Febrero, 2009 Sistemas de informacion para la Red Latinpapa: Avances y perspectivas R. Simon., C.Aliaga.,L.Rojas.,V.Hualla y E.Salas Mejoramieto de germoplasma y de cultivos (GECI) y Unidad Informática para la Investigación (RIU)

Colaboradores GECI RIU E.Mihovilovich R.Simon W.Amoros V. Hualla M.Gastelo C.Aliaga G.Burgos L. Rojas M. Orrillo S. Trebejo B. Ordoñez Training A. Puccini M. Miky

Plataforma Información - Avances Sitio web - Catalog web y CD - Manejador de tareas - Migracion a nuevo hardware y upgrade de software - Revision de herramientas para manejo de datasets y analisis de datos (CIPPEX/CIPSTAT) - Planes Arquitectura de plataforma CIPPEX/CIPSTAT revisada - Elementos

Página Web RedLatinpapa FASE 1 - Se diagramó la web usando la Herramienta Wiki Confluence. - Se clasificó la información según área de interes y se colocó en la web. Ventajas - No se necesita de un programador para aumentar o actualizar contenido en la web. FASE 2 Se construyó el catálogo de clones usando PHP y MySQL (opensource) - Se recopiló información de SETs y de CIPPEX. -Se programó el motor de búsquedas para variables cuantitativas y cualitativas

Objetivo Primer año: Actualización de la información de Sets y Harvest Plust en CIPPEX: Libros de campo, datos de lab de procesamiento, lab de calidad y fotos. La información de 101 Clones avanzados de GECI han sido migrados al Catálogo digital de la RED. Base de Datos

Productos Primer año: 101 clones avanzados en Catálogo digital

JIRA: herramienta para manejo de tareas Features: -Disenado para tareas cumplidas -Posibilidades de monitoreo de avances -Alertas -Reportes -Integracion con Sitio web

Entrenamiento en JIRA: herramienta para manejo de tareas Hacemos click en Create New Issue para crear una nueva tarea

Pre breeding and Citogenic Objetivo Segundo Año: * Actualizar la información de Virus, Tizón Tardio y Pre mejoramiento en CIPPEX : Libros de campo, datos de lab de procesamiento, lab de calidad y fotos. La información de 200 Clones avanzados de GECI estarían a dispocisión de los socios a través del Catálogo digital de la RED. Herramientas CIPPEX/CIPSTAT a disposicion de socios

Contribucion CIP -Nuevo servidor -Ultimas versiones de software -Finalizar: Marzo 2009 Beneficios: -Mas rapido -Nuevas posibilidades: p.e. -Edicion de paginas web del sitio de Red desde Word Migracion a nuevo hardware y software

Principio: facilitar generacion de nueva informacion (sinergia)! Criterios: -Balance entre centralizacion y manejo local -Compartir datos y protocolos (de ensayos y analisis) -… pero no depender demasiado de connexion a la internet -Objetivos: -Herramientas para cada un socio -Herramientas para la red de socios -Transparencia para datos y analisis Revision de herramientas CIPPEX/CIPSTAT

Planes 2009: vision de arquitectura Kits para uso local Herramientas compartidos Manejo de datos Control de calidad de datos Analisis Catalogos Repositorio de datasets Integracion de datos Reportes estandarizados de datos Capacitacion: Buenas practicas compartidas

Planes 2009: implementacion de arquitectura Kits para uso local Herramientas compartidos Manejo de datos Control de calidad de datos Analisis Catalogos Repositorio de datasets Integracion de datos Reportes estandarizados de datos Capacitacion: Buenas practicas compartidas Forms pe.e ICG Uso de metadatos y otros Programas estadist. Kit de 2008 CIPPEX 2.0: un dataset = publicacion Data marts: p.e. biomart R y reportes reproducibles (con Sweave) Documentacion Eventos de capacitacion

Planes 2009: Repositorio CIPPEX 2.0 Ejemplo: pagina web en el mismo Confluence Features: -Atribucion de origen -Facilitar citacion formal -Historial de cambios -Alertas de updates -Control de acceso -Facilitar integridad de datos -Control de calidad

Planes 2009: Integracion de datasets optimizado para consultas biomart (e otros…) Demo: video

Planes 2009: Reportes reproducibles Demo: video