Nematología y Ecología de Suelos

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Transcripción de la presentación:

Nematología y Ecología de Suelos Clase 1 Introducción al Curso y los Nematodos 30 min talk Interactions: Nematodes affect other organisms, other organisms affect nematodes Nematodes feed on plants – plants provide food for nematodes. Nematodes feed on bacteria, nematodes farm bacteria – in soil, insects, bacteria feed nematodes, bacteria kill nematodes Nematodes feed on fungi and are fed upon by fungi. Nematodes feed on protozoa and microarthropods, tardigrades, mites, collembola and are fed upon What are the ecosystem effects (effects on functions)? Enrichment Movement of and to resources Nutrient and carbon cycling Nutrient and carbon movement and sequestration Effects on services? Antagonists of nematodes occur in many groups of organisms that are components of the soil food web.  The interactions of many soil organisms results in biological buffering or regulation of the nematode population through the mechanisms of Exploitation, Competition, and Antibiosis Howard Ferris e Ignacio Cid del Prado Vera 1

Ignacio Cid del Prado Vera ifit DEPARTMENT OF ENTOMOLOGY & NEMATOLOGY, UNIVERSITY OF CALIFORNIA Escuela de Posgrado, CATIE COLEGIO DE POSTGRADUADOS INSTITUTO DE FITOSANIDAD Howard Ferris Ignacio Cid del Prado Vera hferris@ucdavis.edu icid@colpos.mx

Nematología y Ecología de Suelos - Curso de Capacitación Lunes, Agosto 20 08:00-08:30 1. Inauguración - Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo 08:30-10:00 - Clase 1 - visión general de Phylum Nematoda y la ecología del suelo 1. Teoría  El ecosistema del suelo: los patrones espaciales, los vínculos, conectancia, las fuerzas de arriba abajo y de abajo hacia arriba, la gestión y la perturbación efectos. Visión general de la Phylum Nematoda, la diversidad, los hábitats, los papeles tróficos, grupos funcionales – situación manchones, paisaje, regional y mundial Características generales y diversidad de los nematodos Hábitos alimenticios Ecosistemas del suelo y su importancia Anatomía de nematodos y morfología, especialmente relacionada con su identificación. Powerpoint file 10:00-12:00, 13:00-15:00 2. Practica de laboratorio  Observación de especimenes en vivo y reconocimiento de las estructuras de alimentación, esófago y comparación de los estados juveniles y adultos con respecto al sistema reproductor Extracción por medio de la técnica de embudos de Baermann de las muestras de los estudiantes de su interés ….continuacion……

Lunes, Agosto 20 15:00-16:00 - Clase 2 – Systemas de clasificación 1. Taxonomía y Clasificación Ecológica  Vista general de la Clasificación filogenética Clasificación por hábitos alimenticios y su papel trófico (por Yeates) Clasificación basada en estructura del ecosistema (Bongers y Col.) Clasificación funcional ( Ferris y Col.) Powerpoint file- Clase 2 16:00-17:00 2. Demostración y discusión  Habilidad en el uso de las claves de identificación Recursos en línea como Nemaplex sobre la identificación, biología, ecologia y manejo  

Martes, Agosto 21 0800:0900 – Clase 3 – Nematodos Parásitos de Plantas 1. Teoría  Diversidad y características de nematodos parásitos de plantas Hábitos alimenticios en relación al tamaño del estilete, y morfología de las glándulas esofágicas Powerpoint file - Clase 3 Powerpoint file - Clase 3A   09:00-12:00, 13:00-17:00 2. Practica de laboratorio Observación de especimenes en vivo, pesca de nematodos parásitos de plantas y montaje temporal para observación e identificación con el uso del microscopio compuesto Observación y registro de las características variables de nematodos parásitos de plantas Uso de claves para la identificación a nivel de familia y género de nematodos parásitos de plantas Toma de nuevas muestras para su extracción con Embudos de Baermann Powerpoint file - Clase 3B 3. Tarea: Ejercicio usando Nemaplex sobre la diversidad y biología de nematodos parásitos de plantas. 

