Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Morning Introduction to the Workshop, Vision and Objectives Implementation.

Presentación del tema: "Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Morning Introduction to the Workshop, Vision and Objectives Implementation."— Transcripción de la presentación:

1 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Morning Introduction to the Workshop, Vision and Objectives Implementation of the Forest Inventory Program Database Concepts Mid-morning Examples of Caribbean Permanent Plots Afternoon Examples of Data Analyses Data Sharing and Regional Synthesis, Working Group Themes Identifying Forest Research Sites and Plots in the Caribbean; using Caribbean Foresters website Exhibition and Discussion of Country Report Posters

2 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Conceptos básicos sobre bases de datos Conceptos básicos sobre metadata http://www.ecoinformatics.org Créditos y Agradecimientos

3 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts ¿Que es una base de datos? Existen diferentes definiciones, dependiendo del contexto. Para efectos prácticos la podemos definir: Base de datos: - Es una colección de archivos interrelacionados, creados por un programa especial conocido como data base management system (DBMS) – Estos archivos pueden contener una o mas tablas que guardan datos en una manera estructurada en forma de tablas: – Es una serie o grupo de tablas Estas tablas se relacionan entre si Utiliza un lenguaje de comandos para búsquedas

4 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Las tablas consisten en una serie de columnas (Campos) que representan una característica de un individuo u objeto. Cada fila o Registro (colección de campos de iguales o de diferentes tipos) ofrece una descripcion del objeto o individuo. La tabla es una colección de registros almacenados siguiendo una estructura homogénea.

5 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts FechaCódigoAlturaDiámetro - Las bases de datos ofrecen un control explicito sobre los tipos de datos (columnas) Provee Exactitud Control de calidad Desempeño Facilita el uso Ejemplo:

6 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts FechaCódigoAlturaDiámetro A B C D CódigoLatitudLongitudElevación A B C D Se establecen relaciones explicitas o implícitas entre las tablas Existe o se crea una clave única o clave primaria (primary key) para relacionar las tablas. Esto permite hacer búsquedas y re-organizar datos de manera rápida y fácil

7 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Características de los Datos Ecológicos Requerimientos de Metadata/Complejidad Imágenes de Satélite Volumen de datos (por set de datos) Baja Alta Alta Datos de Suelos ProductividadPrimaria SIG Datos Poblacionales Censos de Biodiversidad Secuencias Genómicas Datos Empresariales, Administrativos Estaciones Meteorológicas La mayoría de los datos ecológicos La mayoría de los programas

8 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Programas de Spreadsheets (como Excel) Lo bueno – Son usados comúnmente – Son fácil de aprender – Por lo general están instalados en la mayoría de las computadoras Lo no tan bueno – Puede promover malos hábitos de uso, generando datos que no pueden ser usados fácilmente – No permiten análisis muy complejos – Es difícil auditarlos, es decir, ver como se ha cambiado o manipulado los datos – No facilitan la busqueda efectiva de un subconjunto de los datos

9 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Métodos para diseño efectivo – Dividir los datos en tablas – Determinar el tipo de dato de cada columna – Identificar las relaciones entre las tablas

10 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamañoColector datosID A1124ATYAS15 Karen Hernández 15 A1212XIPHON22 Karen Hernández 15 A1233MACREN38 Karen Hernández 15 A2316ATYAS14 Karen Hernández 15 A2317ATYAS19 Karen Hernández 15 FechaSitioColector datosID A B C D SitioLatitudLongitudElevación A B C D Datos adicionales del sitio de muestreo Se pueden relacionar en otra tabla

11 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamaño A1124ATYAS15 A1212XIPHON22 A1233MACREN38 A2316ATYAS14 A2317ATYAS19 FechaSitioColector datosID 15jul2006 A Karen Hernández28 15jul2006 A Christopher Torres15 15jul2006 B Karen Hernández28 16jul2006 C Karen Hernández28 CódigoGeneroespecie ATYAAtyalanipes XIPHOXiphocariselongata MACREMacrobrachiumcrenulatum MACOTMacrobrachiumotracosii Datos adicionales de taxonomía se pueden almacenar en otra tabla Los datos que se repiten es mas eficiente que estén en otra tabla

12 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Métodos para diseño efectivo –Dividir los datos en tablas –Determinar el tipo de dato de cada columna –Identificar las relaciones entre las tablas

13 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamaño A1124.2ATYAS15.1 A1212.3XIPHON22.3 A1233.0MACREN38.5 A2316.3ATYAS14.6 A2317.8ATYAS19.2 Datos Numéricos Integernums enteros200 Floatnums reales de precisión sencilla (hasta 23 lugares decimales) 3.1415926 Dobleprecisión doble (hasta 53 lugares decimales) 3.141592653589793 24532438531425934 35104756237812 Ejemplos de tipos de datos (dependen del programa en uso)

14 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamaño A1124ATYAS15 A1212XIPHON22 A1233MACREN38 Datos de Texto char char(n) carácteresPlumeria varchar(n)Caracteres con un largo variableheces fecales sin identificar textUn pedazo grande de textoUn resumen (abstract) enumValores enumeradossur, oeste, norte, este Set*Un grupo de valorescapullo, flor, fruto-inmaduro, fruto-maduro Ejemplos de tipos de datos (dependen del programa en uso) *Set- aquí puede colocarse mas de uno de los valores

