Frameshifting.

Presentación del tema: "Frameshifting."— Transcripción de la presentación:

1 Frameshifting

2 CONTENIDO Definicion Terminos relacionados
estimuladores del frameshifting CONTENIDO

3 Definición

4 Frameshifting: Cambio en el marco de lectura en un sitio del mRNA ridiendo en una proteina codificada por 2 ORFs solapantes

5 EL MOVIMIENTO EN EL CUADRO DE LECTRURA SERA DE UNA BASE EN SENTIDO 3´O 5´ (frameshifting + / – 1)

6

7 El frameshifting es parte del Recoding:
Procesos de desviación de las reglas estándar de codificación (son requeridos por algunos organismos procaritas y eucariotas en condiciones determinadas)

8 Descrito principalmente en
Virus Retrotransposones Elementos de inserción bacterianos También en genes celulares

9 ESTIMULADORES DEL FRAMESHIFTING

10 RIO ARRIBA DEL SITIO DE FRAMESHIFTING
SECUENCIAS TIPO SHINE-DALGARNO RIO ARRIBA DEL SITIO DE FRAMESHIFTING

11 Estructuras 2ª : pseudoknots

12 Han de solapar con el sitio de frameshifting
Codones de STOP CONDICION: Han de solapar con el sitio de frameshifting UAG UGA UAA CUU UGA DESPLAZAMIENTO +1

13 ( E.coli; CGA codon raro para Arg)
Secuencias nucleotidicas UUUPy GGGG… o UUUU… STOP CCC CGA ( E.coli; CGA codon raro para Arg)

14 Bajos niveles de aa-tRNA
Sitio A vacio mas tiempo Estimula frameshifting

15 Capacidad del tRNA para interaccionar con el codon cambiado en el sitio P

16 Otros términos relacionados

17 Alteracion en la codificación: recoding
Al final de la traducciónreadthrough Durante la elongacion  frameshifting y hopping

18 READTHROUGH EJEMPLO: INSERCION DE Sec Requiere elementos especiales

19 HOPPING Suspension y salto en la traduccion

20 tmRNA: Mensajero y transferente
Control de calidad ante mensajeros truncados (bacterias)

21 FIN

22 BIBLIOGRAFIA SUPER COMPLETO¡¡¡¡¡¡¡¡ Pavel V. Baranov, Olga L. Gurvich, Andrew W. Hammer, Raymond F. Gesteland and John F. Atkins. RECODE Nucleic Acids Research, 2003, Vol. 31, No. 1 Ping Shu, Huacheng Dai1, Wlodek Mandecki2, Emanuel Goldman CCC CGA is a weak translational recoding site in Escherichia coli. Gene 343 (2004) 127–132 Beatrice Cobucci-Ponzano, Mosè Rossi andMarco Moracci. Recoding in Archaea. Molecular Microbiology (2005) 55 (2), 339–348