Mapas de ligamiento Luis Barboza Centro para investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS) Universidad de Costa Rica Julio 2009.

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1 Mapas de ligamiento Luis Barboza Centro para investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS) Universidad de Costa Rica Julio 2009

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3 Posiciones de genes en cromosomas Griffiths et al. 2008 Mapas de ligamiento genético Hibridación in situ de influorescencia (FISH) Map based cloning

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5 Meiosis Griffiths et al. 2008

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8 Mapas de ligamiento –No muy precisos debido a: Dobles recombinantes Interferencia –Funciones para corregir: Haldane Kosambi

9 Práctica Lineas recombinantes Arabidopsis thaliana Poblaciones inmortales

10 Broman et al. (2005) Población: RILs Ler×Cvi (Recombinant inbred lines) Parentales Híbrido F1 Descendencia por semilla única “Líneas Inmortales”

11 Ejercicio 1: CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) FR: (13/20)*100 = 65 cM Conclusión: GAPB A y GAPB B no se encuentran ligados FR > 50 cM P P P P P R R R R R R R R R R R P P R P P R Frecuencia de recombinación (FR):Núm. Recombinantes/ Total población a b a a a a a b b b b b a a b b a b a b a b a b a a a b b a a a a a b b a a a b b b a b

12 Chi-cuadrado Griffiths et al. 2008

13 Chi-cuadrado Hipótesis nula: No hay ligamiento (loci son segregados independientemente) Hipotesis alterna: Sí hay ligamiento Hipótesis nula es rechazada Posiblemente hay ligamiento Griffiths et al. 2008

14 Ejercicio 2: Longitud de inflorescencia Er - Er +

15 Ejercicio 3