El Nodo Español de la iniciativa GBIF

2 Que es GBIF Implementación de GBIF en España Las colecciones como prioridad de GBIF Retos que plantea la explotación de la información de las colecciones Sumario El Nodo Español de la iniciativa GBIF y el papel de las colecciones en el mismo

3 Iniciativa GBIF Es una iniciativa internacional, a 10 años vista, para hacer accesible por Internet toda la información disponible sobre los organismos vivos conocidos a nivel mundial (se ha hablado de GBIF como el proyecto genoma humano de la biodiversidad) A instancias de la OCDE (1996, MegaScience Forum) Los miembros ordinarios de GBIF son estados Los estados miembros se comprometen a establecer un nodo nacional de GBIF que –entre otras cosas-- será portal de esta información, además contribuyen económicamente a la inciativa Global Biodiversity Information Facility Infraestructura Mundial de Información en Biodiversidad

4 Junio de 1999: el Consejo de Ministros de la OCDE acuerda crear GBIF Marzo del 2001: GBIF nace oficialmente 2002: La Secretaría Mundial del GBIF se instala en Copenague 2003: Primer plan de trabajo anual de GBIF y primeras convocatorias de proyectos y contratos Cronología de GBIF

5 Informatización de las colecciones de Historia Natural Tecnología e interoperabilidad de bases de datos Catálogo electrónico de nombres científicos Formación y cooperación Species bank: bases de datos con información sobre especies (descripciones, claves, imágenes, …) Biblioteca Virtual de la Biodiversidad Programas temáticos Iniciativa GBIF

El catálogo electrónico de nombres de organismos conocidos para la ciencia posibilitará el enlace entre muchos tipos de bases de datos biológicas y no biológicas Iniciativa GBIF Contenidos y relaciones

7 España firma el MoU Plan de actuación Abril 2001 Resolución del MCYT Sesiones informativas Trabajos iniciales GBIF.ES UC, arranca De la voluntad política a la realidad GBIF en España Febrero 2001 Invierno 2002 Otoño 2002 Julio 2002 Julio 2003

8 Museo Nacional de Ciencias Naturales Real Jardín Botánico Resolución del MCYT Consejo Superior de Investigaciones Científicas Nodo Nacional de GBIF Unidad de Coordinación Impleméntación GBIF en España

9 –Estructura en red (U. coordinación + centros y proyectos) –Unidad de Coordinación dentro de un centro –Sin presupuesto para financiar proyectos Propuesta de implementación GBIF en España ANEP

10 El sistema de información del nodo español del GBIF está formado por una Unidad de Coordinación (UC) y por una federación de bases de datos integrada por los Centros Asociados a la Red (CAR) GBIF.ES = UC +CAR GBIF en España Acceso unificado Información distribuída Los proveedores de datos retienen el control sobre los mismos

11 Esta misión se plasma en las siguientes tareas: Proporcionar soporte técnico (información, formación, estándares, software y asesoramiento) Asegurar la coherencia entre las iniciativas nacionales y la arquitectura informática de GBIF, para garantizar la interoperabilidad Investigar como maximizar el valor de los datos, al desarrollar herramientas de análisis, validación y visualización de los mismos Recopilar y difundir información relevante para las colecciones y para el conocimiento y gestión de la información sobre biodiversidad GBIF en España Unidad de Coordinación Misión: apoyar a las colecciones, centros y proyectos relevantes sobre biodiversidad para que participen en GBIF

12 Decisiones iniciales: –Nombre, logotipo, ubicación de la UdC, acuerdos de cooperación con el CTI del CSIC, y con los departamentos pertinentes del MCYT (ahora MEC) Acciones iniciales: –Contratación de personal, instalaciones informáticas y de comunicación, presencia Web ( –Plan de formación y apoyo, implementación de una plataforma DIGIR, herramientas de informatización, … –Estado de las colecciones y proyectos de biodiversidad en España Proyectos: –2 de seed money del GBIF –13 Acciones Especiales del Ministerio GBIF en España Actividades