Miércoles, Agosto 22 08:00-09:00 – Clase 4 – Nematodos Bacteriófagos y Micofagos 1. Teoría Diversidad y características de nematodos bacteriófagos y micofagos Estructuras de la cavidad bucal en relación a los hábitos alimenticios Enriquecimiento de los oportunistas vs los grupos basales  Powerpoint file   09:00-12:00, 13:00-17:00 2. Practica del laboratorio Observación de especimenes en vivo, pesca de nematodos bacteriófagos y micofagos y montaje en preparaciones temporales para su identificación. Observación de las características morfológicas de nematodos bacteriófagos y micofagos Uso de claves para su identificación a nivel de familia. 3. Tarea Ejercicio en Nemaplex sobre la diversidad, biología y ecología de nematodos bacteriófagos y micofagos

Jueves, Agosto 23 08:00-09:00 – Clase 5 - Nematodos Omnívoros y Predatores 1. Teoría Diversidad y características de nematodos omnívoros y predatores Hábitos alimenticios y estructuras orales: estiletes vs estomas amplios, y características del esófago. "Gremios Estructurales" asignaciones Powerpoint file   09:00-12:00, 13:00-17:00 2. Practica del laboratorio Observación de especimenes en vivo, pesca de nematodos omnívoros y predatores y montaje en preparaciones temporales, para su identificación Observación de las características morfológicas de nematodos omnívoros y predatores Uso de claves para su identificación a nivel de familia. Demostración en el uso de claves para identificación de nematodos de los ordenes Dorylaimida y Mononchida 3. Tarea Ejercicio con Nemaplex sobre la diversidad, biología, y ecología de este grupo de nematodos.

Viernes, Agosto 24 a Domingo, Agosto 26 1. Trasladar a Veracruz – Estación Ecologico La Mancha – Nematodos y Ecologia del Suelo 2. Teoria Funciónes y servicios del ecosistemas de suelo Nematodos como indicadores de servicios y disservicios de ecosistemas Análisis de la fauna de nematodos e introducción para los índices metabólicos Muestreo para determinación de biomasa del organismos y servicios ecosistemas Powerpoint file - Clase 6 Powerpoint file - Clase 6A   3. Practica del laboratorio  Muestreo de nematodos de diferentes ecosistemas Extracción y identificación a nivel de familia Consideración del estructura y función des ecosistemas de suelo.. Consideración de tamaño de servicios ecosistemas Powerpoint Muestreo y tolerancias economicas Tarea Ejercicio en Nemaplex hacer un "Analisis Faunal" y calcular "Hellos Metabolicos“ Lunes, Agosto 27 08:00-17:00 1. Practica del laboratorio  Conteo de nematodos extraídos de las muestras de suelo del campo Extracción por centrifuga y montaje en preparaciones temporales Identifique 100 nematodos dependiendo de sus hábitos alimenticios Use el analizador de fauna Nemaplex, para cadenas alimenticias y condiciones ecológicas Entrega de un reporte de los grupos encontrados.

  Martes, Agosto 28 08:00-09:00 – Clase 7 – Parasitismo de Plantas 1. Teoria Biología y ciclo de vida de los nematodos que se alimentan de plantas: asociados de raíces, ectoparásitos, endoparásitos migratorios y sedentarios Interacciones huésped-parásito en los planos de plantas moleculares, celulares y toda la planta Conceptos de niveles de daño en plantas Powerpoint file - Clase 7 Nematodos ectoparasitos A Nematodos ectoparasitos B     09:00-17:00 2. Practica del laboratorio  Biología y ciclo de vida de los nematodos se alimentan de plantas: asociados de raíces, ectoparásitos, endoparásitos migratorios y sedentarios

Miercoles, Agosto 29 08:00-09:00 - Clase 8 - Nematodos de Cultivos Subtropicales y Tropicales 1. Teoria Nematodos de importancia de los cultivos subtropicales y tropicales - Plantas anuales y perennes  Powerpoint file - Clase 8   09:00-17:00 2. Practica del laboratorio  Nematodos de importancia en los cultivos subtropicales y tropicales - Plantas anuales y perennes Diseñar los sistemas de cultivo y de gestión de estos nematodos Jueves, Agosto 30 08:00-09:00 – Clase 9 - Nematodos de Cultivos de Climas Templados Nematodos de importancia en los cultivos de clima templado - anuales y perennes Los conceptos económicos de tolerancia, la optimización de la secuencia de cultivos Powerpoint file - Clase 9 Diseñar los sistemas de cultivo para la gestión de estos nematodos Powerpoint file - Clase 9A

