Subtipificación Molecular Shigella spp. para la Vigilancia de Shigella spp. en Argentina Avances y Metas 2006-2008 23 al 25 de octubre 2007 Mariana Pichel.

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1 Subtipificación Molecular Shigella spp. para la Vigilancia de Shigella spp. en Argentina Avances y Metas 2006-2008 23 al 25 de octubre 2007 Mariana Pichel Angela Salve María Rosa Viñas Departamento Bacteriología Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas – ANLIS “Carlos G. Malbrán”

2 Actividades Desarrolladas  Implementación del protocolo estandarizado de PFGE de la Red PulseNet -CDC para Shigella sonnei (Certificación, 2006 y Prueba de Competencia, 2007). Protocolo aplicable también a aislamientos de S.boydii.  Criterios de selección : -S. sonnei: se seleccionaron aislamientos, considerando la inclusión de cepas de diferentes lugares y tiempos de aislamiento y todos aquellos relacionados a sospecha de brote. - S. boydii: estudio de dos brotes y de aislamientos esporádicos  Creación de la Base de Datos Nacional

3 Shigella spp. Shigella spp. Base de Datos Nacional (2002 - 2007 ) Base de Datos Nacional (2002 - 2007 ) EspeciesdeShigella Nº de aislamientos Periodo 2002 -2007 Nº de patrones de XbaI-PFGE/ Nº aislamientos Nº de patrones de BlnI-PFGE/ Nº aislamientos S.sonneiS.boydii223 25 25 124 /223 124 /223 13 /25 13 /25 (10 patrones de 15 aislamientos esporádicos) 12 /40 * 3 /10 ** 3 /10 ** * S.sonnei: 40 aislamientos correspondientes a 6 brotes ** S.boydii: 10 aislamientos correspondientes a 2 brotes, que mostraron 3 patrones de XbaI-PFGE y BlnI-PFGE

4 Brotes y clusters 2006 – 2007 analizados por XbaI-PFGE y BlnI-PFGE FechaEspecieProvincia Tipo de brote Nºaisl. Nº patrones con XbaI-PFGE Abril 2006 S. sonnei Entre Ríos Entre Ríos Comunitario sin confirmación 14 14 2 perfiles relacionados Enero 2007 S. sonnei La Pampa Comunitario sin confirmación 20 20 4 perfiles relacionados (17aisl.)y 3 no relacionados. Brotes confirmados por el laboratorio y epidemiologíaFecha Especie y serotipo Provincia Tipo de brote Nºaisl Nº patrones con XbaI-PFGE Abril 2006 S. boydii 4 Mendoza MendozaComunitario (Comedor universitario) 31 Marzo 2007 S. sonnei San Luis Familiar 21 Enero 2007 S. boydii 2 Neuquén NeuquénComunitario (Viaje de egresados) 72 Detección de “clusters” identificado por el laboratorio y sin confirmación epidemiológica

5 Dendrograma de relación genética de Shigella boydii XbaI-PFGE

6 Dendrograma de relación genética de Shigella boydii por BlnI-PFGE.

7 METAS 2008  Incorporar la aplicación de PFGE en forma activa en la vigilancia de Shigella spp. en Argentina.  Asignación de patrones en la Base de Datos Nacional e ingreso de patrones y datos de aislamientos humanos a la Base de Datos Regional en tiempo real (aislamientos 2006-2007).  Participar del control de calidad anual para Shigella sonnei mediante la prueba de competencia para la realización de geles y análisis remitida por el CDC, USA