GBIF Publicación de datos en GBIF: Servicio de alojamiento, situación actual y futuro. Silvia Lusa 25 de abril de 2008, Real Jardín.

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1 GBIF Publicación de datos en GBIF: Servicio de alojamiento, situación actual y futuro. Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid Primera Asamblea de Participantes de GBIF en España Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad Global Biodiversity Information Facility

2 GBIF 1.Qué es el Servicio de Alojamiento de Datos 2.Como se integra en la estructura de GBIF 3.Situación actual. Proceso de provisión de datos 4.Futuro 5.Estadísticas de uso Primera asamblea de participantes de GBIF en España

3 GBIF El denominado Servicio de Alojamiento de Datos de la Unidad de Coordinación de GBIF España tiene el objetivo de facilitar la conexión de bases de datos sobre biodiversidad con la red de GBIF. Trata de simplificar el proceso de integración en la red evitando a los proveedores de datos: 1. Conexión permanente a internet (24/7), requerimientos hardware (servidor dedicado), IP estática, políticas de seguridad, etc. 2. La instalación y administración del software requerido (DiGIR provider), copias de seguridad, etc. Se ofertan dos opciones de uso: – Instituciones con un servidor de bases de datos disponible (Oracle, MS-SQLServer, MySQL): conexión y configuración del software – Instituciones que carecen de servidor: espacio en disco, conexión y mantenimiento. Primera asamblea de participantes de GBIF en España Qué es el Servicio de Alojamiento Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

4 GBIF Primera asamblea de participantes de GBIF en España Como se integra en la estructura de GBIF

5 GBIF Primera asamblea de participantes de GBIF en España Como se integra en la estructura de GBIF

6 GBIF Problemas técnicosTodo CorrectoSugerencias calidad de datos Transferencia Subida por SFTP de la Base de datos. Área de pre-producción Validación técnica y calidad de datos Publicación Base de datos pasa al área de producción http://data.gbif.org [http://es.mirror.gbif.org] http://www.gbif.es/datos [(re)Indexación] Primera asamblea de participantes de GBIF en España Proceso de provisión de datos Reporte [Corrección demorada] Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

7 GBIF Migración de versión del estándar DarwinCore Diseñado para facilitar el intercambio de información de datos primarios de biodiversidad a través de internet 2001-2003 The Species Analyst (Universidad de Kansas). Desde el 2004, TDWG Características: Para datos de colecciones y datos observacionales Mínimo común denominador. Recopila conceptos ampliamente utilizados por diferentes disciplinas que trabajan en biodiversidad Información en espacio y tiempo: El qué, el cuando y el dónde Simplicidad ( minimizando las barreras entre los proveedores de datos+maximizando la disponibilidad para los usuarios) Para intercambio, no para modelado de datos Versiones: http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/DarwinCoreVersions Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

8 GBIF DarwinCore2 (1.2) - versión actual 48 elementos no jerarquizados XML Schema: http://digir.net/schema/conceptual/darwin/2003/1.0/darwin2.xsd Estructurados en: Identificación Preparación y Conservación Recolección y Notas El cuándo El dónde Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro DateLastModified *InstitutionCode *CollectionCode *CatalogNumber * ScientificName *BasisOfRecordKingdomPhylum ClassOrderFamilyGenus SpeciesSubspeciesScientificNameAuthorIdentifiedBy YearIdentifiedMonthIdentifiedDayIdentifiedTypeStatus CollectorNumberFieldNumberCollectorYearCollected MonthCollectedDayCollectedJulianDayTimeOfDay ContinentOceanCountryStateProvinceCounty LocalityLongitudeLatitudeCoordinatePrecision BoundingBoxMinimumElevationMaximumElevationMinimumDepth MaximumDepthSexPreparationTypeIndividualCount PreviousCatalogNumberRelationshipTypeRelatedCatalogItemNotes Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

9 GBIF DarwinCore2 (1.4) - versión futura Formado por un núcleo central de elementos y una serie de extensiones con información adicional Core: (46 elementos) Elementos a nivel de registro Elementos taxonómicos Elementos de Identificación Elementos referentes a la localidad y localización Elementos referentes al evento de recolección Elementos biológicos Elementos de referencia: ImageURL, RelatedInformation Extension Curacional: Extensión Geoespacial Extensión Paleontológica Extensión para interacciones entre organismos Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

10 GBIF Servicio de Alojamiento de imágenes -Instalación de un servidor de imágenes: Almacenamiento de una única imagen y generación dinámica de x formatos (tamaños/calidades) Herramientas para la navegación remota sobre imágenes de gran calidad y detalle (mega y gigapixel size)(el cliente solo accede a la porción solicitada) - Para imágenes asociadas a los registros publicados en GBIF -Utilizando el nuevo estándar Dwc 1.4. Elementos: ImageURL, RelatedInformation Características del nuevo servicio: -Espacio para almacenamiento de imágenes para cada colección -Gestión de usuarios y espacio físico -Gestión de metadatos (automáticos para Herbar,Zoorbar) Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

11 GBIF Servicio de Alojamiento de imágenes Visualización de imágenes a través de los diferentes portales de datos con el visor del servidor (FSI Viewer) Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

12 GBIF Servicio de Alojamiento de información sobre especies + Portal de consulta de información de especies -Servicio de Alojamiento de información de especies: -Alojamiento de datos sobre especies. -Estructura similar al actual Servicio de Alojamiento de Datos de Especimenes y Observaciones -Diferente estándar de intercambio de datos utilizado. Plinian Core -Portal de consulta de información de especies -Interfaz similar al portal actual de datos de especímenes (http://data.gbif.org) -Conexión con datos de especímenes y observaciones Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid

13 GBIF Estadísticas de Uso de los datos a través del portal Internacional http://data.gbif.org/datasets/provider/57/logs/ - Visualización de informes vía web -Descarga de los.log en.zip -Ampliación en desarrollo. (Feedback de los usuarios necesario) Primera asamblea de participantes de GBIF en España Futuro Silvia Lusa Bernal-lusa@gbif.es 25 de abril de 2008, Real Jardín Botánico, Madrid