3 de junio 2009 Biocinves 09 CINVESTAV Unidad Irapuato Departamento de Ingeniería Genética.

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1 3 de junio 2009 Biocinves 09 CINVESTAV Unidad Irapuato Departamento de Ingeniería Genética

2 CINVESTAV Unidad Irapuato Depto. de Ingeniería Genética 6/2/2016 Biocinves 09 Departamento de Ingeniería Genética Biotecnología, Cultivo de Tejidos y Transformación Genética Estudios Genéticos y Epigenéticos Metabolómica y Proteómica Interacción planta – patógeno y relaciones mutualistas Genómica y Biología Sintética

3 CINVESTAV Unidad Irapuato Depto. de Ingeniería Genética Departamento de Ingeniería Genética Ariel Alvarez Martin Heil Rafael Rivera José Ruiz Laura Silva Interacción planta – patógeno y relaciones mutualistas 6/2/2016 Biocinves 09

4 Bacteriología molecular Modelo: Pseudomonas syringae pv. phaseolicola, causante del “Tizón de halo del frijol” Ariel Alvarez aalvarez@ira.cinvestav.mx Biología molecular de la interacción Planta-Bacteria genes de patogenicidad señalización en la síntesis de faseoltoxina y otros metabolitos secundarios Biología molecular de la síntesis de fitotoxinas regulación de los genes que hemos identificado implicados en la síntesis de la faseolotoxina argK A B C D E F G H desI J K L M N O P amtA Q S T U V phtA PAPA phtL PLPL phtM PMPM argK PKPK phtD P

5 Modelos: Ustilago maydis Yarrowia lipolitica Candida albicans Estructura y síntesis de la pared de los hongos (quitina, glucana sintasas). Bases moleculares de la diferenciación y morfogénesis de los hongos. Función del metabolismo de las poliaminas en la diferenciación fúngica. José Ruiz Herrera jruiz@ira.cinvestav.mx Desarrollo y diferenciación de hongos

6 Resistencia activada contra plagas naturales Comunicación entre plantas por volátiles Resistencia contra bacterias fitopatógenas Planta expuesta a volátiles Martin Heil mheil@ira.cinvestav.mx Planta control Resistencia inducida de Frijol

7 Análisis del transcriptoma de planta infectada por pirosecuenciación Estudio de recuperación a la infección Silenciamiento mediado por RNA recuperado síntomas PepGMV + PHYVV PHYVV PepGMV Sinergismo entre geminivirus Virología Vegetal Rafael Rivera rrivera@ira.cinvestav.mx Localización de geminivirus por hibridación in situ Caracterización de plantas resistentes Susceptible Resistente Modelo: los geminivirus

8 Laura Silva lsilva@ira.cinvestav.mx Distribución, diversidad y evolución de algunos potyvirus de importancia agrícola en México Interacción de proteínas virales con proteínas del hospedante Virus en la nanotecnología Interacciones Planta -Virus Modelos: los potyvirus

9 CINVESTAV Unidad Irapuato Depto. de Ingeniería Genética Raúl Alvarez Plinio Guzmán Gertrud Lund June Simpson Estudios Genéticos y Epigenéticos 6/2/2016 Biocinves 09 Departamento de Ingeniería Genética

10 Raúl Alvarez ralvarez@ira.cinvestav.mx Estructura y función de la cromatina Mecanismos epigenéticos de la expresión génica Estructura y función de genes de la familia Trithorax Dinámica de su expresión génica en relación a modificaciones post- transcripcionales RNA de interferencia Filogenética y evolución. Cromatina y Epigenética

11 Regulación por la interacción entre PABPs y CIDs Arabidopsis thaliana 8 PABPs13 CIDs CIDs ? Análisis funcional de ubiquitin-ligasas Regulación postranscripcional en plantas Plinio Guzmán pguzman@ira.cinvestav.mx Ubiquitin-ligase target E2 Ub proteasom e D-Ubs ? 81 ATLs

12 Identificar ”hot spots” epigenéticos en el genoma de maíz (i.e. cambios en la metilación): en plantas genéticamente idénticas bajo condiciones normales y de estrés El papel de la nutrición temprana en el desarrollo de enfermedades cardiovasculares. Efectos de los ácidos grasos en la diéta sobre patrones de metilación en la sangre de bebes, ratones y cultivos celulares humanos Gertrud Lund glund@ira.cinvestav.mx Epigenética

13 Análisis genético molecular en Agave Análisis de genes involucrados en la acumulación de fructanos en la piña Análisis de diversidad en poblaciones de Agave utilizando marcadores moleculares Análisis del transcriptoma de Agave para identificar y caracterizar genes involucrados en la floración y cambios en desarrollo Regeneración in vitro y transformación June Simpson jsimpson@ira.cinvestav.mx