Viernes, Agosto 31 08:00-09:00 – Clase 10 - Nematodos de el Paisaje y Sistemas Recreativos 1. Teoria Nematodos parásitos de plantas importantes en el paisaje, de sistemas recreativos y naturales Conceptos de gestión sostenible: la regulación de la población, la competencia, el antagonismo Otros métodos biológicos, físicos, químicos, culturales Los impactos sobre el sistema y el medio ambiente: la integración y la desintegración Powerpoint file - Clase 10      09:00-12:00 Practica del laboratorio  Simulaciones de secuencias de cultivos basadas en los atributos biológicos y el estado Powerpoint file - Clase 10A 13:00-15:00 Discusión Los efectos físicos de perturbación: el calor, la labranza, la aportación de materia orgánica, inundaciones, etc Interacciones con otros organismos: la competencia beneficiosa y perjudicial, los complejos de la enfermedad 15:00 Finalamente Discusión para aclarar dudas, preguntas en general de los temas tratados en el curso

Identificación e interéses de los participantes

Los Nematodos algunas estimaciónes de conveniencia de vida libre parásitos de animales parásitos de plantas marinos de vida libre algunas estimaciónes de conveniencia

4 de cada 5 animales multicelulares en el planeta son los nematodos Características de los nematodos (i) gusanos no segmentados (ii) simetría bilateral (iii) triploblasticos (iv) seudocoelomados (v) cutícula proteica (vi) cordones epidérmicos (vii) movimiento sinoidal (viii) sistema excretor simple, tubulares o glandulares (ix) sin sistema respiratorio (x) sin sistema circulatorio (xi) los sexos están separados (xii) escisión total de huevos (xiii) generalmete no metamorfosis (xiv) variación en tamaño de 0,2 mm a 9 metros (xv) hábitos de alimentación variada 4 de cada 5 animales multicelulares en el planeta son los nematodos Se encuentran en desiertos y en el fondo de lagos y ríos, en las aguas de fuentes termales y en los mares polares. Algunos sin boca se encuentran a profundidades enormes en el océano Noticias recientes: en este mes, nematodos bacteriófagos se han encontrado 1,3 kilómetros de profundidad en las minas de Sudáfrica

".....if all the matter in the universe except the nematodes were swept away, our world would still be dimly recognizable, and if, as disembodied spirits, we could then investigate it, we would find its mountains, hills, vales, rivers, lakes, and oceans represented by a film of nematodes. The location of towns would be decipherable, since for every massing of human beings there would be a corresponding massing of certain nematodes. Trees would still stand in ghostly rows representing our streets and highways. The location of various plants and animals would still be decipherable, and, had we sufficient knowledge, in many cases even their species would be determined by an examination of their erstwhile nematode parasites." N. A. Cobb – el padre de Nematologia Norte Americano

Formas morfologías parásito intestinal de humanos y animales

abertura anfidial grande nematodo marino

nematodo marino

nematodo de agua dulce

nematodo de suelo abertura anfidial pequeña

nematodo de suelo

región labial de un parásito de plantas

Las espículas de un parásito de plantas

estrías de la cutícula y el campo lateral

un nematodo de suelo con estrías grandes Criconemoides sp. un nematodo de suelo con estrías grandes

Cephalobidae Región labial con probolae

Diplogasterioidea Rhabditoidea Araeolaimida bulbo basal o postcorpus diente dientículos cavidad buccal seta anfidio intestino con válvulas estoma procorpus bulbo medio con válvula sin valvula istmo

Tylenchina Dorylaimida Mononchida Monhysterida cono astil o base nódulos procorpus bulbo medio istmo postcorpus intestino odontoestilete estilete extensión diente dientículos cavidad buccal setas anfidio esófago

Chromadorida Desmodorida Enoplida bulbo basal o postcorpus diente dientículos setas anfidio intestino cardia estrias cuticulares seta

Formas de las colas atenuada con espinerete conoide digitada filiforme Con spinneret atenuada con espinerete conoide digitada filiforme convexa conoide conoide curvada cylindroide redondiada mucronada multidigitada ventralmente arqueada subdigitada

