El análisis de los caracteres cuantitativos

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Transcripción de la presentación:

El análisis de los caracteres cuantitativos El modelo aditivo

Tipos de Acción génica Aditividad

Tipos de Acción génica Dominancia

Tipos de Acción génica Sobredominancia

Tipos de Acción génica Epistasis

¿Como calcular [d] y [h]? Partiendo de 2 líneas puras P1(A1A1) y P2 (A2A2) y su F1 (A1A2) podemos aplicar directamente para obtener [d] y [h]: (A1A1- A2A2)= 2[d]= (1/n) S(2di) (A1A2)= [h]= (1/n) S hi Sin embargo de esta manera no podemos estimar el error de la estimación

F2 = 1/4 [d] + 1/2[h] + 1/4[-d]= 1/2[h] Teniendo en cuenta las relaciones mendelianas en F2 para un locus (1/4 A1A1, 1/2 A1A2, 1/4 A2A2) para el conjunto de todos los poligenes responsables del carácter tendremos: F2 º 1/4P1 + 1/2F1 + 1/4P2 Y, por tanto (omitiendo acciones epistáticas) la esperanza de la media de la F2 es: F2 = 1/4 [d] + 1/2[h] + 1/4[-d]= 1/2[h] Este gen contribuye a la suma total de cuadrados en: 1/4 [d]2 + 1/2[h]2 + 1/4[-d] 2= 1/2[d]2 + 1/2[h]2 Puesto que la media de esta generación es 1/2[h], la varianza de la F2 es: 1/2[d]2 + 1/2[h]2 - 1/4[h]2= 1/2[d]2 + 1/4[h]2

Con los valores [d] y [h] se calculan mediante las ecuaciones anteriores los valores esperados. La comparación de éstos con los correspondientes observados de dichas medias generacionales, indica si el modelo aditivo se cumple o no. Este método da valores directos de aditividad y dominancia. Pero solo es útil en caso de dominancia unidireccional. Por lo tanto se prefieren medidas basadas en los cuadrados de los efectos correspondientes: Sd2 y Sh2. Ö[Shi2/ Sdi2 ] es una estimación de [h]/[d] sin los inconvenientes de ésta.

que representaremos como antes: F2 = 1/2 [h] VarF2 = 1/2[d2]+ 1/4 [h2] Genotipos: A1A1 A1A2 A2A2 Frecuencias: 1/4 1/2 Valores: d h -d La media y la varianza de los valores genotípicos, sin incluir el ambiente, de esta generación se calculan de la forma usual, resultando: F2 = 1/2 h VarF2 = 1/2d2 + 1/4 h2 Para todos los loci involucrados (siempre en ausencia de epistasia y ligamiento): VarF2 = 1/2 Sdi2 + 1/4 Shi2 que representaremos como antes: F2 = 1/2 [h] VarF2 = 1/2[d2]+ 1/4 [h2]

En los retrocruzamientos tendremos: Genotipos: A1A1 A1A2 A2A2 Frecuencias: 1/2 Valores: d h -d Medias y varianzas son: R1 = 1/2 d + 1/2h R2= -1/2 d + 1/2h VarR1 = 1/4d2 + 1/4h2- 1/2 dh VarR2 = 1/4d2 + 1/4h2+ 1/2 dh Al igual que en el caso de la F2 esto es generalizable a varios loci sin interacción y sin ligamiento: VarR1+VarR2= 1/2 [d2]+ ½[h2]

F3= 1/4[h] y los retrocruzamientos R1 y R2 R1 = 1/2 [d] + 1/2[h] y R2= 1/2 [-d] + 1/2[h]

Parecido entre parientes Lo que se trasmiten son los genes, no los genotipos. Lo que hereda el hijo del padre es la mitad de su valor aditivo El más inmediato el calcular la cov hijos-padres: Cov(P,H)=1/2 VA Para que se cumpla esta relación se debe dar la independencia entre los valores aditivos dominantes y entre los valores genéticos y ambientales.

Cov (VA, VD)=4pq(p-q)Fah En aquellas poblaciones donde exista un cierto grado de consaguineidad, Cov (VA, VD)=4pq(p-q)Fah Siendo a=d+h(q-p)

Heredabilidad sensu estricto Si se manejan los cruzamientos entre líneas puras, podemos considerar, teniendo en cuenta que [d2] solo depende de los valores aditivos d, y [h2] a la existencia de dominancia h. VA= 1/2 Sd2 y VD= 1/4 Sh2 y, VarF2 = 1/2[d2]+ 1/4 [h2]=VA+VD Y asimismo, VR1+VR2=VA+2VD

VarMF2 = VarMR1= VarMR2= VM Ahora, considerando el efecto ambiental y admitiendo que este afecta igual a todas las generaciones: VarMF2 = VarMR1= VarMR2= VM Y las varianzas fenotípicas, únicas medibles en los datos naturales, serán: VF2 = VA+VD+VM VR1+VR2=VA+2VD+VM Que nos lleva a calcular los componentes genéticos de dichas varianzas en función de las varianzas calculadas: VA=2 VF2 – (VR1+VR2) VD+VM= (VR1+VR2)- VF2

Respuesta a la selección artifical h2r = heredabilidad realizada y = Media fenotípica en la población parental y0 = Media fenotípica en la descendencia yp = Media fenotípica de los individuos seleccionados h2r = Y0 - Y Yp - Y = Respuesta Diferencial de selección h2r =

Selección

Manejo de genes cualitativos y algunas técnicas básicas

La Hibridación a.) pétalos b.) estigma c.) pistilo d.) estambres e.) base de los pétalos f.) cáliz 

C. annuum var. Dutch Red C. chinense var. Orange Habanero: Dutch-Habanero F1

Complementación

Doble recesivo

Doble dominante

Segregación transgresiva

Introducción de un dominante

Introducción de un recesivo

Número de individuos necesarios