1 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Manejo.

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1 1 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Manejo de colecciones de datos científicos en la Web I Jornadas de Divulgación de Tecnologías de Información y Comunicaciones y el Desarrollo Sostenible DTIC-UCV Caracas Julio 2005 Rodrigo Torréns, Zulay Méndez, Magdiel Ablan, Rigoberto Andressen Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida

2 2 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Introducción: Comentarios iniciales sobre: Manejo de colecciones de datos en Venezuela Red de Estaciones Bio-climáticas de Mérida ECO-RED Venezuela Red ILTER (International Long Term Ecological Research Network)

3 3 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Los datos que yo necesito, existen? Dónde están? Cómo los obtengo? Los datos producto de una investigación científica Uso de tecnologías de información para: Ubicar Accesar Recuperar Compartir …datos

4 4 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Objetivos Para lograr el… Uso secundario y a largo plazo de colecciones de datos científicos Se debe… Ubicar y recuperar información Garantizar permanencia de los datos en el tiempo Herramientas organizativas y tecnológicas que pueden hacer esto posible: Uso de metadatos y estándares de intercambio de información

5 5 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Herramientas Herramientas organizativas y tecnológicas que pueden hacer esto posible: Uso de metadatos y estándares de intercambio de información Tecnologías de Información y Comunicaciones Formación de Redes de colaboración entre científicos y entre usuarios de información

6 6 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Qué significa la palabra metadatos? " Datos sobre los datos ". "Nivel superior de la información, o instrucciones que describen el contenido, contexto, calidad, estructura, y accesibilidad de una colección de datos específica" (J.K. Michener 1997). D M D M1 D M2 Mc D M a) b)c) Metadatos como parte de los datos Metadatos externos al recurso de información Meta-metadatos (colecciones de metadatos)

7 7 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Para qué metadatos? Preguntas que se deberían poder responder usando metadatos: Qué datos describe una colección de datos científicos? Quien produjo la colección? Porqué fue creada la colección? Cómo fue creada la colección? Cuan confiables son los datos. Qué problemas persisten en la colección? Cómo alguien puede obtener una copia de la colección? Quien escribió los metadatos?

8 8 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Ejemplos de metadatos y de comunidades que usan metadatos Muestra datos NBII http://www.nbii.gov/ Documentación de datos geoespaciales (estándar FGDC) http://cndg.clearinghouse.gub.uy

9 9 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Ejemplos de metadatos y de comunidades que usan metadatos Documentación de datos geoespaciales (Interfaz a Clearinghouse FGDC y GCMD Data Documenter)

10 10 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Algunos de los estándares para metadatos geoespaciales, biológicos y ambientales más usados FGDC-CSDGM. Content Standard for Digital Geospatial Metadata. Federal Geographic Data Committe (1994): Datos geoespaciales. [www.fgdc.gov] FGDC-NBII. Perfil Biológico de FGDC. Biología y ciencias naturales. [www.nbii.gov]. Global Change Master Directory Interchange Format – DIF. (1993) Ciencias de la Tierra. [gcmd.gsfc.nasa.gov] Darwin Core (DwC). Colecciones de Historia Natural. Descriptores para Metadatos no-geoespaciales. NCEAS-LTER (1997) Datos ecológicos. Base del estándar EML. [lternet.washington.edu]

11 11 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Manejo de colecciones de datos científicos. Algunas experiencias locales Red de Estaciones Ecológicas de Venezuela (ECORED) Red de Estaciones Bioclimáticas del Estado Mérida (redbc)

12 12 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Red de Estaciones Bio-climáticas del Estado Mérida ( redbc ) Justificación Dificultades que existen en Venezuela para ubicar y usar colecciones de datos bio-climáticos. Interés de organizaciones, instituciones y personas que tienen datos históricos los cuales desean preservar o compartir para su uso a largo plazo. Necesidad de implementar un sistema de información que permita realizar análisis y descubrir correlaciones entre diferentes conjuntos de información, que ayuden a la toma de decisiones e investigación científica.

13 13 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida La Experiencia de la Red de Estaciones Bio-climáticas del Estado Mérida ( redbc ) Manejo, identificación, y preservación en el tiempo, de recursos de información relacionados con la biología y el clima usando estándares internacionales de formato y contenidos. Generación de un Sistema de Información a través del Web que permita el facil acceso de investigadores, productores y organizaciones que necesiten la información producida por la red de estaciones. Objetivos principales

14 14 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida La Experiencia de la Red de Estaciones Bio-climáticas del Estado Mérida ( redbc ) Mantener en el tiempo las colecciones de datos y desarrollar mecanismos de almacenamiento, catalogación y distribución de la información generada. Realizar permanentemente labores de identificación de nuevas fuentes de información que puedan incorporarse a las colecciones existentes. Concientizar a los científicos sobre la importancia de la preservación de los datos generados en sus investigaciones. Objetivos secundarios

