De DNA a proteína
Los genes se expresan con diferente eficiencia
El mecanismo de transcripción
Diferentes clases de ARN´s
Transcripción en bacterias
Initiation Elongation Termination The promoter functions as a recognition site for transcription factors The transcription factors enable RNA polymerase to bind to the promoter forming a closed promoter complex Following binding, the DNA is denatured into a bubble known as the open promoter complex, or simply an open complex Elongation RNA polymerase slides along the DNA in an open complex to synthesize the RNA transcript Termination A termination signal is reached that causes RNA polymerase to dissociated from the DNA
La cadena codificante tiene la misma secuencia que el transcrito
Carácterísticas del promotor
Los promotores tienen orientación
La dirección de la transcripción de los genes puede variar en el cromosoma
La ARN polimerasa es la encargada de copiar el ADN
Factores sigma (s)
Existen diferentes estados en la iniciación
Elongación de la cadena
URNA-ADNA apareamiento es débil La RNA polimerasa se detiene Terminación de la transcripción terminadores intrínsecos NusA URNA-ADNA apareamiento es débil No se necesita una proteína para remover físicamente a la RNA polimerasa del DNA La RNA polimerasa se detiene
La proteína Rho es una helicasa Terminadores dependientes de Rho rho utilization site La proteína Rho es una helicasa sitios rut Note: This is an intrastrand RNA:RNA interaction (folding stabilized by H-bonding of A-U and C-G)
Mensajes policistrónicos
Estructura de los mRNA
Transcripción en eucariontes
ARN polimerasas Structure of a bacterial RNA polymerase Structure of a eukaryotic RNA polymerase II
Diferentes tipos de ARN polimerasas
Generalmente una adenina Los promotores eucariontes también tienen sitios consenso Generalmente una adenina El núcleo del promotor es relativamente corto consiste de la caja TATA, quién es importante para determinar el sitio preciso del inicio de la transcripción El núcleo del promotor por sí mismo produce una transcripción de bajo nivel conocida como transcripción basal
Transcripción basal (factores de transcripción)
TFIIH plays a major role in the formation of the open complex A close complex TFIIH plays a major role in the formation of the open complex It has several subunits that perform different functions One subunit hydrolyzes ATP and phosphorylates a domain in RNA pol II known as the carboxyl terminal domain (CTD) This releases the contact between TFIIB and RNA pol II Other subunits act as helicases Promote the formation of the open complex Released after the open complex is formed RNA pol II can now proceed to the elongation stage
Factores de transcripción
Proteínas activadoras de la transcripción
Procesamiento del ARN
Adición del CAP La fosfatasa remueve un fosfato del 5´ 2) Una guanil transferasa agrega GMP 3) Una metil transferasa agrega un grupo metilo
Intrones del grupo I y II (autocatálisis)
Genes estructurales En eucariontes, la transcripción de genes estructurales produce un transcrito largo conocido como pre-mRNA ó RNA heterogéneo nuclear (hnRNA) Este RNA es alterado por corte y otras modificaciones antes de salir del núcleo. El corte requiere de la ayuda de un multicomponente estructural conocido como “espliceosoma”
Existen secuencias específicas en los límites exón-intrón
Intron loops out and exons brought closer together Moléculas de RNA-proteína (snRNP) son las responsables del corte Intron loops out and exons brought closer together
Intron will be degraded and the snRNPs used again
Puede existir corte alternativo en los genes
El corte alternativo puede producir varias isoformas a partir de un gen
Terminación (Poliadenilación)
El RNA es cortado y la enzima Poli-A polimerasa (PAP) agrega A´s
Proteínas de unión al poli-A se unen al extremo 3´ hasta que el mensaje sale del núcleo