Propiedades de regiones eucromaticas y heterocromaticas

Heterocromatina Facultativa (fHC) retiene el potencial de pasar a eucromatina

Cambios dinámicos entre varios estados de la cromatina

Arquitectura nuclear: distribución de zonas de distintas densidad cromatinica corte retina Tinción DNA cromocentros y lamina nuclear Zonas de alta densidad en cromatina condensada En bastones hay un solo cromocentro en el centro del núcleo En las demás células varios cromocentros y una lámina perinuclear

Distribución de bandas C, G y R C: Major satellite repeats (MSR) G: L1 (major class of long interspersed repeats) R: B (major class of short interspersed repeats in euchromatin) Conos Células ganglionaresfibroblastos Arquitectura nuclear: distribución de zonas de distintas densidad cromatinica

Arquitectura nuclear: distribución de genes genes silenciosos genes activos genes housekeeping cromocentros lamina DAPI En células ganglionares los genes están subrepresentados en la superficie nuclear, mientras que en bastone están enriquecidos en la periferia

El locus de la  -globina de gallina HS constitutivo Eucromatina o heterocromatina: diferente HS a la DNAsa I LCR: Locus control region Estos elementos son reguladores (enhancers) transcripcionales complejos que regulan la expresión de genes que se expresan ordenadamente durante el desarrollo o diferenciacion. Los LCRs se caracterizan por tener múltiples DHS (DNAseI hipersensitive sites). Se distinguen de los enhancers por su capacidad de conferir a un transgen un nivel de expresión independientemente de la posición donde se inserte y proporcional al numero de copias Se atribuye a los LCRs un rol dominante en la apertura de la cromatina, una fuerte actividad enhancer y la capacidad de establecer dominios de modificación de histonas.

b t b b b b b t DNAsa I HS en el locus de la  -globina de gallina b: bazo t: timo kb

NF-M murine neurofilamente gene inactivo Análisis de la sensibilidad generalizada a la DNAsa I durante el desarrollo  expresión DNAsa I

DNAseI-chip method para estudiar la distribución genómica de DHS hibridar simultaneamente con una biblioteca formada por un DNA cortado al azar, sin haber tratado con DNAsaI

Identificación a escala genómica de sitios de DHS en células CD4+ T

Correlacion DHS (celeste) con nivel de expresion Distribución de la posicion de los DHS Ubicación de los DHS alrededor del TSS

Localizacion de las mono-, di- y tri- metilaciones en K9 en células MEF 3mK9 localiza en regiones pericentromericas 2mK9 y 1mK9 localizan en regiones eucromaticas

HMT G9a dirige las mono- y di-metilaciones en K9

HMT Suv39h1 y Suv39h2 dirigen las trimetilaciones en K9 DN: doble mutante

Arquitectura nuclear: distribución de las modificaciones de histonas marcador de eucromatina marcadores de heterocromatina

Cambios en las modificaciones de histonas al pasar de eu a hetero cromatina

HP1 y sus interacciones WT anti-HP1 DAPI anti-HMT myc3-SUV39H1 -- myc3H324L mutante inactiva de SUV39H1

mapeo de alta resolucion de la localizacion de Swi6 (HP1) en el locus Mat de S.pombe

Distribución de la H3-K9 metilada en el locus Mat

Distribución de la H3-K4 metilada en el locus Mat

Distribución de Swi6, H3-K9 met o H3-K4 met en el locus Mat al delecionar los elementos aislantes

Distribución de las proteínas de ClrC Cul4 Rik1 Raf1 Raf2 Rbx1 Clr4

Clr4 HMT escribe y lee cromo domain SET domain Clr4

Figure 7 Model showing RNAi-mediated nucleation and spreading of heterochromatin. RNAi factors such as RITS, RDRC and Dicer, involved in processing of repeat transcripts (red line) into siRNAs, are required for targeting of ClrC to the heterochromatic repeats. siRNA-bound Ago1 is likely to specify the targeting of RITS to nascent repeat transcripts. RITS then facilitates ClrC loading. Rik1 might also directly associate with the repeat transcript and/or some part of the elongating RNAPII complex, thus promoting ClrC loading to nucleate heterochromatin. After the initial methylation of H3K9 by ClrC, Clr4 bound to H3K9me could modify adjacent nucleosomes creating additional binding sites for ClrC and other chromodomain proteins including Swi6 and Chp2 (HPs), which in turn mediate recruitment of factors such as SHREC, thereby promoting higher-order chromatin organization. Swi6 could further contribute to long-range heterochromatin spreading by promoting higher-order chromatin organization by forming oligomers and stabilizing the ClrC binding to chromatin. Boundary DNA elements block inappropriate spreading of heterochromatin into euchromatic regions. Green flag, histone acetylation; red lollipops, H3K9me Modelo de nucleación y propaganción de heterocromatina