Los niveles de organización estructural del DNA : Estructura Primaria

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Transcripción de la presentación:

Los niveles de organización estructural del DNA : Estructura Primaria Estructura Secundaria Estructura Terciaria Estructura Cuaternaria Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

DNA circular y DNA lineal Superenrollamientos del DNA Estructura Terciaria DNA circular y DNA lineal Superenrollamientos del DNA Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

DNA circular y DNA lineal Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

Si tomamos un par de cuerdas o cadenas paralelas y giramos ( retorcemos ) una sobre la otra en dirección izquierda, el resultado será una doble cadena dextrógira; es decir, una doble cadena en que cada cadena gira hacia la derecha ( dirección de las agujas de reloj ) sobre la otra durante el movimiento de avance. Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

Si seguimos el movimiento de avance de un punto imaginario en la cadena, vemos que realiza un movimiento de giro a la derecha ( giro de las agujas de reloj ) al sobre el eje de la doble cadena. (también lo realiza sobre la otra cadena). Esto es cierto para las dos cadenas en ambas direcciones Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

DNA circular y DNA lineal Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

Ejemplos de DNA circular : DNA mitocondrial DNA genómico bacteriano Plásmidos Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

DNA mitocondrial humano (16569 bp ) La mitocondria tuvo en el pasado un interés restringido a los estudiosos de la citología, la bioquímica metabólica y la bioenergética. Sin embargo, desde hace pocos años la mitocondria humana se encuentra en un primer plano de la actualidad de las ciencias biomédicas. Este cambio radical se fundamenta en varios hechos : El conocimiento de un numeroso grupo de enfermedades genéticas metabólicas, entre las cuales figuran más de medio centenar debidas a mutaciones puntuales consistentes en la sustitución de unas bases por otras, afectando a distintos genes del genoma mitocondrial. A ello hay que añadir los varios cientos de mutaciones no puntuales como son reordenaciones genéticas del tipo de las delecciones o las inserciones de fragmentos de DNA de distinto tamaño. Este aspecto de la mitocondria humana ha llamado la atención de los científicos interesados en la terapia génica. 2) La utilidad del DNA mitocondrial como un marcador de gran fiabilidad en antropología molecular para el estudio de la evolución humana, los flujos migratorios, etc. Utilidad que se extiende a la ciencia forense, por su valor como marcador en la identificación de personas o el esclarecimiento de relaciones de parentesco. 3) La bioquímica metabólica ha acrecentado los conocimientos sobre el papel central de la mitocondria en el metabolismo celular. Al mismo tiempo se han clarificado definitivamente los aspectos bioenergéticos de la mitocondria en relación con el transporte de electrones, la fosforilación oxidativa y el necesario acoplamiento de ambos procesos. EL DNA MITOCONDRIAL HUMANO Y SU EXPRESIÓN http:// www.lab314.com Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

4) Nuevos aspectos que prometen ser decisivos son su participación en el cáncer y las enfermedades neurodegenerativas. Su interés creciente en oncología se debe a su papel central en la apoptosis o suicidio celular, que impide en condiciones normales el desarrollo de tumores. El genoma humano es el conjunto del DNA humano, conteniendo los genes. Dicho DNA está organizado en forma de cromosomas. Una célula somática típica tiene en su núcleo 46 cromosomas. A este número ( 46 ) se llama número diploide de la especie humana. Sin embargo, existe un cromosoma 47 en el genoma humano : es el pequeño cromosoma mitocondrial. En el siguiente esquema podemos observar como en una célula somática típica el DNA se encuentra repartido en dos fracciones : Genoma Nuclear y Genoma Mitocondrial Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

