Descargar la presentación
La descarga está en progreso. Por favor, espere
Publicada porCarlitos Virgen Modificado hace 10 años
1
Ejercicios de bioinformática aplicaciones en proteínas
4
Función del agente desnaturalizante y el agente reductor
5
200 Proteínas.
7
Condición Normal Condición patológica ANÁLISIS DE IMÁGENES
10
MAPAS DE PROTEINAS EN 2D
15
-MAGVDKAMVTLSNGVKMPQFGLGVWQSPAGEVTENAVNWALCAGYRHIDTA -ALNTNSRYGPDPDEAQF -AIYKNEESVGAGLRASGVPREDVFITTKLWNTEQGYESTLAAFEESRQKLGVDYIDL YLIHWPRGKDILSKEGKKYLDSWRAFEQLYKEKKVRAIGVSNFHIHHLEDV -VSNFHIHHLEDVLAMCTVTPMVN -LAMCTVTPMVNQVELHPLNNQADLRAFCDAKQIKVEAWSPLGQGKLLSNPILSAIG AKYNKTAAQVILRWNIQKNLITIPKSVHRERIEENADIFDFELGAEDVMSID -ENAVNWALCAGYRHIDTAAIYKNEESVGAGLRA -IFDFELGAEDVMSIDALNTNSRY Ensamblaje de secuencias
16
Búsqueda de proteínas en Pubmed
17
Búsqueda de proteínas en (Protein data bank) Crystal structure of LipL32
18
>SEQUENCE GAFGGLPSLKSSFVLSEDTIPGTNETVKTLLPYGSVINYYGYVKPGQA PDGLVDGNKKAYYLYVWIPAVIAEMGVRMISPTGEIGEPGDGDLVSDA FKAATPEEKSMPHWFDTWIRVERMSAIMPDQIAKAAKAKPVQKLDD DDDGDDTYKEERHNKYNSLTRIKIPNPPKSFDDLKNIDTKKLLVRGLY RISFTTYKPGEVKGSFVASVGLLFPPGIPGVSPLIHSNPEELQKQAIAAE E Búsqueda de la estructura 3D de proteínas -Identifique la proteína en la base de datos -Descargue la estructura 3D -Cuantas hélices posee la proteína -Cuantas laminas posee la proteína -Cuantas uniones posee la proteína -Cual es la función biológica de la proteína
20
Identificación de un espectro de masas
22
Búsqueda de dominios estructurales
23
MANDFVHLNVHTEYSLLNNYNPIEKLIEKAKELNFKAMAITDYNNMYGVIDFYKRCKKNSIKPIIGCELT LSYSNNEFYNIILLAKNNLGYKNLCKLVSNLYVVENRNREFITFDELEKYSKNLILIVGSKRSFIRKCLY SEDILSAKNEILNFKSLFNREDLFLELNFHFEENDELMMNRYLEFANEVNIETVVTNDVHYLENTDFNLF KIARCISKGVLLSELKEDNFTQAEYFLKSEEEMLKIFSTLEDSMYNTKMIAQRCNVEFDFSTYHLPEYKV PDGVSTKEDYLHSLIIEGMKKRYENLTDEIKKRVNYEFSVINKMGFTDYFLIVWDFVNFAKKNKIPVGPG RGSGANSIVAYCLEITDIDPIEYDLIFERFLNPERVSMPDFDIDFCNERREEVIDYVIKKYGKNHVSQII TFGTMKPRAAVRDIGRVLGYKLSTVDKVAKLIPNNLDVTFKNALRDSLELKKLYDEDINIKKLINISEKF EKFHRHISIHAAGIVITKEELTEYIPLAKSGENIVTQFNMVELEELGLLKMDFLGLRTLTVIDDTIKLVK KNYNRDIDIEKISLNDKNVLNLFKTADTIGIFQFESTGMRLFLKDLKADNFDELVAANSLFRPGPMNQIP NYIKNKRNPSGIRYLDKRLEKYLKSTYGIIVYQEQVMQIARELAGYTWGQADNLRKAIGKKHMDIMEYNR KIFIYGLDNLDGSIKIKGCIRNGVDEKLAQNIFDLIVEFGNYAFNKSHSACYSLNAYRTAYLKYYYPLEY MVCLLNSVINYERQFFLYFQEIKRMGIKILLPSVNFSFYKISTENKCMRVGFSQIKGFNRLLAKDIIEAR KAGKFKNFKEFLERLKDSKNMNLISIENLIKSGAFDEIEKNRIEILNSCETLFTQIVSKSKNELSGQLSL ISSDFMQEKFVEYKNFSKDDTLEFEKDVLGFYISAHPLDSYKEYIKSKNSMKLIDLKVLDKGIYKVIVYV NSVKTRKSKKNKTLKIINVEDFSSSIELLNVKDLDINKGKIYEISVKVTVNSFGNTNFTIIDADEIYDIY IKKLYIKLDSLDYYTKKKLGEFSEKYNGENQVILYISSNHKTLKLENKFDLRNENLLVELEDNFGKDCFY Que dominios se encuentran en la siguiente secuencia -Cuantos y cuales dominios encuentra en la secuencia -En que tipo de proteínas se encuentran estos dominios -Cual es proceso biológico y función molecular de cada uno de esos dominios -Busque la estructura por homología en la base de datos Protein Databank -Modele su estructura en tres dimensiones -Cuantas estructuras secundarias encuentra -Según la estructura global que proteína podría ser -Cual es la posible función de esta proteína
24
Localización en las vías metabólicas
25
Visualice mediante la base de datos KEGG: - El modelo de infección de Leismania - El modelo de infección del virus Epstein-Barr -El proceso de biosíntesis de aminoácidos -El camino de señalización del TNF
26
METABOLOMA
Presentaciones similares
© 2024 SlidePlayer.es Inc.
All rights reserved.