Método de Firtch-Margoliash para calcular el árbol sin raíz

Presentación del tema: "Método de Firtch-Margoliash para calcular el árbol sin raíz"— Transcripción de la presentación:

1 Método de Firtch-Margoliash para calcular el árbol sin raíz
3 1 5 2 4 6 Esta es la topología que debe tener un árbol sin raíz con 6 OTU

2 Cálculo de las distancias a y e
B C D E F 6 3 2 8 4 3 A a = 3/4 5 e = 5/4 E 4 6 A a p BCDF e E a + e = 2 a + e = 2 a = 3/4 a + p = 21/4 e = 5/4 e - a = 2/4 e + p = 23/4

3 Cálculo de la distancia d
AE B C D F 6 7 3 8 4 Cálculo de la distancia d D A a = 3/4 d = 5/3 e = 5/4 E AE 4 q r BCF d D d + q = 3 d + q = 3 d = 5/3 d + r = 20/3 d - q = 1/3 q + r = 19/3

4 Cálculo de las distancias b y f
AED B C F 8 7,33 6 4 Cálculo de las distancias b y f D A a = 3/4 d = 5/3 B b = 2 e = 5/4 E f = 2 F 4 B b m ACDE f F b + f = 4 b + f = 4 b = f = 2 b + m = 26/4 b = f f + m = 26/4

5 Cálculo de la distancia c
AED BF C 6 7,33 8 D A a = 3/4 d = 5/3 x B b = 2 y e = 5/4 z E f = 2 c = 14/3 C F BF t s AED c C c + t = 8 c + t = 24/3 c = 14/3 t + s = 18/3 c - t = 4/3 c + s = 22/3

6 Cálculo de las distancias x, y, z
B b = 2 y e = 5/4 z E f = 2 c = 14/3 C F X se calcula a partir de la distancia entre A y D: AD = 3 AD = a + x + d = 3 x = 7/12 3 = 3/4 + x + 5/3 Y se calcula a partir de la distancia entre D y C: DC = 8 DC = d + y + c = 8 y = 5/3 8 = 5/3 + y + 14/3 Z se calcula a partir de la distancia entre B y C: BC = 8 BC = b + z + c = 8 z = 4/3 8 = 2 + z + 14/3