13 Conocer la situación Establecer líneas de actuación y prioridades Informe disponible en Sobre la base de datos de BioCase Colecciones: informe En total: 101 colecciones GBIF en España

14 Distinta magnitud según la disciplina Esfuerzos de informatización en marcha GBIF en España Colecciones: informatización

15 47 herbarios y más de 4 millones de especímenes GBIF en España Colecciones: Botánica

16 49 colecciones y más de 12 millones de especímenes 98% de los especímenes en 12 colecciones GBIF en España Colecciones: Zoología

17 Por el tamaño: posición intermedia Por el número de colecciones: alta dispersión Diferente situación entre la Botánica y la Zoología en cuanto a: –Tamaño –Proyectos de informatización y acceso a datos (Acciones especiales del MCYT: 13 = 9 +4) –Organización GBIF en España Colecciones: puntos a recordar

18 AHIM 1992: Primera reunión de trabajo (herbarios portugueses y españoles) 1994: Se constituye formalmente 2004: Miembros: 46 centros y 25 individuos

19 Boletín Foro de Internet Asamblea anual Exsiccata Viajes de recolección Sitio Web Aplicación para informatizar colecciones AHIM: actividades

20 Fauna iberica Flora iberica Flora Micológica Ibérica Flora Lichenologica Iberica Flora Briofítica Ibérica Flora Phycologica Iberica Proyecto Biota-Especies (Islas Canarias)Proyecto Biota-Especies (Islas Canarias) GBIF en España Proyectos de biodiversidad (en curso)

21 GBIF en España Colecciones y proyectos Proyectos Centros Colecciones Formación y cooperación Informatización de las colecciones de Historia Natural Biblioteca virtual de la biodiversidad Tecnología e interoperabilidad de bases de datos Catálogo electrónico de nombres científicos Species Bank

22 Informatización de las colecciones de historia natural Tecnología e interoperabilidad de bases de datos Catálogo electrónico de nombres científicos Formación y cooperación Species bank: bases de datos con información sobre especies (descripciones, claves, imágenes,…) Biblioteca Virtual de la Biodiversidad Programas temáticos de GBIF: Papel de las colecciones en GBIF Informatización de las colecciones de Historia Natural

23 Porqué las colecciones son prioritarias: Fuente primaria de información Proporcionan la mayor y más fiable fuente de información sobre la biodiversidad del planeta Los ejemplares de las colecciones son falsables –Calidad, reproducibilidad … y GBIF es Ciencia Papel de las colecciones en GBIF

24 Colecciones de Historia Natural Base del trabajo Resultado del trabajo

25 Esta es la diferencia clave entre las colecciones y otras fuentes de información (Literatura, observaciones, base de datos a nivel de especies,...) La información esta disponible para ser revisada y reevaluada

26 Información en las colecciones de personas de habitat / ecológica el ejemplar (est. moleculares, biometría,..) histórica / fenológica taxonómica de localidad / distribución

27 Para que sirven la información de las colecciones Para todo: –Salud pública –Contaminación ambiental (DDT, Hg, …) –Agricultura (plagas, OGM,...) –Pérdida de habitat –Especies invasoras –Cambio climático –… Suarez, A.V. & Tsutsui, N.D. ( 2004). The Value of Museum Collections for Research and Society. BioScience 54 (1): 66-74

28 Retos que plantean el uso de esta información 1.Acceso a la información de una colección 2.Acceso a la información de todas las colecciones 3.Acceso a la información para la sociedad

29 1. Acceso a la información de una colección Con base de datos múltiples índices múltiples usos Acceso tradicional a la información : n-1 tareas complicadas o imposibles

