Mètodes d'anàlisi de dades de biodiversitat

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Transcripción de la presentación:

Mètodes d'anàlisi de dades de biodiversitat Xavier Font* Jordi Carreras* Francesc Oliva** *Departament de Biologia Vegetal, Universitat de Barcelona ** Departament de Bioestadística, Universitat de Barcelona

Datos sobre biodiversidad Conservación/Protección Autoría del dato Criterios IUCN, Leyes,etc. P. Pando Class: Insecta Taxonomía y nomenclatura Order: Lepidoptera Mapa genético Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796 Locus: AAL35331 Definition: acyl-CoA Z/E11 desaturase 1 mvpyattadg hpekdecfed... Family: Pyralidae Genus: Ostrinia Hübner, 1825 Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796) Descripción Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; … Vernacular (EN): European Corn-borer Vernacular (ES): Piral del maíz Vernacular (FR): Pyrale du maïs Bibliografía i recursos Web Familia: Gramineae Pheromones of Ostrinia http://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/acree/pheronet/phlist/ostrinia.html Alimentación: Zea mais L. Colección: LU Lepidoptera Record id: LU_003217 País: Galicia Coordenadas 03.047˚E 48.730˚N Fecha: 28 Junio 2005 Recolector: P. Pando Interaciones ecológicas Datos abiòticos Especimen y observación Average Rainfall Location: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ... 182.3 120.6 158.1 204.9 ...

Coordenadas 03.047˚E 48.730˚N Fecha: 28 Junio 2005 Species: Ostrinia nubilalis Coordenadas 03.047˚E 48.730˚N Fecha: 28 Junio 2005 P. Pando Datos abiòticos Average Rainfall Location: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ... 182.3 120.6 158.1 204.9 ...

Fuentes de información:

En este momento estamos en un momento de gran efervescencia. Vamos a ver los distintos niveles de bases de datos y la implementación de una estructura de datos en una autonomia Catalunya

Proyectos de informatización de datos de Biodiversidad en España Estatales -Proyecto Anthos (http://www.anthos.es/) -Nodo nacional GBIF (http://www.gbif.es/gbifes.php -SIVIM (http://www.sivim.info) -Banco de datos de la Naturaleza (http://www.magrama.gob.es/es/biodiversidad/servicios/banco-datos-naturaleza/) Autonómicos -Banco de datos de Cataluña (http://biodiver.bio.ub.es/biocat/) -Atlas de la flora de Aragón (http://www.ipe.csic.es/floragon/) -El Banco de datos de Biodiversidad de la comunidad Valenciana (http://bdb.cma.gva.es) -Biota”, de la Comunidad Autónoma de Canarias (http://www.gobcan.es/medioambiente/biodiversidad/ceplam/ bancodatos/biotaespecies.html) -Otros en desarrollo (Illes Balears y País Vasco) Illes BalearsInstitucionales (museos, institutos de botánica, etc.) Real Jardín Botánico (CSIC), Herbario de Criptogamia http://www.rjb.csic.es/herbario/crypto/crydbe.htm Herbario de la Universidad de Granada (http://drimys.ugr.es/) CeDocBiV (http://herbaribcn.ub.es/biocase/cgi/querytool.py País Vasc

Proyectos de informatización de datos de Biodiversidad en España Institucionales (museos, institutos de botánica, etc.) -Real Jardín Botánico (CSIC), Herbario de Criptogamia http://www.rjb.csic.es/herbario/crypto/crydbe.htm -Herbario de la Universidad de Granada (http://drimys.ugr.es/) -CeDocBiV (http://herbaribcn.ub.es/biocase/cgi/querytool.py Illes BalearsInstitucionales (museos, institutos de botánica, etc.) Real Jardín Botánico (CSIC), Herbario de Criptogamia http://www.rjb.csic.es/herbario/crypto/crydbe.htm Herbario de la Universidad de Granada (http://drimys.ugr.es/) CeDocBiV (http://herbaribcn.ub.es/biocase/cgi/querytool.py País Vasc

Proyectos de informatización de datos de Biodiversidad Internacionales -GBIF (http://www.gbif.org) para España http://www.gbif.org/country/ES -BioCase (http://www.biocase.org) Illes BalearsInstitucionales (museos, institutos de botánica, etc.) Real Jardín Botánico (CSIC), Herbario de Criptogamia http://www.rjb.csic.es/herbario/crypto/crydbe.htm Herbario de la Universidad de Granada (http://drimys.ugr.es/) CeDocBiV (http://herbaribcn.ub.es/biocase/cgi/querytool.py País Vasc

Datos GBIF Data Providers 266 Datasets 7621 Searchable records 266   Datasets 7621   Searchable records 151,222,333 

Datos GBIF 30.956.394 registros con coordenadas

Yucca Araucaria Xanthorrhoea WMS Araucaria = Servicio Web Cartography WMS Xanthorrhoea WMS Araucaria = Servicio Web = Programa gratuïto = de pago

Todo el software de VegAna está escrito en lenguaje Java, que permite que funcione en todas las plataformas que soportan el Java Virtual Machine (JVM). Por ejemplo: Linux, Windos o Mac. Principalmente, se distribuye mediante un modo basado en la web, gracias a la tecnología Java Web Start. Una vez se tiene el Java instalado, los programas de VegAna pueden iniciarse tan solo con el enlace de vuestro navegador de internet.   http://biodiver.bio.ub.es/vegana/ 

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