionados con brotes.

Número de aislamientos de Salmonella spp Número de aislamientos de Salmonella spp., enviados por departamento Colombia, 2006- Julio de 2007 1 2 3 4 11 32 35 154 13 7 92 86 5 119 20 40 60 80 100 120 140 160 180 Arauca Cesar Guajira N/Santander Amazonas Casanare Meta Risaralda Caldas Atlantico Huila Magdalena Tolima Santander Valle Nariño Bogotá Antioquia 2006 2007 Fuente: Grupo Microbiología, INS, - http://www.ins.gov.co/investigacion

Distribución de los aislamientos de Salmonella spp por serotipo Colombia, 2006 – Julio de 2007 % 10 20 30 40 50 60 Typhimurium Enteritidis Typhi Braenderup Newport Agona Dublin Infantis Uganda Muenster Otros seroptipos 2006 Julio-2007 Fuente: Grupo Microbiología, INS, - http://www.ins.gov.co/investigacion

Distribución de los patrones de multirresistencia en aislamientos de Salmonella Typhimurium 2006 n° Patrón de resistencia % aislamientos C, Amp, Te, Amc, S 21 13.9 SXT, Amp, Te, S 20 13.2 SXT, Amp, Te 16 10.6 Otros patrones de 44 29.1 multirresistencia = 14 Resistentes a 1 ó 2 antibióticos 41 27.2 Sensibles 9 6.0 Total 151 100.0 Julio 2007 n° Patrón de resistencia % aislamientos SXT, Amp, Te, S 22 19.0 C, Amp, Te, AMC, S 12 10.3 Otros patrones 35 30.2 de multirresistencia =16 Resistentes a 1 ó 2 antibióticos 43 37.1 Sensibles 4 3.4 Total 116 100.0

Total de aislamientos de Salmonella subtipificados por PFGE - XbaI Todos los aislamientos de S. Typhimurium y S. Typhi recuperados por los laboratorios de salud pública Todos los serotipos relacionados epidemiológicamente con brotes Criterio de selección de los aislamientos de Salmonella para estudio por PFGE -2007 Total de aislamientos de Salmonella subtipificados por PFGE - XbaI Serotipos de Salmonella Año 2006 2007 n aislamientos Typhimurium 87 116 Typhi 21 14 Enteritidis 4 - Muenster 3 Essen 2 Sandiego Total 134

Nuevos patrones de PFGE = 25 Patrones prevalentes de PFGE - XbaI en aislamientos de Salmonella Typhimurium 2006 (87/151) Nuevos patrones de PFGE = 25 2007 (116/116) Nuevos patrones de PFGE = 15 COIN.06.JPX.X01 n % 0062 17 19.6 0011 6 6.9 0194 0013,0219 (5 c/u) 10 11.5 Otros patrones 37 42.5 Con un patrón PFGE 11 12.6 Total 87 100 COIN.07.JPX.X01 n % 0168 32 27.6 0062 21 18.1 0216 11 9.5 0013 7 6.0 Otros patrones 31 26.7 Con un patrón PFGE 14 12.1 Total 116 100

Dendrograma-PFGE-XbaI Patrón prevalente COIN07JPX.X01.0168 S. Typhimurium Enero – Julio de 2007 Patrón prevalente COIN07JPX.X01.0168 Mes n° aislamientos Localización/ (n aislamientos) Febrero 11 Antioquia (9) Bogotá (2) Marzo 2 Abril 8 Antioquia Mayo 7 Junio Antioquia (1) Bogotá (1) Julio Total 32 Antioquia (27) Bogotá (5) 51.2%

Patrones prevalentes de PFGE - XbaI en aislamientos de Salmonella Typhi 2006 Nuevos patrones de PFGE = 10 2007 Nuevos patrones de PFGE = 6 COIN.06.JPP.X01 n % 0005 8 38.1 0064 3 14.3 0063 2 9.5 Con un patrón PFGE Total 21 100.0 COIN.07.JPP.X01 n % 0031 4 28.6 0002 3 21.4 0067 2 14.3 Con un patrón PFGE 5 35.7 Total 14 100.0

Brotes de Salmonella confirmados con XbaI y BlnI 2006 – 2007

Acciones en la vigilancia PulseNet – Colombia, 2006 – Julio de 2007 Actualización del programa GelCompar II Version 4.6 - Gracias al apoyo del comité coordinador PulseNet – LA Comunicación oportuna de los resultados - alerta telefónica Divulgación de los resultados de la vigilancia molecular Muñoz N, Realpe ME, Ovalle MV, Castañeda E, Patiño L, Gómez ME et al.Informe anual de la vigilancia fenotípica y molecular de Salmonella en Colombia. IQEN Mayo 2007 Actualización de la página web con los datos de vigilancia de Salmonella: www.ins.gov.co/investigacion. Participación reunión semanal del Comité de Vigilancia Epidemiológica (COVE)- INS

Comentarios Disponible una base de datos nacional con los patrones electroforéticos de 9 serotipos de Salmonella. Retroalimentación con los resultados de la vigilancia a los laboratorios participantes La subtipificación molecular de Salmonella ha permitido al laboratorio reconocer brotes difusos y confirmar los brotes en lo posible en tiempo real En Colombia para fortalecer la vigilancia de patógenos relacionados con ETA, se está desarrollando dos proyectos de vigilancia, convenio ínter administrativo Ministerio de Protección Social-INS 205/2006 1- Estudio de factores de riesgos asociados a la transmisión de ETA en expendios de alimentos en 5 ciudades capitales del país 2- Estudio de la factibilidad técnica y operativa para la vigilancia de Campylobacter spp como agente patógenos de alimentos en Colombia

PULSENET INTERNACIONAL Respuesta rápida al estudio de brotes USA: Ahmed M. Elsedawy Serotipo Fecha Respuesta de Colombia S. Tennessee Febrero, 2007 Dos aislamientos 2001 - 2004 S. Wandsworth Junio, 2007 Este serotipo no ha sido recuperado S. Muenchen Pennsylvania, : Junio 2007 Se estudiaron 21 aislamientos de S. Muenchen recuperados de 1998-2007 10 patrones: COIN07.JJ6.X01.0001 - 0010, ninguno relacionado con el brote S. Typhimurium USA, Septiembre 25 de 2007

Propuestas de trabajo 2007-2008 Instituto Nacional de Salud – Bogotá, Colombia

Actividades de subtipificación en el marco del sistema de vigilancia en Colombia - 1 Incluir en la vigilancia molecular el estudio de los serotipos de Salmonella relacionados con procesos extraintestinales. (Recomendación - PulseNet-LA).

Actividades de subtipificación en el marco del sistema de vigilancia en Colombia -2 Obtener la certificación en PFGE para Shigella sonnei y Shigella flexneri Incorporar de rutina la subtipificación molecular de Shigella sonnei y Shigella flexneri para establecer la base de datos nacional.

Propuesta proyectos de investigación regional Para responder a las preguntas de investigación ¿ Existe relación genética entre los aislamientos de Salmonella asociados con brotes en América latina? Comparación de los perfiles de PFGE de los aislamientos de Salmonella spp asociados a brotes en la región. ¿ Cuál es la epidemiología molecular de los aislamientos de Salmonella Typhimurium multirresistentes recuperados de muestras clínicas, alimentos y animales para consumo humano en América Latina? Epidemiología molecular de aislamientos de S. Typhimurium multirresistentes recuperados de muestras clínicas, alimentos y de animales para consumo humano en América Latina?