Herramientas de Stata para resolver retos analíticos frecuentes en la evaluación de pruebas de tamizaje Eduardo Ortiz-Panozo EUSMEX 2013.

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1 Herramientas de Stata para resolver retos analíticos frecuentes en la evaluación de pruebas de tamizaje Eduardo Ortiz-Panozo EUSMEX 2013

2 Evaluación de pruebas de tamizaje Frecuentes en salud pública Fases tempranas enfermedad Tipos: – Comparar resultados contra un estándar – Comparar resultados entre pruebas

3 Problemas analíticos frecuentes sesgo de verificación – Se tiende a confirmar sólo resultados positivos correlación entre observaciones – Más de una prueba para un solo individuo

4 Estadísticos de resumen

5 Comparación de pruebas mediante modelos log-lineales Pepe (2003)

6 Ventajas del enfoque de regresión Ponderación (IPW, probabilidad de verificación) Errores estándar robustos (correlación) Eficiencia Ajuste por covariables Pepe (2003)

7 Ejemplo numérico: Programa de detección de cáncer cervical en Morelos, 2009 Primero VPH y luego PAP a mismas mujeres Muestra para verificación en dos etapas: 1)Unidades de salud 2)Mujeres Prob. Verificación en VPH+ = 1 Prob. Verificación en VPH- ~0.05 Evaluación de cuatro estrategias n=5,980

8 Estimación naïve -diagt-

9 Diseño muestral

10 Estimación con ajuste por sesgo de verificación

11 Detección de VPH vs biopsia, mediante –diagt– y –svy:tab– (n=625) -diagt--svy:tab- Summary statistics PrCI95%PrCI95% Sensitivity0.960.900.990.630.530.71 Specificity0.270.230.300.880.850.91 Positive predictive value0.170.130.200.170.150.19 Negative predictive value0.980.941.000.98 0.99

12 Comparación de estrategias de tamizaje con ajuste por sesgo de verificación y correlación entre observaciones

13 Comparación de estrategias de tamizaje, mediante modelos log-lineales(n=625) Relative statisticsPapHPVCombinedSequential rSens11.2*0.8*1.3*** r(1-Spec)15.8***0.3***6.5*** rPPV10.3***1.5**0.3*** rNPV11.0 Reference test: Pap smear * p<.05, ** p<.01, *** p<.001

14 Conclusión El planteo de la evaluación de pruebas de tamizaje en el contexto de regresión permite ajustar por retos análiticos comunes: como el sesgo de verificación o la correlación entre observaciones El módulo de modelos lineales generalizados de Stata permite realizar las especificaciones necesarias para la evaluación de pruebas de tamizaje

15 Referencias Seed PT, Tobias A. Summary statistics for diagnostic tests. Stata Technical Bulletin 2001;59:9-12 Pepe MS. The statistical evaluation of medical tests for classification and prediction. Oxford Statistical Science Series, Oxford University Press. 2003