Diseño en bloques y medidas repetidas

Presentación del tema: "Diseño en bloques y medidas repetidas"— Transcripción de la presentación:

1 Diseño en bloques y medidas repetidas
Diseño experimental 2137 Juan C. Benavides Tomado en parte de:

2 “I would stress that there are many more ways than one of carrying out experimental work, and only with a knowledge of the basic principles of the available methods, and a good acquaintance with the sources of variation of the experimental material, can the experimenter hope to arrive at an efficient technique.“ Yates 1935 Sokal 1995

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4 Efectos fijos y efectos aleatorios
Los tratamientos tiene un efecto sistematico y predecible en la población Usa todos los tratamientos de un factor Efectos aleatorios No tiene un efecto determinado o predecible La dirección del efecto no es de interes (no se examinan diferencias en los promedios) Los niveles de los tratamientos usados son extraidos de una gran población pero no sabemos cuales son o cuantos

5 Anova de dos vias vs bloques
Quinn 2002

6 Efectos fijos (profundidad) x bloque (día)
Sokal 1995

7 Diseño en bloques aleatorios
5 tratamientos de fertilización en 4 sitios (bloques) No debe haber interacción Una anova de dos vías sin replicación?? Sin interacción?? Sokal 1995

8 Restriccion en la aleatorización
 Before we apply our five fertilizer treatments to each of the four blocks of land, each block will have to be prepared by  plowing. sowing seed, dressing soil, and so forth. This operation is unique for each block. Given the vagaries of human performance it cannot be exactly repeated for the same block in  succeeding years Sokal 1995

9 Diseño en bloques aleatorios
Aleatorización del experimento esta restringida a grupos de las unidades experimentales (muestras individuales) dentro de una unidad considerada homogénea (bloque)  It is important to  note that each treatment must be present in every block. Sokal 1995

10 Efectos fijos (profundidad) x bloque (día)
Kuehl 2001

11 Modelos mixtos Machiavelli, 2013

12 Ejemplo Fertilizante en vegetación

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14 Bloques Study site Diseño experimental 5 bloques
4 tratamientos por bloque 3 fertilización, 1 control

15 NPP entre tratamientos
#fertilization experiment #two dates #5 plots each ith 4 fertilization treatments #three readings, two production measuremntes npp<-read.csv("npp.csv",header=TRUE) #select only one date of measurements npp2<-subset(npp,times=="06/14/11") plot(npp~treatment,data=npp2)

16 NPP entre tratamientos
#anova con la interaccion bloques x tratamientos fit1<-lm(npp~treatment*plot,data=npp2) aov1<-anova(fit1) #anova sin la interaccion fit2<-lm(npp~treatment+plot,data=npp2) aov2<-anova(fit2) TukeyHSD(aov2,”treatment”) #prueba de homogeneidad de varianzas de levene en el paquete car library(car) levene1<-leveneTest(npp~treatment,data=npp2) #prueba de normalidad de los residuos shapiro.test(fit2$residuals)

17 Grupos NPP entre tratamientos (Tukey)
#anova sin la interaccion aov2<-aov(fit2) TukeyHSD(aov2,"treatment") #solo funciona con aov library(agricolae) out<-HSD.test(fit2 ,"treatment") out

18 Y que tal si hay mas de un tipo de bloque? Cuadrado latino
Cual aditivo es major para el rendimiento de un vehiculo? 4 vehiculos (cars) 4 conductores 4 aditivos latin<-read.csv("latin.csv",header=TRUE) fit3<-lm(mpg~aditive+car+driver,data=latin)

19 Y que tal si hay mas de un tipo de bloque? Cuadrado latino

20 Y que tal si hay mas de un tipo de bloque? Cuadrado latino

21 Interacciones escondidas en bloques
latin2<-read.csv("latin2.csv",header=TRUE) fit3<-lm(mpg~aditive+car+driver,data=latin2) anova(fit3) plot(fit3)

22 Taller

23 https://livejaverianaedu-my. sharepoint