15 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Fechas DATETIMEYYYY-MM-DD HH:MM:SS2006-11-28 45:30:15 DATEYYYY-MM-DD2006-11-28 TIMESTAMPSegundos que han pasado desde t 0 38 TIMEHH:MM:SS45:30:15 YEARYYYY2006 Ejemplos de tipos de datos (dependen del programa en uso) FechaSitioColector datosID 2006-07-15AKaren Hernández28 2006-07-15AChristopher Torres15 2006-07-15BKaren Hernández28 2006-07-16CKaren Hernández28 Hay otros tipos de columnas, y mas información sobre estos en http://dev.mysql.com/doc

16 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Métodos para diseño efectivo – Dividir los datos en tablas – Determinar el tipo de dato de cada columna – Identificar las relaciones entre las tablas

17 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Relaciones entre las tablas – Cada dato individual se entra una sola vez – Las columnas pueden corresponder a otras tablas, y las filas corresponden a registros de datos individuales Por lo tanto – Cada registro individual en una tabla puede estar ligado/relacionado a uno o muchos registros en otras tablas

18 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Tipos de relaciones -1 a 1(una fila a una fila) -1 a muchas -muchos a muchos SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamañoID A1124ATYAS15 A1212XIPHON2228 A1233MACREN3828 A2316ATYAS1428 A2317ATYAS1928 FechaSitioColector datosID 15jul2006 A Karen Hernández28 15jul2006 A Christopher Torres15 15jul2006 B Karen Hernández28 16jul2006 C Karen Hernández28 CódigoGeneroespecie ATYAAtyalanipes XIPHOXiphocariselongata MACREMacrobrachiumcrenulatum MACOTMacrobrachiumotracosii Datos adicionales de taxonomíaDatos adicionales

19 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamañoID A1124ATYAS15 A1212XIPHON2228 A1233MACREN3828 A2316ATYAS1428 A2317ATYAS1928 FechaSitioColector datosID 15jul2006 A Karen Hernández28 15jul2006 A Christopher Torres15 15jul2006 B Karen Hernández28 16jul2006 C Karen Hernández28 CódigoGeneroespecie ATYAAtyalanipes XIPHOXiphocariselongata MACREMacrobrachiumcrenulatum MACOTMacrobrachiumotracosii Tipos de relaciones -1 a muchas

20 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamañoID A1124ATYAS15 A1212XIPHON2228 A1233MACREN3828 A2316ATYAS1428 A2317ATYAS1928 FechaSitioColector datosID 15jul2006 A Karen Hernández28 15jul2006 A Christopher Torres15 15jul2006 B Karen Hernández28 16jul2006 C Karen Hernández28 Tipos de relaciones Varias filas en una tabla están relacionadas con varias filas en otra tabla Tener relaciones entre tablas de muchos a muchos puede ser problemático. En ocasiones es aconsejable crear una tabla adicional para relacionar esas dos tablas

21 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts SitioPiscinaTrampaProfundidadEspecieReproTamañoID A1124ATYAS15 A1212XIPHON2228 A1233MACREN3828 A2316ATYAS1428 A2317ATYAS1928 FechaSitioColector datosID 15jul2006AKaren Hernández28 15jul2006AChristopher Torres15 15jul2006BKaren Hernández28 16jul2006CKaren Hernández28 Tipos de relaciones Varias filas en una tabla están relacionadas con varias filas en otra tabla IDColector datosProyectoCurso 28Karen HernándezXXXXXXXXXYYYY 15Christopher TorresXXXXXXXXXYYYY 06Ana CamposXXXXXXXXXYYYY 25Marcela ReyesXXXXXXXXXYYYY Ahora tenemos una relación de 1 a muchas

22 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

23 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

24 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts GenéricosEspecíficos Gratis web based Access MySQL EndNote BIOTA Google Tables Referencias – Cook et al. 2001. Best practices for preparing ecological and ground-based data sets to share and archive. Ecol. Bulletin 82:138-141. – Michener and Brunt 2000. Ecological Data: Design, management and processing. Blackwell Science.

25 Algunos conceptos sobre metadata

26 Nivel 1 Título, autor, información de contacto Quien publica y fecha de publicación Palabras claves y Resumen Nivel 2 Cobertura Geográfica Cobertura Taxonómica Cobertura Temporal Nivel 3 Derechos de propiedad intelectual Proyecto y Métodos Tabla de datos/atributos Nivel 4 Se da acceso, el dato físico Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts Diferentes niveles de metadata

27 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts El reto: La entropía de los datos Contenido de Información Tiempo Al tiempo de publicación Detalles específicos Detalles generales Accidente Cambio de projecto (Michener et al. 1997) Retiro Cambio de trabajo

28 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts A new metadata repository-

29 Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Database and Metadata Concepts

30 Morning Introduction to the Workshop, Vision and Objectives Implementation of the Forest Inventory Program Database Concepts Mid-morning Examples of Caribbean Permanent Plots Afternoon Examples of Data Analyses Data Sharing and Regional Synthesis, Working Group Themes Identifying Forest Research Sites and Plots in the Caribbean; using Caribbean Foresters website Exhibition and Discussion of Country Report Posters Assessment of Long-Term Forest Dynamics in the Caribbean Basic Database and Metadata Concepts