(1)Long Ranged Interactions: Electrostatics Dominant Forces in Protein Folding Termódinamica y Cinetica del Plegamiento de Proteínas Dr. Edgar Vazquez.

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1 (1)Long Ranged Interactions: Electrostatics Dominant Forces in Protein Folding Termódinamica y Cinetica del Plegamiento de Proteínas Dr. Edgar Vazquez -Contreras

2 Se puede tratar a una proteína nativa como una partícula esférica impenetrable con su carga neta uniformemente distribuida en la superficie, conforme a esto predijo el número de protones unidos a superficie y la carga neta en función a la concentración de iones hidronio.  Linderstrom Lang Recientemente se ha incluido a este concepto:  I. La consideración de cargas discretas localizadas en posiciones ESPECÍFICAS en la estructura esférica de la proteína nativa.  II.Tomar en cuenta las desviaciones de la forma esférica en un modelo de la estructura nativa  III. El desarrollo de la teoría electroestática para la proteína desplegada.

3 ¿Cómo afectan las Interacciones Electrostáticas la Estabilidad de las Proteínas?  Electrostática Clásica  Electrostática Clásica: Repulsiones no específicas que surgen cuando una proteína esta muy cargada pH extremos. -Al aumentar la carga de la proteína nativa, conforme se aumente la acidez o basicidad de una solución, se incrementará la repulsión lo cual desestabilizará a la proteína.

4 Estas cargas deben de surgir de la superficie de la proteína en vez de encontrarse en el interior de la proteína. (Un puente salino / 150-residuos) -Por medio de la cristalografía de Rayos X se pudo comprobar que es común encontrar puentes salinos en la superficie de la proteína. -Variaciones en la secuencia que afecten los residuos necesarios para llevar acabo puentes salinos disminuyen la estabilidad, el mismo efecto se aprecia cuando se introducen nuevos sitios.  Interacciones de Carga Específica: Los puentes salinos ocurren cuando cadenas de aa cargados con el signo opuesto se acercan espacialmente. Estabilidad ( En 1930 se atribuyó que los puentes salinos tienen un efecto dominante en la estabilidad de las proteínas.)

5 Puentes salinos no es la única fuerza dominante en el plegamiento Protonación: NH 2 A NH 3 + (-4mL/mol) Deprotonación: COOH a COO- (-10mL/mol) -El plegamiento da un incremento en el volumen

6  Puentes salinos no están muy conservados en la evolución.  El número de estas interacciones iónicas es pequeño (5 puentes salinos/ 150 residuos de la proteína), por lo tanto es muy improbable que cualquier interacción que involucre tan solo 10 residuos sea el causante del plegamiento de las proteínas.