Incidencia de tumores melanóticos Sección 4

Objetivos Estudiaremos la incidencia de tumores melanóticos en dos cepas de Drosophila melanogaster criadas a diferentes temperaturas. Recoger y analizar datos de cuatro grupos de moscas (Cepas Oregon R. y tu (1) S2 ts) tratadas a dos temperaturas (22 y 29 ºC); Y también se estudiará la incidencia de tumores en hembras vs. Machos. Establecer Hipótesis nula (Ho) Comprobar la Ho mediante el uso de la prueba estadística Chi2 de contingencia. Basado en los resultados, determinar si los grupos comparados son diferentes o no.

tu (1) S2 ts La cepa tu (1) S2 ts posee una mutación ligada al sexo recesiva Exhibe penetrancia incompleta y expresión variable. Expresión fenotípica es condicional a temp. altas El fenotipo mutante es la presencia de tumores en el abdomen, tórax y rara veces en las patas y la cabeza Estos se forman en la etapa larval y son agregados de células sanguíneas alrededor del cuerpo graso caudal anormal que luego se melanizan ( inertes en el adulto). Expresion variable: Cuando un fenotipo se expresa a diferentes grados en los individuos del mismo genotipo, en los tumores se puede expresar en diferentes areas y en cantidades. Penetrancia incompleta: que tienen el genotipo pero no lo expresa, algunos la expresan y otros no. A que se debe el que la mutacion te afecte o no? En este casi el genotipo siempre esta pero el fenotipo no. Dentro de los mutantes de (tu) a 29 grados, unos tienen tumores y otros no. Expresion variable, del grupo de los que tienen tumores, algunos tienen mas que otros. Otra cosa, Esta es una mutación condicional. La expresión del fenotipo solo se da bajo algunas condiciones particulares. Estos tumores son formados por respuesta inmune, y el tumor es melanización. Parece que el sistema inmune detecta la mutación al parecer como heridas y activa el sistema inmune, ahi en esos tumores tambien hay macrofagos, en resument una mezcla de celulas del sistema inmune. Esto no es un cancer. Esto es un proceso como el astma.

¿Cómo se ven? Que es definicion de benigno y maligno.

Hipótesis Nula El primero paso en una prueba estadística de significancia es establecer una hipótesis que se tratará de refutar o anular con evidencia. La afirmación o hipótesis que se questiona se conoce como hipótesis nula (Ho). La prueba de significancia esta diseñada para evaluar la fortaleza de la evidencia en contra de la Ho, usualmente la Ho establece «no existe efecto» o «no existe diferencia».  David, S.& George P.  (2003)Introduction to the Practice of Statistics. McCabe Moore.4th,Fourth Edition 

Chi2 de Contingencia La prueba de contingencia nos permite comparar los resultados de dos experimentos 22C 29C Cantidad con tumores Cantidad sin tumores

Mientras que Chi-cuadrado de ajuste de bondad es para verificar si hay diferencia significativa o no entre unos valores teóricos y los datos obtenidos. Chi-cuadrada de contingencia para verificar si hay diferencias significativas o no entre dos grupos independientes. chi-cuadrado de ajuste de bondad VS. chi-Cuadrado de contingencia

Dividir Moscas A B C D Hembras Machos # con tumores # sin tumores

22° C 29° C Cepa Sexo % moscas con tumor % moscas sin tumor Total OR machos hembras Ts

22° C 29° C OR machos D 172 A 49 189 hembras 1 221 10 183 Ts B 180 C Cepa Sexo # moscas con tumor # moscas sin tumor Total OR machos D 172 A 49 189 hembras 1 221 10 183 Ts B 180 C 253 31 89 147 171 29

Efecto de la temperatura en las hembras del genotipo Ts. V independiente (Temperatura) # moscas con tumores # de moscas sin tumores Total 22 a=89 b=147 a+b=236 29 c=171 d=29 c+d=200 a+c=260 b+d=176 N=436 Chi 2 de contingencia ( |(89)(29) – (147) (171)| - ½ (436))2 436 (236)(260)(200)(176) ( |2581 – 25137| - 218)2 436 2,159,872,000 Chi^2= 100.7

¿Cómo se obtienen los grados de libertad? V independiente (Temperatura) # moscas con tumores # de moscas sin tumores Total 22 a= 0 b=80 a+b=80 29 c= 76 d=11 c+d=87 a+c=76 b+d=91 N=167 Grado de libertad es: (# de filas-1)*(# de columnas-1) 2-1= 1 1x1=1 Grados de libertad

Efecto de la temperatura en las hembras del genotipo Control V independiente (Temperatura) # moscas con tumores # de moscas sin tumores Total 22 a= 0 b=80 a+b=80 29 c= 0 d=80 c+d=80 a+c=0 b+d=160 N=160 ( |(80)(0) – (80) (0)| - ½ (160))2 160 (80)(0)(80)(160) Chi 2 de contingencia ( 6,400) (160) ¡¡Indefinido!!

Efecto de la temperatura en las hembras del genotipo Control V independiente (Temperatura) # moscas con tumores # de moscas sin tumores Total 22 A= 1 B=81 A+B=81 29 C= 1 D=81 C+D=81 A+C=1 B+D=161 N=161 ( |(81)(1) – (81) (1)| - ½ (162))2 162 (81)(1)(81)(162) Chi 2 de contingencia 1062882= 1 1062882

Tabla de Probabilidades

Tabla

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¿Ideas? Si estos tumores reflejan una respuesta inmune y esta respuesta es conservada en humanos, como podríamos utilizar este modelo para entender el sistema inmune de lo humanos. ¿Que experimentos harías? Estudiar drogas, como se forma el cancer de la piel melanomas, http://es.treknature.com/gallery/Europe/Switzerland/photo86532.htm