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1 Tutorial de Uso Metamorph: Montaje de videos. Unidad de Microscopia.

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1 1 Tutorial de Uso Metamorph: Montaje de videos. Unidad de Microscopia

2 2 Introducción. Entre las principales aplicaciones del METAMORPH está la posibilidad de realizar : TIMELAPSE(Series Temporales). Z –SERIES (Series en z). Una vez obtenida la secuencia de capturas para cualquiera de estas 2 aplicaciones es posible montar un video. ¿cómo ? 1-Para Timelapse hay que realizar 2 pasos : 1º- montar un visor galeria para cada grupo de imágenes. 2º- montar el video a partir del visor galería creado previamente. 2-Para Z-Series es suficiente con 1 único paso : las capturas en Z se guardan directamente en formato Visor galeríay a partir de estas se puede montar DIRECTAMENTE un video o bien fusionar todos los planos en una única imagen.

3 3 Como interpretar los archivos guardados tras captura Como interpretar los archivos guardados para el montaje de video. Los archivos capturados en un TIMELAPSE se deben interpretar del siguiente modo para el montaje de videos: (1)-Se genera una copia con extensión_THUMB de cada archivo de captura, estos no deben montarse,son archivos accesorios que el programa necesita temporalmente para permitir el montaje de la película. Solo nos interesan el resto de archivos (2)-Los archivos se guardan (y deben montarse) en grupos: por número de canales usados en el experimento(extensión inicial) y por puntos(s) y tiempos de muestreo(t). Así cada archivo presentará -un código inicial del canal de captura: luz transmitida,GFP,Cy3,etc y -un código final para puntos y tiempos de muestreo: S(space)(punto de muestreo) T(time)(tiempo de muestreo) De este modo,tendremos que montar cada grupo de imágenes para cada canal y punto de muestreo. (1) (2) -En este caso deberíamos montar 4 grupos de series: para 2 canales (luz transmitida y GFP) y 2 puntos de muestreo (s1 y s2) para cada canal. -Integrando para cada una de estas 4 series la fusión de los archivos de los 5 tiempos de muestreo(t1-t5)

4 4 Montar PELICULAS 1 THUMBS THUMBS Muy iportante los archivos thums no son mas que pequeñas muestras de la captura pará ver en un modo galeria global. No son necesarios para el montaje de peliculas y podemos deseellcionar su guardado para no acomplejatr el proceso de montaje de videos mediante la deseelccion de la correspodiente casilla en EDIT: IMAGE PREFERENCES. Los thumbs pueden usarse para ver la galeria en el modo BUILD CATALOG del FILE Imágenes integradas en un MODO VISOR GALERIA 4

5 5 Paso 1: montar un VISOR GALERIA Montaje Video Paso 1: MONTAR VISOR GALERIA(secuencia de capturas). (1)Abrimos en el menú OPEN>>Open Special >>Build Stack>>Numbered Names (2)Se abrirá una nueva pantalla donde tenemos q seleccionar FIRST IMAGE....así vamos a la carpeta donde hemos guardado nuestras capturas y seleccionamos la primera imagen de la serie a montar: las capturas están nombradas y separadas para cada canal/fluorocromo de captura y con extensiones finales numéricas para los puntos de muestreo(S) y tiempos de Captura (T). (3)Clicamos en OK en la primera imagen de la serie a montar(first image) y a continuación introduciremos la última captura para esa serie (last image). (4)-Clicamos en OK y se generará un VISOR GALERIA que integra el total de capturas de la serie montada y por el cual podemos movernos a través de una barra corredera (barra superior). Guardamos nuestra galería para poder montar posteriormente una película si nos interesase Imágenes integradas en un MODO VISOR GALERIA 4

6 6 Paso 2: montar un VIDEO Montaje de Videos PASO 2: MONTAJE DE VIDEOS Una vez montado el visor galería podemos crear, a partir de este, una película de video. ¿CÓMO MONTAR LA PELICULA ? (1)- Vamos a STACK >> STACK MOVIE (2)-Abrimos el VISOR creado previamente y lo cargamos en SOURCE STACK (3)-Seleccionamos los planos del total que queremos integrar en nuestra película. (4)-Seleccionamos FORMATO : bien.avi(mediaplayer) o bien.mov(quicktime) -Seleccionamos frames para la película (un valor de 1-3 es adecuado). -Clicamos en SAVE y creamos el video de nuestra secuencia de capturas(antes de guardar deberemos elegir formato de compresión para la película, por defecto usamos modo SIN COMPRESIÓN )

7 Tutorial Metamorph: Montaje de Videos -Introducción Como interpretar los archivos guardados tras captura Paso 1: montar un visor galería Paso 2: montar un video

8 8 Unidad de Microscopía Centro de Investigación del Cáncer Campus Miguel de Unamuno Salamanca (Spain).


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