Peso molecular : 5.060.609 daltons Cadena H Genoma Nuclear : Genoma nuclear o DNA de los 46 cromosomas nucleares. Los cromosomas son moléculas lineales de DNA, y entre todos suman un tamaño total de 6.000 millones de pares de bases ( GC y AT ) constituyendo la fracción del genoma mayoritaria. De tal forma que el tamaño medio de los cromosomas humanos es de unos 130 millones de pares de bases. El genoma humano tiene un número aproximado de 30.000 genes. Genoma Mitocondrial : Genoma mitocondrial humano. Constituido por un solo cromosoma, que es una molécula circular de DNA de un tamaño de 16569 pares de bases ( 8000 veces menor que el cromosoma medio ). Este tamaño de 16569 bp corresponde al primer DNA que se secuenció y es el DNA "secuencia Cambridge". Otras variantes tienen distinto tamaño ; así el DNA mitocondrial "secuencia africana" tiene 16559, mientras la "secuencia sueca" tiene 16570 bp. En cuanto a su número, hay que precisar que la mayoría de las células tienen varios cientos de mitocondrias. Además cada mitocondria tiene varias moléculas de DNA, con lo que el número de copias del cromosoma circular en cada célula es de varios miles. En la molécula de DNA circular de mitocondria las dos cadenas complementarias tienen una proporción de C y G muy dispar, y por ello tienen un peso molecular muy distinto. Para distinguirlas hablamos de cadena H o pesada ( heavy ) y cadena L o ligera ( light ). Cadena L  Composición en bases (total bases : 16569): 5122 A ; 5180 C ;  2171 G ;  4096 T Peso molecular : 5.060.609 daltons Cadena H Composición en bases (total bases : 16569): 4096 A ; 2171 C ; 5180 G ; 5122 T Peso molecular : 5.168.726 daltons Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

El DNA genómico bacteriano : Cromosoma El cromosoma bacteriano es circular. El Cromosoma de Haemophilus influenzae tiene una longitud de 1.830.000 bp El Cromosoma de Escherichia Coli tiene una longitud de 4.640.000 bp Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

El DNA plasmídico Plásmidos Cromosoma Los plásmidos son moléculas de DNA circular Su tamaño varía desde menos de 1.000 bp hasta unos 250.000 bp Son cromosomas con capacidad de replicación independiente del cromosoma bacteriano Son portadores de información genética “adicional” para la bacteria ( genes de resistencia a antibióticos, degradación de metabolitos, etc ) Tienen gran importancia en Biología Molecular e Ingeniería Genética como vectores Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

Mapa de Restricción de pUC18 y pUC19 ( se diferencian la secuencia de MCS ) Los pUC son vectores típicos de Clonaje. Vemos que su tamaño es de 2686 bp Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

El plásmido precursor de los vectores de clonaje y expresión : pBR322 se utilizó para la construcción de otros plásmidos útiles en Biología Molecular e Ingeniería Genética. Su tamaño es de 4361 bp Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid

DNA lineal Los 24 cromosomas nucleares del genoma humano son moléculas lineales de DNA Chromosome # Genes # of Bases Chromosome 1 2968 279 million bases Chromosome 2 2288 251 million bases Chromosome 3 2032 221 million bases Chromosome 4 1297 197 million bases Chromosome 5 1643 198 million bases Chromosome 6 1963 176 million bases Chromosome 7 1443 163 million bases Chromosome 8 1127 148 million bases Chromosome 9 1299 140 million bases Chromosome 10 1440 143 million bases Chromosome 11 2093 Chromosome 12 1652 142 million bases Chromosome 13 748 118 million bases Chromosome 14 1098 107 million bases Chromosome 15 1122 100 million bases Chromosome 16 104 million bases Chromosome 17 1576 88 million bases Chromosome 18 766 86 million bases Chromosome 19 1454 72 million bases Chromosome 20 927 66 million bases Chromosome 21 303 45 million bases Chromosome 22 288 48 million bases Chromosome X 1184 Chromosome Y 231 51 million bases 16569 bp Realizado por Dr. A. Martínez-Conde & Dra P. Mayor Dep. Bioquímica y Biología Molecular Fac. Medicina Universidad Complutense de Madrid