14 CINVESTAV Unidad Irapuato Depto. de Ingeniería Genética Neftalí Ochoa Alba Jofre Miguel Gómez Biotecnología, Cultivo de Tejidos y Transformación Genética 6/2/2016 Biocinves 09 Departamento de Ingeniería Genética

15 Cultivo de Tejidos y Transformación Genética de Plantas Micropropagación de fresa a partir de meristemos: mejoramiento genético (INIFAP) Regeneración y transformación genética de fresa y de maíz (núcleo y cloroplasto) Vectores de transformación genética de cloroplasto Genes de interés: Fresa: tolerancia a hongos y a herbicidas Maíz: tolerancia a Lepidópteros y herbicidas Bioseguridad en las liberaciones de OGMs Alba Jofre ajofre@ira.cinvestav.mx

16 Mejoramiento de plátano, aguacate y melón por biotecnología para aumentar calidad del fruto y conferir resistencia a plagas C2H4C2H4 ACC sintasa ACC oxidasa Metionina Producción de compuestos biofarmacéuticos en plantas (jitomate, tabaco, zanahoria): antígenos de Rotavirus, Rabia, Virus del papiloma, hepatitis B,C,E, cólera, Virus del Newcastle, Influenza aviar Planta resistente a hongosPlanta Sensible Partículas tipo virus de Herpes producidas en plantas Miguel Gómez mgomez@ira.cinvestav.mx Plantas Tropicales y Salud Humana

17 CINVESTAV Unidad Irapuato Depto. de Ingeniería Genética Edmundo Lozoya Magdalena Segura Axel Tiessen Metabolómica y Proteómica 6/2/2016 Biocinves 09 Departamento de Ingeniería Genética

18 Caracterización molecular de la biosíntesis de sustancias de defensa de plantas ante el ataque de patógenos Caracterización molecular de las sustancias farmacológicamente activas de plantas medicinales mexicanas Producción de etanol a partir de residuos agroindustriales. Producción de aceite a partir de algas. Producción de nutracéuticos derivados de la fresa Bioquímica y Biología Molecular de Productos Naturales de Plantas Edmundo Lozoya elozoya@ira.cinvestav.mx

19 Proteínas de semillas y Citoesqueleto Detección de marcadores moleculares relacionados con la calidad nutricional de los granos de los maíces criollos y de variedades comerciales Péptidos bioactivos de amaranto contra hongos fitopatógenos Magdalena Segura msegura@ira.cinvestav.mx Expresión diferencial de los genes de actina en tejidos reproductivos y durante la formación del grano de maíz Péptidos bioactivos de Amaranto vs hongos fitopatógenos P 1 P 2 P 3 2 5 10  g Controles

20 Metabolómica y Fisiología Molecular de Plantas Metodologias innovadoras de mejoramiento genético. Calidad nutricional del maíz. Tolerancia a sequía. Regulación del metabolismo primario. Señalización por azucares. Distribución del carbono en tejidos fuente- demanda. Interconversiones sacarosa-almidón Ingeniería metabólica. Optimización de la fotosíntesis. Biomasa y biorefinación. Lignocelulosa. Axel Tiessen atiessen@ira.cinvestav.mx

21 CINVESTAV Unidad Irapuato Depto. de Ingeniería Genética Agustino Martínez Gabriela Olmedo Genómica y Biología Sintética 6/2/2016 Biocinves 09 Departamento de Ingeniería Genética

22 Biología Teórica Análisis estructural y funcional de la red de regulación transcripcional en bacterias modelo (E. coli, B. subtilis y P. aeruginosa) Evolución molecular de genomas de enterobacterias Genómica experimental (E. coli) Análisis dinámico de las estructuras topólogicas (cascadas, switches, circuitos) en la red de regulación entre factores de transcripción Biología Sintética Rediseñar y ensamblar un genoma de E. coli que contenga los genes de Buchnera (endosimbionte estricto) y habilitación a vida libre Estudio de un sistema genético mínimo replicativo en micelas sintéticas 320 genes Biosistemas Agustino Martínez amartinez@ira.cinvestav.mx http://ingenbiosistemas.wordpress.com

23 Genómica bacteriana Gabriela Olmedo golmedo@ira.cinvestav.mx Estudio evolutivo y genómico de bacterias de ”Cuatro Ciénegas”, Coahuila: adaptaciones evolutivas de estas bacterias a condiciones nutricionales extremas. Estudio de proteínas involucradas en el metabolismo de RNA. Análisis evolutivo de las RNA helicasas en Firmicutes

24 3 de junio 2009 Biocinves 09 CINVESTAV Unidad Irapuato Departamento de Ingeniería Genética