Subtipificación molecular de Salmonella Typhimurium, Costa Rica 2003-2005 Dra. Elena Campos Centro Nacional de Referencia en Bacteriología, INCIENSA COSTA.

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1 Subtipificación molecular de Salmonella Typhimurium, Costa Rica 2003-2005 Dra. Elena Campos Centro Nacional de Referencia en Bacteriología, INCIENSA COSTA RICA V Reunión Internacional Red PulseNet América Latina Buenos Aires, Argentina, 23 - 25 de octubre 2007

2 Antecedentes El INCIENSA envío al Instituto Malbrán 26 cepas de Salmonella Typhimurium para subtipificación molecular, seleccionadas entre cepas aisladas durante 2003–2005: –Cepas clínicas multiresistentes con perfil ACSSuT y algunas a NAL, de casos aislados de diarrea y otras de pacientes relacionados epidemiológicamente a un brote ETA –Cepas aisladas de alimentos con un perfil de resistencia a los antibióticos similar al de las cepas clínicas –Cepas clínicas y de alimentos sensibles a los antibióticos antes mencionados

3 Objetivo Estudiar la variabilidad genética de aislamientos de S. Typhimurium (resistentes y sensibles a los antibióticos) de Costa Rica, del período 2003 – 2005 Confirmar la sospecha epidemiológica de asociación de algunas de las cepas multiresistentes a un brote ETA Comparar los perfiles de las cepas de S. Typhimurium clínicas con cepas aisladas de alimentos

4 Estrategia de estudio En INCIENSA se realizó la caracterización fenotípica de los aislamientos: –pruebas bioquímicas –serotipificación –susceptibilidad a los antimicrobianos por difusión en discos (Kirby-Bauer) En el Instituto Malbrán se realizó el PFGE: –Con XbaI a todos los aislamientos referidos –Con BlnI para los aislamientos que presentaron idéntico perfil con XbaI En el LCDC-Canadá se determinó el fagotipo de algunos aislamientos con perfil de resistencia compatible con la variante DT104

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9 Qué sabemos actualmente de S. Typhimurium DT104 en Costa Rica S. Typhimurium compatible con DT104 se ha documentado en todas las provincias del país a partir del 2003. Desde el 2004 se tienen cepas caracterizadas por fagotipo. Estas cepas se han asociado a: –Casos aislados de diarrea –Un brote ETA –Una defunción con antecedentes de diarrea –Infecciones invasivas (septicemia) En el 2006, 61% de los aislamientos clínicos de S. Typhimurium confirmados en INCIENSA presentaron un perfil de resistencia compatible con la variante DT104

10 Qué sabemos actualmente de S. Typhimurium DT104 en Costa Rica Existe evidencia de una cepa de canal porcino (2004) con resistencia ACSSuT que posee perfiles de PFGE (con XbaI y BlnI) idénticos a los de cepas clínicas multiresistentes. Además, un alimento importado (hígado) presenta un perfil de PFGE muy similar con XbaI al de las cepas clínicas multiresistentes. Sin embargo, el análisis con BlnI muestra que dicha cepa tiene una homología menor al 80 % con las cepas clínicas del país. Las cepas de S. Typhimuriun de Costa Rica compatibles con la variante DT104 muestran un patrón de PFGE idéntico a un perfil descrito en Argentina y presentan un 93% de similitud con aislamientos de Colombia.

11 Plan de Trabajo 2007-2008

12 Caracterización molecular (por PFGE) de aislamientos clínicos y de alimentos de Listeria monocytogenes (a realizar en el 2007) Caracterización molecular (por PFGE) de aislamientos clínicos y de alimentos de Listeria monocytogenes (a realizar en el 2007) Siete aislamientos clínicos de Listeria monocytogenesSiete aislamientos clínicos de Listeria monocytogenes (1998-2006) 23 cepas aisladas de queso fresco,23 cepas aisladas de queso fresco, como parte de la investigación: “Calidad microbiológica del queso fresco en expendios de la Región Central Norte, Costa Rica”, realizada por Ministerio de Salud, INCIENSA e INISA en el 2004 Siete aislamientos clínicos de Listeria monocytogenesSiete aislamientos clínicos de Listeria monocytogenes (1998-2006) 23 cepas aisladas de queso fresco,23 cepas aisladas de queso fresco, como parte de la investigación: “Calidad microbiológica del queso fresco en expendios de la Región Central Norte, Costa Rica”, realizada por Ministerio de Salud, INCIENSA e INISA en el 2004

13 Brote ocurrido entre abril y mayo 2007, con más de 25 enfermos Asociado al consumo de alimentos en un restaurante de mariscos El INCIENSA cuenta con las cepas de Shigella sonnei de seis pacientes y de un manipulador de alimentos El estudio se podría complementar con el análisis por PFGE de cepas la misma localidad y de otras regiones del país, tanto del 2007 como de años anteriores. Caracterización molecular de aislamientos clínicos de Shigella sonnei relacionados a un brote ETA, 2007. (a realizar en el 2008) Desde el 2005 en Costa Rica S. sonnei es la especie más comúnmente aislada por los laboratorios de la red (69% de los aislamientos referidos al INCIENSA en el 2006).

14 Avances en la adquisición de equipo para PFGE Actualmente se realiza la licitación para la compra del equipo para PFGE