15 15 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Estaciones de la redbc Estación INIA-Chama, Sur del Lago de Maracaibo Estación Ciplat, Sur del Lago de Maracaibo Estación La Hechicera, Mérida Estación Mucujún, Mérida Estación Santa Rosa, Mérida Estación San Juan, Mérida

16 16 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Instituciones afiliadas actualmente la redbc Centro Internacional del Plátano (CIPLAT) Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA)- Chama, Sur del Lago Instituto de Ciencias Ambientales y Ecológicas (ICAE) de la ULA Instituto de Investigaciones Agropecuarlas de la ULA (IIAULA)

17 17 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Funcionamiento de la redbc Sistema de Información Bioclimático basado en el web Ubicación de características de colecciones de datos. Utilización de tecnologías Internet-Web, que aceleran y facilitan grandemente el proceso de captura, actualización y difusión de la información bio-climática, permitiendo varios niveles de acceso y recuperación de dicha información. Actualmente sólo se proveen datos sin procesar (archivos de datos provenientes de las estaciones meteorológicas) y sus respectivos metadatos. En el futuro se podrá acceder a información previamente procesada (gráficos, tablas, etc). Libre acceso a colecciones de datos (datasets) producidos por miembros de la red y (en lo posible) por cualquier persona o institución que los necesite.

18 18 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Internet Miembros de la REDBC Servidor (CECALCULA) redbc Funcionamiento de la redbc Sistema de manejo de datos: Datos llegan por varias vías (enviados por gerentes locales de información): -E-mail -Web -CD -Entregas personales Gerentes Centrales de información los procesan de ser necesario y los publican en Internet

19 19 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Consultando las colecciones de datos Es Ejemplo: Colección de datos Estación Chama

20 20 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Enlace Consultando las colecciones de datos Ejemplo: Colección de datos Estación Chama Presentación de datos Datos originales (sin procesar) Datos ordenados (Por año y por mes) html xml (EML: Ecological Metadata Language) txt Formato de metadatos

21 21 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Metadatos html (para visualización por Web) Metadatos xml (EML) (para intercambio con otros sistemas y procesamiento automático) Consultando las colecciones de datos Ejemplo: Colección de datos Estación Chama

22 22 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Consultando las colecciones de datos Ejemplo: Colección de datos Estación Chama Interfaces Web: Datos originales

23 23 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Consultando las colecciones de datos Ejemplo: Colección de datos Estación Chama Datos originales Datos sin procesar, tal como vienen de los instrumentos o científicos que los capturan

24 24 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Consultando las colecciones de datos Ejemplo: Colección de datos Estación Chama Datos ordenados Datos con algún tipo de procesamiento

25 25 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Consultando las colecciones de datos Ejemplo: Consulta en KNB Datos enviados a KNB: http://knb.ecoinformatics.org

26 26 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Formas de envío y publicación de metadatos y datos? Afiliarse a la redbc Llenar Planilla de documentación de datos proporcionada por el gerente central de información. Se pueden configurar planillas de diferentes tipos: Web, Word, txt, etc. Documentar los datos Contactar por e-mail o teléfono al Proveedor de metadatos

27 27 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Dificultades en el desarrollo de proyectos de este tipo Escaso conocimiento de la importancia de la preservación y posibilidades de uso secundario de los datos. Poca disposición de los científicos para compartir los datos. Poca receptividad para aportar metadatos que documenten las colecciones de datos. Confusiones que tienen que ver con los derechos de propiedad y uso de los datos. Información incorrecta sobre la calidad y cantidad de información que dicen poseer algunas instituciones (entorpece la investigación). Bajo interés por parte de algunos gerentes de información local en publicar sus colecciones de datos (retardo en envío de datos-pérdida de información). Algunos gerentes locales no disponen de conexión a internet. Costos de los instrumentos de captura de datos. No existe la figura de gerente local de información.

28 28 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida El Futuro Usos futuros: Redes de manejo de conocimientos basadas en datos y metadatos (intención de KNB) Acceso a herramientas analíticas "en-línea" para integrar varias herramientas como SAS, MATLAB, etc. con acceso a datos de red de científicos (LTER) Herramientas para producir formas alternativas de metadatos que permitan a cualquier sitio participar fácilmente en otras bases de datos internacionales y Clearinghouses de datos (FGDC, GCMD, NBII, etc.)

29 29 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida Referencias Clearinghouse Federal Geographic Data Commite (FGDC,NBII) http://www.fgdc.gov/clearinghouse/ Global Change Master Directory (GCMD, DIF) http://gcmd.gsfc.nasa.gov Long Term Ecological Research Network (LTER, EML) http://lternet.edu Knowledge Network of Biocomplexity http://knb.ecoinformatics.org National Center for Ecological Analysis and Synthesis www.nceas.gov

30 30 Manejo de colecciones de datos científicos en la web Universidad de Los Andes, Centro Nacional de Cálculo Científico, Parque Tecnológico de Mérida www.cecalc.ula.ve/redbc/