Cómo publicar metadatos Manuel Vargas Del Valle Coordinador de la Unidad de Desarrollos Informáticos Instituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio) Buenos Aires (Argentina) 28 de septiembre de 2011 Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011

Proceso de publicación de información

Agenda - ¿Por qué metadatos? - El perfil EML de GBIF - Estándares para metadatos - Preparación de los metadatos - ¿A dónde se van esos metadatos? - Preparación de los metadatos (ejemplos)

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”Ciencia con uso intensivo de datos” ”Cuarto paradigma de la ciencia” e-Infrastructure Reflection Group (European Strategy Forum on Research Infrastructures). Report on Data Management, November ”Diluvio digital de datos” The Fourth Paradigm: Data-Intensive Scientific Discovery Alta calidad en los metadatos para una curación a largo plazo y para el uso de los recursos de datos. Requisito clave: ¿Por qué metadatos?

William K. Michener, Meta-information concepts for ecological data management, Ecological Informatics, Volume 1, Issue 1, January 2006, Pages 3-7, ISSN , DOI: /j.ecoinf ¡La información se deteriora con el tiempo!

¿Por qué metadatos? Los metadatos permiten: - El descubrir información - Interpretar/Evaluar - Procedencia - Calidad - Aptitud para el uso - Reutilización

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Estándares para metadatos Ecological Metadata Language (EML) v Dublin Core Directory Interchange Format (DIF) ISO 19115/19139 Geographic Metadata ISO 19115: ISO 19139:

Natural Collections Descriptions (NCD) Federal Geographic Data Committee (FGDC) Biological Profile* * Una extensión del FGDC CSDGM (Content Standard for Digital Geospatial Metadata) Multimedia Resources Metadata Schema Estándares para metadatos

ISO 19115/19139 Perfil Norteamericano del ISO Existen diversas posibilidades para ver y convertir metadatos EML to FGDC Biological Profile # FGDC CSDGM to ISO Transform # FGDC CSDGM to ISO Crosswalk # ISO XML to HTML View: # FGDC BIO to ISO Transform # FGDC BIO to ISO Crosswalk FGDC CSDGM ISO EML to ISO Open source INSPIRE-compliant MD editor (multilingual)

Metadatos y los idiomas A Multilingual Metadata Catalog for the ILTER: Issues and Approaches. Vanderbilt, K.L., et al., Ecological Informatics, Volume 5, Issue 3, May 2010, Pages , doi: /j.ecoinf Utilizar un único idioma. (e.g. inglés) -Los proveedores de datos dan los metadatos básicos en inglés -Los metadatos ampliados se provee en idioma local “Keywords” en idioma local desde un thesaurus. e.g., GEMET, AGROVOC -GEMET: -AGROVOC: Solución (a largo plazo): Ontologías plurilingües. ¿problemas? -Carga adicional → herramientas y estándares

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Perfil EML de GBIF - Requerimientos -GBIF Metadata Task Group -EML; ISO 19115; NCD; INSPIRE Directive GBIF EML schema - Comunidad GBIF: Metadata network - Perfil GBIF: Documentación

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Preparación de los metadatos - Editores de metadatos e.g., IPT, Spreadsheet template, Morpho, EUOSME, Cassia. - Scripting -Tomarlo directamente de una base de datos de metadatos. -Convertir de una estándar de metadatos a EML - Creando el XML de manera directa -Es esencial que se valide cuidadosamente el resultado.

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¿A dónde van esos metadatos?

Fuentes de metadatos - Cache de datos de GBIF - Instalaciones del IPT registradas - Catálogos a nivel nacional, regional, organizaciones. - Catálogos por tema. e.g., OBIS GBIF: -No imponemos un estándar de metadatos o una implementación de catálogo para los participantes. - Participantes de GBIF - Redes externas - e.g. Knowledge Network for Biocomplexity (KNB)

Metadatos de GBIF: Arquitectura GBIF metadata catalogue specification:

OAI-PMH Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting Provee un mecanismo para la interoperabilidad en múltiples repositorios de metadatos distribuidos. Proveedores de datos: exponen sus metadatos. Proveedores de servicios: recolectan metadatos a travez de software conocido como recolector (harvester) que realiza solicitudes de servicio OAI-PMH sobre HTTP GBIF: Mantiene un rol tanto de recolector como de proveedor

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GBIF: procesador de hojas de cálculo 1. Descargar las plantillas desde el sitio 1. Rellenar la plantilla 1. Convertirla a un perfil GBIF de metadatos utilizando el procesador de hojas de cálculo. El procesador de hojas de cálculo no publica un archivo en GBIF, solo genera un archivo DwC-A listo para publicar. * Vínculo directo:

IPT: Editor de metadatos 1.Crear un nuevo recurso en el IPT 2.Completar los metadatos – Recurso de datos (Resource). – Proyecto. – Involucrados (personas e instituciones). – Keywords. – Cobertura. – Cobertura taxonómica. – Cobertura geográfica. – Cobertura temporal – Derechos de propiedad intelectual – Métodos – Metadatos adicionales – Descripciones de los datos. 3. ¡Publíquelo! – Metadatos para recursos publicados y no publicados forman parte del archivo DwC-A (eml.xml)

Cómo publicar metadatos Manuel Vargas Del Valle Coordinador de la Unidad de Desarrollos Informáticos Instituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio) Buenos Aires (Argentina) 28 de septiembre de 2011 Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011