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Genética bacteriana E. coli
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Selección de mutantes en bacterias
Prototrófico : Son bacterias silvestres que pueden crecer en medios mínimos (sales inorgánicas, fuente de carbono –glucosa- y agua). A partir de estas sustancias mínimas las bacterias pueden construir todas las macromoléculas necesarias para vivir. Auxotrófico : Las bacterias son generalmente mutantes y no pueden crecer al menos que se adicionen al medio nutrientes específicos ( Adenina, biotina, metionina, etc.) Resistencia o susceptibilidad a antibióticos
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Plásmidos Varian en tamaño. En general se replican de manera autónoma.
Tienen un origen de replicación y controlan su número de copias.
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Tipos de plásmidos Plásmidos de fertilidad (F): los cuales contienen información que les permite conjugarse. Plásmidos de resistencia (R ): los cuales contienen genes que pueden constituir resistencia contra antibióticos o venenos. Históricamente conocidos como Factores R. Col-plásmidos: los cuales contienen genes que codifican (determinan la producción de) colinas y proteínas que pueden matar a otra bacteria.
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Vías de intercambio de genes entre bacterias
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Transformación bacteriana
Incorporación e integración de un ADN extraño al cromosoma bacteriano
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Bacteriofago T4 virulento
Transduccion Bacteriofago T4 virulento
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Ciclo lítico de los fagos
(fagos virulentos)
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Bacteriófago l (temperado)
lítica lisogénica
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Transducción generalizada
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Transducción especializada
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Integración del bacteriófago
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Virus de Eucariontes (Retrovirus)
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Virus de la Influenza
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Conjugación bacteriana
E. coli F+ (Factor de fertilidad) F - Pili F+ Plásmido F *Plásmido F codifica alrededor de 100 genes
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Descubrimiento del fenómeno de conjugación
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Las células tienen que estar en contacto No hubo modificación genética
para modificarse No hubo modificación genética
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El plásmido F Genes de conjugación
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Conjugación
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Conjugación F+ F- F+ F+ La cadena sencilla se replica
para generar el plásmido F de doble cadena F- F+ F+
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Conjugación Resultados de la conjugación
Los receptores adquieren el factor F Se convierten de F– a F+ Los plásmidos F pueden adquirir nuevos genes Se les llama factores F’ F’ puede introducir genes y alterar el genotipo
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Cepas Hfr 1950s, Luca Cavalli-Sforza descubrió una cepa eficiente en transferir genes cromosómicos Designada cepa Hfr (high frequency of recombination) Hfr resultan de la integración del factor F al cromosoma
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Conjugación Hfr Conjugación entre una Hfr & F– transfiere una porción del cromosoma del Hfr Origen de transferencia del factor F Sitio de inicio y dirección de la transferencia Toma hrs la transferencia del cromosoma entero del Hfr Solamente una porción del genoma del Hfr pasa a la célula F- Las células F– no se transforman en F+ o Hfr Las células F– adquieren ADN del donador Se recombina con segmentos homologos en el ADN receptor
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orden de transferencia lac+ – pro+
Conjugación Hfr F– lac+ pro– orden de transferencia lac+ – pro+ F– lac+ pro+
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Dos eventos de recombinación
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La transferencia de ADN no es recíproca
La bacteria donadora es la que contribuye con un fracción de material genético a la bacteria receptora El fragmento de DNA donado es llamado exogenota y el genoma receptor el endogenota Una bacteria que contiene el exogenota y el endogenota se conoce como merocigoto ó diploide parcial a b+ Exogenota Endogenota a b-
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Factores F con genes bacterianos
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Factor F´
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Técnica del apareamiento interrumpido
Elie Wollman & François Jacob En qué se basa: El cromosoma del Hfr se transfiere linealmente Se interrumpe la transferencia a diferentes tiempos diferentes longitudes de ADN han sido transferidas El orden de los genes en el cromosoma se deduce por el cambio observado en la célula receptora a diferentes tiempos.
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Mapeo por conjugación interrumpida
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Mapeo de genes bacterianos usando conjugación
Hfr strs azir gal+ lac+ ton+ F- strr azis gal- lac- ton-
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Una mutante de E. coli no puede sintetizar triptofano (trp-). Para
determinar la localización del gene en el cromosoma, se realizan experimentos de conjugación interrumpida con 4 diferentes Hfr´s que contienen los alelos dominantes de los respectivos genes, mientras que la cepa F- tiene los recesivos. HfrA man+ (1) trp+(9) aro+(17) gal+(20) lac+ (29) thr+ (37) Hfr B trp+ (6) man (14) his (22) tyr (34) met (42) arg (48) HfrC thr (3) ilv+ (20) xyl+ (25) arg+ (33) met+ (39) tyr+ (47) HfrD met+ (2) arg+ (8) xyl+ (16) ilv+ (21) thr+ (38) lac+ (46) Construye la secuencia de genes en el cromosoma, considerando thr como tiempo 0 y que el marcador lac está a la derecha de thr thr lac 0/100
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Tarea: Construir el siguiente mapa en función a las conjugaciones
HFr A: man (1) trp(9) aro(17) gal (20) lac (29) thr (37) HFr B: trp(6) man (14) his(22) tyr (34) met (42) arg(48) HFr C: thr (3) ilv(20) xyl(25) arg(33) met (39) tyr (47) HFr D: met(2) arg(8) xyl(16) ilv(21) thr (38) lac (46) Tomando en cuenta que el genotipo del receptor es: thr- ilv- xyl- arg- met+ tyr+ his- man- trp+ aro- gal+ lac+ Conjugación de F- con HFrA por 12 minutos: HFr A: man (1) trp(9) aro(17) gal (20) lac (29) thr (37) ¿Cómo será el fenotipo del receptor después de la conjugación?
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Elementos genéticos transponibles
Los elementos de secuencias de inserción (IS) son segmentos de DNA que pueden moverse de una posición cromosómica a otra del mismo cromosoma o diferente. Cuando los IS aparecen en medio de los genes, pueden interrumpir la secuencia codificante e inactivar la expresión del gen. Fueron descubiertos por primera vez en E.coli en el operon gal y son los transposones más simples. Tienen entre 700 y 1500 pb; son frecuentes en bacteriófagos y plásmidos Transposasa
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Transposones en procariontes Secuencias de inserción (IS)
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transposon Repetidos directos– secuencias de DNA que son identicas y van en la misma dirección (5’3’) Repetidos invertidos- secuencias de DNA que son identicas pero van en direcciones opuestas 5’ ATGACTGAC 3’ 3’ TACTGACTG 5’ 5’ ATGACTGAC 3’ 3’ TACTGACTG 5’ y 5’ CTGACTCTT 3’ 3’ GACTGAGAA 5’ 5’ AAGAGTCAG 3’ 3’ TTCTCAGTC 5’ y
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Transposones compuestos
Contiene genes adicionales no necesarios para la transposición Solo las secuencias repetidas invertidas son importantes para la transposición
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Plásmidos R con el mapa de transposones
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Mecanismo de transposición
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They are in the same direction and are repeated at both ends of the element
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Dos formas de transposición
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Transposones de eucariontes
Transposones de ADN Retrotransposones
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Transposones en humano
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