Diversidad Funcional de Nematodos

especies individuales Funciones de Cadena Alimenticia del Suelo - actividades metabólicas y de comportamiento de los organismos que afectan los componentes bióticos y abióticos del ecosistema Alimentación: La ingestión, digestión, defecación y excreción    Comportamiento: El movimiento, la actividad, la migración    Las funciones pueden ser clasificadas, subjetivamente, como servicios, dis-servicios (o neutral) Dis-servicios: Dañan de las plantas de importancia agrícola o ornamental Dañan a los humanos y animales vertebrados Servicios: Secuestro y minerales redistribuón Mineralizar las moléculas orgánicas Acelerar “turnover” Regular y disminuir las plagas   Alterar sustrato para facilitar el acceso a otros organismos Redistribuir los organismos en el espacio Deshacer las toxinas Reducir la erosión del suelo Aumentar la producción agrícola Servicios de especies individuales Interactions: Nematodes affect other organisms, other organisms affect nematodes Nematodes feed on plants – plants provide food for nematodes. Nematodes feed on bacteria, nematodes farm bacteria – in soil, insects, bacteria feed nematodes, bacteria kill nematodes Nematodes feed on fungi and are fed upon by fungi. Nematodes feed on protozoa and microarthropods, tardigrades, mites, collembola and are fed upon What are the ecosystem effects (effects on functions)? Enrichment Movement of and to resources Nutrient and carbon cycling Nutrient and carbon movement and sequestration Effects on services? Antagonists of nematodes occur in many groups of organisms that are components of the soil food web.  The interactions of many soil organisms results in biological buffering or regulation of the nematode population through the mechanisms of Exploitation, Competition, and Antibiosis Servicios del comunidad 32

hidratos de carbono y proteínas Economía de los Ecosistemas: Carbono y Energía son las Monedas CO2 CO2 CO2 CO2 Los nematodos en cada nivel trófico protozoa nematodos bacteria hidratos de carbono y proteínas nematodos artropodos hongos C N hidratos de carbono y aminoácidos otro organismos nematodos artropodos nematodos hongos NO3 la transferencia de carbono y energía El carbono es respirado por todos los organismos Las cantidades de carbono y energía disponible determinar el tamaño y la actividad de la comunidad Recursos NH3 NH3 NH3

Factores que afectan la abundancia, diversidad y actividad de nematodos en el suelo   Recursos Plantas Tipo Actividad Distribución y abundancia de las raíces – vertical y horizontal Presa Nematodos Artrópodos Otros organismos multicelulares Bacteria Hongos Etc. Materiales organicos Distribución y abundancia Composición – C, N, calidad, edad Etapa de descomposición Obstinación

Factores que afectan la abundancia, diversidad y actividad de nematodos en el suelo Enemigos Naturales Nematodos Artrópodos Otros organismos multicelulares Bacteria Hongos Tardigradas Etc. Ambiente Temperatura Humedad Salinidad pH Caracteristicas del Suelo Textura Estructura Densidad Compactación y estratos impenetrable Agregación y estabilidad de los agregados

Factores que afectan la abundancia, diversidad y actividad de nematodos en el suelo   Tóxicos Pesticidas Fertilizantes Contaminantes Productos defensivos de las plantas Administración Rotación de cultivos Labranza Riego Enmienda de las recursos Caracteristicas de los Nematodos Sensibilidad a perturbación Ciclo de vida y fecundidad Nivel trófico Gremios estructurales

factores que afectan a los patrones espaciales Pratylenchus Meloidogyne factores que afectan a los patrones espaciales la textura del suelo Helicotylenchus Paratrichodorus

factores que afectan a los patrones espaciales Heterodera schachtii los patrones de movimiento de tierra y de labranza

factores que afectan a los patrones espaciales Tylenchorhynchus claytoni nematodo de achaparramiento biologia de los nematodos: movimiento y la agregación Meloidogyne incognita nematodo agallador

en campo de algodón – 2 años factores que afectan a los patrones espaciales distribución de las raices y labranza del suelo Xiphinema americanum y las raices de uva tiempo y edad de infestación Xiphinema americanum en campo de algodón – 2 años