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Arturo Arismendi Espinosa

Publicada porSamuel Salas Piñeiro Modificado hace 6 años

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Presentación del tema: "Arturo Arismendi Espinosa "— Transcripción de la presentación:

1 Technological platform for the analysis of genomic and transcriptomic data
Arturo Arismendi Espinosa Grupo de Inmunología Evolutiva e Inmunogenética Instituto de Genética de la Universidad Nacional Grupo internacional de investigación en informática comunicaciones y gestión del conocimiento Universidad Distrital Francisco José de Caldas

2 Generate data

3 Data Analysis

4 Processing Process Software Description Preprocessing
FASTQC; FASTXTOOLKIT; PICARD Evaluate quality of data Assemble VELVET, ABYSS, MULTIPLE-K Assenble sequences Anotation BLAST, DESCARGA DE BASES DE DATOS Compare sequences vs data bases. Gene expression Quantification R, DEGSEQ, TOP HAT, CUFFLINKS  Quantify how the sequences represented are in the sequence assembled

5 Software for Assembly

6 Actual work Acropora Digitefera. Coral reefs. Environment.
Endangered specie.

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