AMINOACIDOS PEPTIDOS PROTEINAS

Presentación del tema: "AMINOACIDOS PEPTIDOS PROTEINAS"— Transcripción de la presentación:

1 AMINOACIDOS PEPTIDOS PROTEINAS
ESTRUCTURA y ANALISIS AMINOACIDOS PEPTIDOS PROTEINAS

2 Estructura de un alfa aminoácido

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16 Lambert-Beer : A = log (Io/I)=e. c
Lambert-Beer : A = log (Io/I)=e.c.l e = coef absorción molar c concentración

17 Intermediarios en la síntesis de arginina y ciclo de la urea

18 El zwitterion predomina en solución acuosa a pH neutro

19 Los aminoácidos pueden actuar como ácidos o bases
Los recuadros indican las regiones de mayor poder tamponate

20 Efecto del entorno químico en el pK, debido a las interacciones moleculares

21 La curva de valoración predice la carga eléctrica de los aminoácidos
pH punto de inflexión entre las dos etapas, la glicina esta en forma dipolar totalmente ionizada y sin carga neta este punto se denomina : pI PUNTO ISOELECTRICO pH < 5.97 positiva pH> 5.97 negativa

22 pI= 3.22

23 pI 7.59

24 Reacción de condensación Formación del enlace peptídico

25 Se nombran desde el residuo amino terminal a la izquierda

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28 Trabajar con proteínas
Se pueden separar y purificar Extracto crudo Diálisis Cromatografía en columna HPLC Electroforesis Secuenciación : degradación de Edman Espectrometría de masas

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35 En sucesivos pasos se va acotando en numero de bandas

36 Otorga a todas las moléculas una misma cargo por lo que migran en el campo eléctrico solo por su peso molecular

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41 Electroforesis bidimensional

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44 Secuencia de aa Citocromo c Hum residuos invariables amarillo

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48 Punto de rupturas

49 1fluoro-2,4 dinitrobenceno
Solo rompe en los carbonilos que provienen de Met

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51 ESPECTROMETRIA DE MASAS
MALDI MS Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Muy poca cantidad de muestra Mr es un parámetro critico para identificar la proteína ESI MS Electrospray Ionization

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54 Espectroscopia de masas en tandem

55 ESPECTROMETRIA DE MASAS TANDEM
HIDROLSIS CON PROTEASAS PRIMER EM SEPARA LOS FRAGAMENTOS IONIZADOS SE SELECCIONA UN PEPTIDO ESTE ENTRA A UNA CAMARA DE VACIO DONDE VUELVE A FRAGMENTARSE LA MAYORIA DE LAS FRAGMENTACIONES SE DA EN LOS ENLACES PEPTIDICOS EL SEGUNDO EM MIDE LA RELACION MASA/CARGA DE TODOS LOS FRAGMENTOS CARGADOS GENERANDO PICOS LOS PICOS SUCESIVOS TIENEN UNA DIFERENCIA DE UNA AMINOACIDO RESPECTO DE SU MASA

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57 Síntesis química de un polipéptido sobre un soporte polimérico