EXPRESION GENICA EN PLANTAS La cromatina y su estructura El nucleosoma Estructura y función Compactación de la cromatina Las histonas y su código Estructura de un gen en plantas Mecanismo general de transcripción Elementos en cis y trans Procesos de regulación transcripcional Silenciamiento génico: RNAi y otros
ESTRUCTURA DEL NUCLEOSOMA
Interacción entre las histonas y el DNA en el nucleosoma
La cromatina está unida a la estructura nuclear
Las histonas pueden sufrir modificaciones
Los genes de las histonas están muy conservados Modificaciones de las histonas H3 y H4, en residuos específicos de su extremo amino terminal
La modificación de las histonas requiere de maquinarias específicas formados por complejos de proteinas. Las mutaciones de éstas se manifiestan en alteraciones de la expresión de genes
La alteración de las histonas modifica la estructura nucleosomal, y su accesibilidad a distintos factores
Estructura de un gen tipo de plantas
Secuencias en cis encontradas en distintos genes
La maquinaria transcripcional: La RNA polimerasa II
Distintos factores trasncripcionales encontrados en plantas
Inicio de la transcripción
La unión de un factor transcripcional requiere a veces una reubicación de los nucleosomas de la región de unión
Método para estudiar la expresión de un gen
Elementos de regulación transcripcional El silenciamiento génico Los RNA reguladores
La metilación del DNA en las bases de citosina permiten un silenciamiento persistente de grandes regiones genómicas
La disminución de la actividad MET1, una metiltransferasa provoca un cambio pleiotrópico en Arabidopsis
En petunia, se han descrito fenomenos de cosupresión de la expresión del gen CHS, provocando distintos fenotipos de coloración de los petalos de las flores
Caracteristicas de los pequeños RNAs
FUNCIONAMIENTO DEL miRNA
Tipos de miRNAs
Familia miRNA en plantas
Expresión de miRNAs
Funcionamiento de los pequeños RNA para silenciar The Actions of Small Silencing RNAs.(A) mRNA cleavage specified by a miRNA or siRNA. Black arrowhead indicates site of cleavage.(B) Translational repression specified by miRNAs or siRNAs.(C) Transcriptional silencing, thought to be specified by heterochromatic siRNAs. Funcionamiento de los pequeños RNA para silenciar
Procesamiento de los precursores de miRNA y dsRNA
Comparación del sistema en animales y plantas de la actuación de los miRNA y de los siRNA
S. Pombe Silenciamiento en S. Pombe (a) y rn Arabidopsis (b) Arabidopsis
siRNA funcionamiento en eucariotas
Biogenesis de miRNAs y siRNAs
Silenciamiento en C. elegans
Papel de RDR en la iniciación y amplificación del silencing
Mutaciones que afectan al silenciamiento RDR RNA-dependent RNA polymerase
Mecanismo de control de los siRNA y miRNA
Alteración del desarrollo en plantas por miRNA
El gen AP2 está regulado por un miRNA
Fenotipo del mutante en el miRNA de ap2