INTRODUCCIÓN 1. L EY DE L AMBERT -B EER 2. D ETERMINACI Ó N DE PROTE Í NAS 3. M ANEJO DE MICROPIPETAS 1.Absorbancia Biuret 3.Lowry 4.Bradford 5.BCA

PARTE II: REVISIÓN DE MÉTODOS ESPECTROSCÓPICOS Y ELABORACIÓN DE CURVA ESTÁNDAR DE PROTEÍNA Objetivos Aplicar un método espectrofotométrico para medir la concentración de una proteína. Conocer el manejo de micropipetas y espectrofotómetros. Construir curvas de calibración y comprender su importancia. Determinar el intervalo de sensibilidad de una curva estándar.

ESPECTROFOTOMETR Í A Definición: Medición de la cantidad de energía radiante que absorbe un sistema químico en solución en función de la longitud de onda de la radiación. El espectrofotómetro: instrumento que permite relacionar la radiación absorbida o transmitida por las moléculas en solución con su concentración.

E SPECTROFOTÓMETRO

LEY DE LAMBERT Y BEER Explica que hay una relación entre la absorción de luz por una sustancia en solución y la concentración de ésta, así como también con la longitud del cuerpo que la luz atraviesa. A = ε·c·l Donde: A = absorbancia;  = Coeficiente de extinción molar; l = longitud de la celda.

COEFICIENTE DE EXTINCI Ó N MOLAR Es una medida de la cantidad de luz absorbida por unidad de concentración. Es específico para cada sustancia. Un compuesto con un alto valor de coeficiente de extinción molar es muy eficiente para absorber luz a una cierta longitud de onda y, por lo tanto, puede detectarse al medir la absorción en soluciones muy diluidas.

C URVA P ATR Ó N Es un marco de referencia que se construye a partir de cantidades conocidas de una sustancia en solución: por ejemplo la albúmina sérica bovina en agua

M ARCO DE REFERENCIA Un sistema de referencia o marco de referencia es un conjunto de convenciones usadas por un observador para poder medir la posición y otras magnitudes físicas de un sistema físico y de mecánica.observador posiciónmagnitudes físicas

L IMITACIONES DE L-B Linearidad limitada por factores químicos e instrumentales: Desviación del coeficiente de absortividad a altas concentraciones (>0.01M) por interacciones electrostáticas Difusión de la reflección por partículas suspendidas Fluorescencia o fosforescencia de la muestra Cambios en índice refractivo a altas concentraciones Cambios en el equilibrio químico por alta concentración Radiación no monocromática

L IMITACIONES DE L-B

DETERMINACIÓN DE PROTEÍNAS Comparación de métodos

C UANTIFICACI Ó N DE P ROTE Í NAS Técnica de rutina básica en el laboratorio: A) En la actividad específica de una preparación enzimática, B) Para diagnóstico de enfermedades, C) Cuantificación de proteínas recombinantes, etc.

C UANTIFICACI Ó N DE P ROTE Í NAS Diferentes métodos para la cuantificación de proteínas. Muchos de estos se basan en: la propiedad intrínseca de las proteínas para absorber luz en el UV, la formación de derivados químicos, o la capacidad que tienen las proteínas de unir ciertos colorantes.

PROTE Í NAS Y LA ABSORCI Ó N EN LA REGI Ó N UV Bandas de absorción más significativas en ultravioleta cercano, entre 230 y 300 nm. Aminoácidos aromáticos, además de la histidina y la cistina. La cistina con pico de absorción en 250 nm.

REACCIÓN DE BIURET La reacción debe su nombre al Biuret, una molécula formada a partir de dos moléculas de urea (medio básico) (H 2 N-CO-NH-CO-NH 2 ). Complejo con Cu 2+ Baja sensibilidad del método

MÉTODO DE LOWRY Reacción de determinación de proteínas en dos pasos: 1. Reacción de Biuret. 2. La reducción, también en medio básico, del reactivo de Folin-Ciocalteau por los grupos fenólicos de los residuos de tirosina.

PRIMER PASO SEGUNDO PASO Reacción de Cu 2+ en medio alcalino Reacción con el Folin-Cicalteau Enlaces peptídicos tirosina, triptófano, y en menor grado por cisteína, cistina e histidina.

LOWRY

T INCIÓN DE PROTEÍNAS CON A ZUL DE C OOMASIE Ensayo en tubo del método de Bradford. Tinción de proteínas en gel de poliacrilamida- SDS

BRADFORD  Unión de Comassie Blue G-250 (también Serva Blue) a las proteínas.  El colorante, en solución ácida, tiene dos formas: azul y naranja.  Unión de las proteínas a la forma azul. El complejo proteína- colorante tiene un ε mayor que el colorante libre.  Sensible (1-15 μg), simple, rápido, barato y pocas sustancias interfieren en su determinación.  Entre las interferencias están los detergentes y las soluciones básicas.

EL AZUL DE COOMASIE Y LOS AMINOÁCIDOS QUE RECONOCE

CAMBIO DE ABSORBANCIA DEL AZUL DE COOMASIE Coomasie libre Coomasie-proteína (catiónico) (aniónico) Libre Con proteína

BCA

Reducción de Cu 2+ -Cu 1+ por proteína en ½ alcalino. Detección de Cu 1+ por BCA (Rxn de Biuret). Primer paso: Los péptidos que contienen tres o más residuos de aa forman un complejo quelado con el cobre y tartrato de sodio. Segundo paso: Dos moléculas de BCA reaccionan con 1 Cu 1+. Desarrollo de color púrpura. Lectura a 562 nm. Formación de color influenciado por cisteína, cistina, tirosina y triptófano. A diferencia de métodos con Coomasie (Bradford), el esqueleto peptídico también contribuye a la formación de color, disminuyendo la variablidad.

C UADRO COMPARATIVO DE SENSIBILIDAD DE LAS TÉCNICAS DE CUANTIFICACI Ó N DE P ROTE Í NAS

E L EXPERIMENTO …

A BSORBANCIA VS CANTIDAD DE MATERIA

Micropipetas

TIPOS DE MICROPIPETAS Los tipos: P1000, P200, y P20. P1000 es útil para volúmenes de 200 hasta 1000 μL P200 es útil para volúmenes de 20 hasta 200 μL. P20 es útil para volúmenes de 0.5 hasta 20 μL. No Trate de colocar la micropipeta para volúmenes mayores que el máximo, o para volúmenes menores del mínimo, esto descalibrará y dañará la micropipeta ($$$$$$). Toda micropipeta utiliza puntas desechables. No utilizar la micropipeta con líquidos que atacan el polipropileno (ácidos, solventes). No utilizar líquidos que emitan vapores. La temperatura de los líquidos debe estar entre 15 y 40 º C. Al poner la punta, asegúrese que la punta sea del tipo correcto y que esta correctamente ajustada. Generalmente para P1000 las puntas son azules, para P200 son amarillas y para P20 pueden ser amarillas o blancas.