o caracteres derivados compartidos por un grupo de organismos

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Transcripción de la presentación:

o caracteres derivados compartidos por un grupo de organismos CLADISTICA metodología de reconstrucción filogenética, basada en un tipo especial de similitud LAS SINAPOMORFÍAS o caracteres derivados compartidos por un grupo de organismos es decir caracteres que se han modificado respecto de cómo los encontramos en ancestros más lejanos Un ejemplo: las medusas, las estrellas de mar y los humanos ¿Quiénes están más cercanamente emparentados?

¿POR QUÉ ES MEJOR AGRUPAR POR SINAPOMORFÍAS? permite hacer clasificaciones que reflejen mejor la historia evolutiva y tengan un mayor valor predictivo permite hacer inferencias de cómo funciona la evolución, al mostrar cómo un carácter se ha modificado a lo largo de la historia permite hacer estudios de adaptación

ALGUNAS SUPOSICIONES 1) todo grupo de organismos está relacionado por descendencia de un ancestro común 2) existe un patrón de bifurcación en la formación de las ramas del árbol (cladogénesis) 3) ocurren cambios en los caracteres a lo largo de la historia evolutiva 4) los caracteres cambian de manera independiente 5) el mejor árbol es aquel que postula el menor número de pasos para explicar los cambios en los caracteres (criterio de parsimonia)

Australopithecus afarensis Homo habilis Homo sapiens neanderthalensis ¿CÓMO CONSTRUÍR UN CLADOGRAMA? 1) elección del INGROUP, es decir el grupo de organismos cuyas relaciones se quieren determinar Australopithecus afarensis Homo habilis Homo sapiens neanderthalensis Australopithecus africanus Homo heidelbergensis Homo sapiens sapiens

Secuencias de proteínas Caracteres morfológicos 2) determinación de los caracteres que se van a utilizar Secuencias de ADN Secuencias de proteínas Caracteres morfológicos Caracteres embriológicos Caracteres comportamentales Caracteres ecológicos

3) determinación de los estados posibles para cada carácter y codificación de los mismos

4)elección de un OUTGROUP o varios, que permitan dar polaridad a los caracteres al enraizar el árbol Pan Gorilla H.habilis Pan A. afarensis A. africanus H.s. sapiens Gorilla

5)construcción de una matriz de caracteres

Parsimonia de Carmin y Sokal Parsimonia de transversiones 6) elección del tipo de parsimonia que se va a utilizar (criterio de “optimality”) Parsimonia de Fitch Parsimonia de Wagner Parsimonia de Dollo Parsimonia de Carmin y Sokal Parsimonia de transversiones Parsimonia generalizada

7) búsqueda del/los árbol/es más corto/s mediante algoritmos exactos o heurísticos

Índice de consistencia 8) aplicación de índices y métodos de remuestreo que den soporte a los grupos establecidos por el/los árboles Índice de consistencia Índice de retención Decisividad Bremer support Bootstrap Jacknife

Búsquedas exhautivas Algoritmos exactos Métodos de branch-and-bound Búsqueda de árboles As is Stepwise addition Closest Métodos heurísticos NNI Branch swapping SPR TBR

Branch swapping