Proteínas Estructura y función Estructura tridimencional

Presentación del tema: "Proteínas Estructura y función Estructura tridimencional"— Transcripción de la presentación:

1 Proteínas Estructura y función Estructura tridimencional
Comportamiento en solución

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3 Distribución de la regiones hidrofílicas en una proteína globular
No-polares Polares

4 Dominios

5 Estructura cuaternaria
Asociación de dos o más cadena polipeptídicas para formar una unidad completa. Estructura cuaternaria de la hemoglobina

6 F1-F0-ATPasa Dominio versus subunidad

7 Proteínas fibrosas vs globulares
Globulares Fibrosas 1. Estructura compacta Estructura extendida 2. Solubles en agua o lípidos Insoluble en agua o lípidos 3. Estructura secundaria compleja Estructura secundaria simple mezcla de a-hélice, b-plegadas un sólo tipo 4. Estructura cuaternaria estabilizada Estructura cuaternaria estabilizada por interacciones no covalentes enlaces covalentes

8 Proteínas fibrosas a-Keratina permanentes
Ejemplo de estructura cuaternaria left-handed supertwisted coiled coil permanentes Disulfide (-S-S-) bonds stabilize the quarternary structure

9 Colágeno Alto contenido en gly y aminoácidos modificados (Gly-X-Y)
- hidroxiprolina - hidroxilisina

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11 ¿Qué importancia tiene la conformación de una proteína?
Las diez enzimas de la glicólisis

12 Enfermedades producidas por mal plegamiento

13 Priones Comparison of the three-dimensional structures of the normal prion protein (A) with a model of the pathological form (B).

14 ¿Se puede predicir la estructura de una proteína?
If the sequence holds the secrets of folding, can we figure it out? Modelo predictivo de Chou-Fasman: a cada aminoácido se le asigna la tendencia a formar estructura secundaria

15 Mecanismo de plegamiento de las proteínas
¿Qué conformación tendría esta proteína? Ejemplo: si tiene 100 aminoácidos con dos orientaciones espaciales, la proteína podría adoptar conformaciones posibles.

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17 ¿Se puede predicir la estructura de una proteína?
KQFTKCELSQNLYDIDGYGRIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENDESTEYGLFQISNALWCKSSQSPQSRNICDITCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWIAHKALCTEKLEQWLCEKE KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL Similaridad de secuencias Homología 8lyz 1alc Uso como modelo

18 Protein DataBank (PDB)
Repository of models of tertiary structure Some single folds NMR: 7,400 X-ray: 58,000

19 Resumen La función de una proteína está dada por su estructura
Diferente secuencia  diferente estructura La predicción de la estructura secundaria es dífícil, la predicción de la estructura terciaria es imposible

20 Solubilidad de las proteínas
pH Constante dieléctrica del solvente Fuerza iónica Temperatura

21 Efecto del pH en la solubilidad de las proteínas

22 Constantes dieléctricas y momento dipolar de algunos solventes comunes

23 Solubilidad de la carboxi-Hb a diferentes fuerza iónicas
Efecto de la fuerza iónica en la solubilidad de las proteínas Salting in Salting out Solubilidad de la carboxi-Hb a diferentes fuerza iónicas

24 Desnaturación de proteínas
Urea