30 Al añadir los puntos correspondientes al resto de las colecciones ibéricas, aparecen áreas nuevas considerables Las colecciones, y por tanto su información, son un recurso distribuido. Los datos de todas la colecciones son necesarios Prácticamente la mitad de estos ejemplares (c ) se conservan en el herbario del Real Jardín Botánico, que es la colección de referencia para estos grupos Un caso: ejemplares de varios grupos de hongos (Aphyllophorales, Gasteromycetes s.l. y Myxomycetes) de la península ibérica: registros (solo datos georeferenciados) 2. Acceso a la información de todas las colecciones

31 Acceso unificado, información distribuida Red GBIF Precursores: REMIB de Conabio, México TSA de Univ. Kansas 2. Acceso a la información de todas las colecciones: la solución

32 ( Iniciado en diciembre 2003 ) Provedores de datos: 21 países 4 organizaciones registros 2. Acceso a la información de todas las colecciones: red GBIF

33 Base para el acceso unificado: Perfil común: Las bases de datos de los centros – cada una con su propia estructura y sistema– se exportan a otra con el perfil de la red; una tabla con campos comunes que resultan accesibles de manera uniforme Estándares: 2. Acceso a la información de todas las colecciones: perfil común

34 Los usuarios de la información sobre biodiversidad se encuentran con el escollo de que la misma especie se puede citar con distintos nombres, o que un mismo nombre puede hacer referencia a especies (o conceptos de especie) diferentes 3. Acceso a la información para la sociedad

35 Ejemplo: el helecho macho Fl. iberica Dryopteris filix-mas Dryopteris affinis ssp. affinis ssp. borreri ssp. stilluppensis Dryopteris oreades Dryopteris submontana Dryopteris pallida ssp. pallida spp. balearica Dryopteris carthusana Dryopteris expansa Dryopteris dilatata Fl. Països Catalans Dryopteris austriaca ssp. assimilis ssp. dilatata ssp. spinulosa Dryopteris filix-mas ssp. borreri ssp. filix-mas ssp. oreades Dryopteris villarii ssp. submontana ssp. balearica

36 ssp. affinis D. affinis D. filix-mas spp. filix-mas D. filix-mas D. oreades ssp. oreades ssp. stilluppensis ssp. borreri Fl. iberica Fl. Paisos Catalans Ejemplo: nombres y conceptos

37 By Nozomi Ytow & al. Ejemplo: nombres y conceptos Abstracción y generalización

38 Koperski & al Referenzliste der Moose Deutschlands: 45% de los táxones son inestables Clasificaciones vigentes alternativas: –Fl. iberica, –Fl. Països Catalans –Fl. Andalucía Occidental –Fl. Europaea –Med. Check List 5+ Información implícita: Identificaciones en las colecciones no indican la taxonomía usada 3. Acceso a la información para la sociedad: ¿Como de grande es el problema?

39 Retos que plantean el uso de la información de las colecciones 1. Acceso a la información de una colección 2. Acceso a la información de todas las colecciones 3. Acceso a la información para la sociedad –Se necesitan herramientas de visualización y algoritmos que den cuenta de los posible conflictos de los nombres y de los conceptos de las identificaciones –Es conveniente registrar la taxonomía empleada en las identificaciones, tanto en las etiquetas como en las bases de datos

40 Cada colección grande o pequeña es una pieza importante para entender y conocer la biodiversidad en la tierra a todas las escalas GBIF es la iniciativa que hace posible que las colecciones jueguen el papel que merecen en el conocimiento y gestión de la biodiversidad La misión del nodo español de GBIF es la de facilitar la participación en GBIF de colecciones y proyectos colaborando con ellos y aportando soporte técnico Sin colecciones no hay ciencia de la biodiversidad, sin ciencia, no hay buen conocimiento, sin buen conocimiento no puede haber ni buen uso, ni buena conservación de la biodiversidad Conclusiones

41 Créditos GBIF.ES, Unidad de Coordinación Marisa Esteban Silvia Lusa Jesús Fernandez David Rodríquez Isabel Ortega Nodo Nacional de BioCase Carmen Dieguez Mercedes Paris Francisco Sastrón Jorge Lobo