EN DIFERENTES AREAS COMO POR EJEMPLO: INVESTIGACIÓN: la clonación de secuencias de ADN en vectores, como pueden ser los plásmidos.

MEDICINA: Permite el genotipar la especie o especies que provocan un determinado cuadro infeccioso. La PCR también se puede usar en revisiones médicas rutinarias, como en los servicios de donantes de sangre, para test de rutina. A través de esta técnica se pueden detectar infecciones peligrosas en el donante (como VIH o Hepatitis B) mientras aún están en el periodo de incubación. El diagnóstico de enfermedades hereditarias presentes en el genoma es un proceso largo y complicado que puede acortarse significativamente gracias a la PCR.

PALEONTOLOGÍA, ANTROPOLOGÍA BIOLÓGICA, CIENCIAS FORENSES. En paleontología y Antropología la PCR permite recuperar las escasas cantidades de ADN que aún no se han degradado. En las ciencias forenses se emplea para establecer la filiación de una persona o para obtener pruebas a partir de muestras mínimas dejadas por el autor de un crimen como saliva, semen u otros restos de tejidos.

AGRONOMÍA Y DIVERSIDAD se emplean oligonucleótidos de un tamaño lo suficientemente pequeño como para que ceben de forma relativamente inespecífica, aunque siempre de tal forma que produzcan un patrón de bandas discreto e interpretable. De este modo, la pauta obtenida tras la electroforesis de los fragmentos tiende a agrupar a los individuos de mayor semejanza, que poseen un comportamiento similar, de los que divergen...

En Arqueología. En Inmunología, determina relaciones entre HLA y la predisposición a enfermedades autoinmunes. En Microbiología, en el diagnóstico rápido y altamente específico de infecciones. En la biotecnología animal y vegetal para el mejoramiento de plantas y animales. En el genoma humano para la identificación de nuevos genes, sus secuencias y mutaciones. En el estudio de la evolución: árboles filogenéticos y análisis de especies en vías de extinción. En Oncología para detectar secuencias oncogénicas. En Genética médica para el diagnóstico de enfermedades En el estudio de los ARN mensajeros generados por la expresión génica. En biología molecular, ingeniería genética y biotecnología APLICACIONES En Medicina Legal, la PCR ha enriquecido el análisis de las pruebas de paternidad y la identificación de individuos.